RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426683.5

HERC3-205, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 4

Gene HERC3, Length 559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-205ENST00000426683 APAF1O14727 1248 aa23.68■■□□□ 1.38
HERC3-205ENST00000426683 TRIM35Q9UPQ4 493 aa23.68■■□□□ 1.38
HERC3-205ENST00000426683 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa23.68■■□□□ 1.38
HERC3-205ENST00000426683 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
HERC3-205ENST00000426683 RFC4P35249 363 aa23.67■■□□□ 1.38
HERC3-205ENST00000426683 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
HERC3-205ENST00000426683 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
HERC3-205ENST00000426683 COL24A1Q17RW2 1714 aa23.65■■□□□ 1.38
HERC3-205ENST00000426683 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa23.65■■□□□ 1.38
HERC3-205ENST00000426683 CANXP27824 592 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
HERC3-205ENST00000426683 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
HERC3-205ENST00000426683 TSPYL4Q9UJ04 414 aa23.64■■□□□ 1.37
HERC3-205ENST00000426683 USP16Q9Y5T5 823 aa23.64■■□□□ 1.37
HERC3-205ENST00000426683 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
HERC3-205ENST00000426683 KDM3BQ7LBC6 1761 aa23.62■■□□□ 1.37
HERC3-205ENST00000426683 A1BGP04217 495 aa23.61■■□□□ 1.37
HERC3-205ENST00000426683 GYS1P13807 737 aa23.61■■□□□ 1.37
HERC3-205ENST00000426683 KLHL34Q8N239 644 aa23.61■■□□□ 1.37
HERC3-205ENST00000426683 BABAM1Q9NWV8 329 aa23.61■■□□□ 1.37
HERC3-205ENST00000426683 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
HERC3-205ENST00000426683 COL15A1P39059 1388 aa23.61■■□□□ 1.37
HERC3-205ENST00000426683 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
HERC3-205ENST00000426683 NLGN1Q8N2Q7 840 aa23.6■■□□□ 1.37
HERC3-205ENST00000426683 SYT17Q9BSW7 474 aa23.6■■□□□ 1.37
HERC3-205ENST00000426683 EIF5P55010 431 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
HERC3-205ENST00000426683 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
HERC3-205ENST00000426683 C4AP0C0L4 1744 aa23.59■■□□□ 1.37
HERC3-205ENST00000426683 ZPR1O75312 459 aa23.58■■□□□ 1.37
HERC3-205ENST00000426683 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
HERC3-205ENST00000426683 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
HERC3-205ENST00000426683 FAM9BQ8IZU0 186 aa23.58■■□□□ 1.37
HERC3-205ENST00000426683 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
HERC3-205ENST00000426683 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa23.57■■□□□ 1.36
HERC3-205ENST00000426683 MMP10P09238 476 aa23.57■■□□□ 1.36
HERC3-205ENST00000426683 USPL1Q5W0Q7 1092 aa23.57■■□□□ 1.36
HERC3-205ENST00000426683 NARFQ9UHQ1 456 aa23.57■■□□□ 1.36
HERC3-205ENST00000426683 A0A087WZG4 1122 aa23.56■■□□□ 1.36
HERC3-205ENST00000426683 CHL1O00533 1208 aa23.56■■□□□ 1.36
HERC3-205ENST00000426683 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
HERC3-205ENST00000426683 FKBP8Q14318 412 aa23.55■■□□□ 1.36
HERC3-205ENST00000426683 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
HERC3-205ENST00000426683 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
HERC3-205ENST00000426683 CFAP44Q96MT7 982 aa23.53■■□□□ 1.36
HERC3-205ENST00000426683 NBPF26B4DH59 902 aa23.52■■□□□ 1.36
HERC3-205ENST00000426683 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
HERC3-205ENST00000426683 NBPF15Q8N660 670 aa23.52■■□□□ 1.36
HERC3-205ENST00000426683 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa23.52■■□□□ 1.36
