RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 AACSQ86V21 672 aa12.9□□□□□ -0.34
EFTUD2-202ENST00000426333 KLHL34Q8N239 644 aa12.9□□□□□ -0.34
EFTUD2-202ENST