HERC3-205ENST00000426683 BCL2L12Q9HB09 334 aa23.51■■□□□ 1.35
HERC3-205ENST00000426683 PARP3Q9Y6F1 533 aa23.51■■□□□ 1.35
HERC3-205ENST00000426683 LAMB4A4D0S4 1761 aa23.5■■□□□ 1.35
HERC3-205ENST00000426683 CCDC27Q2M243 656 aa23.5■■□□□ 1.35
HERC3-205ENST00000426683 NLGN2Q8NFZ4 835 aa23.5■■□□□ 1.35
HERC3-205ENST00000426683 IFT57Q9NWB7 429 aa23.5■■□□□ 1.35
HERC3-205ENST00000426683 ZNF853P0CG23 659 aa23.49■■□□□ 1.35
HERC3-205ENST00000426683 GNAI1P63096 354 aa23.49■■□□□ 1.35
HERC3-205ENST00000426683 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
HERC3-205ENST00000426683 MBIPQ9NS73 344 aa23.49■■□□□ 1.35
HERC3-205ENST00000426683 CD2APQ9Y5K6 639 aa23.49■■□□□ 1.35
HERC3-205ENST00000426683 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
HERC3-205ENST00000426683 TM4SF1P30408 202 aa23.48■■□□□ 1.35
HERC3-205ENST00000426683 DDR1Q08345 913 aa23.48■■□□□ 1.35
HERC3-205ENST00000426683 KRT24Q2M2I5 525 aa23.48■■□□□ 1.35
HERC3-205ENST00000426683 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
HERC3-205ENST00000426683 WWC1Q8IX03 1113 aa23.48■■□□□ 1.35
HERC3-205ENST00000426683 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
HERC3-205ENST00000426683 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
HERC3-205ENST00000426683 CCER2I3L3R5 266 aa23.46■■□□□ 1.35
HERC3-205ENST00000426683 CAMTA2O94983 1202 aa23.46■■□□□ 1.35
HERC3-205ENST00000426683 NFIXQ14938 502 aa23.46■■□□□ 1.35
HERC3-205ENST00000426683 ERBB4Q15303 1308 aa23.45■■□□□ 1.34
HERC3-205ENST00000426683 DCAF8L1A6NGE4 600 aa23.45■■□□□ 1.34
HERC3-205ENST00000426683 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
HERC3-205ENST00000426683 MYL6BP14649 208 aa23.45■■□□□ 1.34
HERC3-205ENST00000426683 NGEFQ8N5V2 710 aa23.45■■□□□ 1.34
HERC3-205ENST00000426683 BICDL1Q6ZP65 573 aa23.44■■□□□ 1.34
HERC3-205ENST00000426683 TBC1D9BQ66K14 1250 aa23.43■■□□□ 1.34
HERC3-205ENST00000426683 NECTIN2Q92692 538 aa23.43■■□□□ 1.34
HERC3-205ENST00000426683 SCN7AQ01118 1682 aa23.43■■□□□ 1.34
HERC3-205ENST00000426683 C10orf71Q711Q0 1435 aa23.42■■□□□ 1.34
HERC3-205ENST00000426683 HOXB7P09629 217 aa23.41■■□□□ 1.34
HERC3-205ENST00000426683 PDIA6Q15084 440 aa23.41■■□□□ 1.34
HERC3-205ENST00000426683 DUSP27Q5VZP5 1158 aa23.41■■□□□ 1.34
HERC3-205ENST00000426683 SERPINB2P05120 415 aa23.4■■□□□ 1.34
HERC3-205ENST00000426683 ZNF652Q9Y2D9 606 aa23.4■■□□□ 1.34
HERC3-205ENST00000426683 IL16Q14005 1332 aa23.39■■□□□ 1.34
HERC3-205ENST00000426683 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa23.39■■□□□ 1.33
HERC3-205ENST00000426683 TTLL7Q6ZT98 887 aa23.39■■□□□ 1.33
HERC3-205ENST00000426683 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
HERC3-205ENST00000426683 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
HERC3-205ENST00000426683 ANXA1P04083 346 aa23.38■■□□□ 1.33
HERC3-205ENST00000426683 GPR162Q16538 588 aa23.38■■□□□ 1.33
HERC3-205ENST00000426683 PROSER3Q2NL68 480 aa23.38■■□□□ 1.33
HERC3-205ENST00000426683 CLEC4GQ6UXB4 293 aa23.38■■□□□ 1.33
HERC3-205ENST00000426683 KIF6Q6ZMV9 814 aa23.38■■□□□ 1.33
HERC3-205ENST00000426683 WDR63Q8IWG1 891 aa23.38■■□□□ 1.33
HERC3-205ENST00000426683 BCORQ6W2J9 1755 aa23.37■■□□□ 1.33
HERC3-205ENST00000426683 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
HERC3-205ENST00000426683 TGFB2P61812 414 aa23.37■■□□□ 1.33
HERC3-205ENST00000426683 LRP10Q7Z4F1 713 aa23.37■■□□□ 1.33
HERC3-205ENST00000426683 MIER1Q8N108 512 aa23.37■■□□□ 1.33
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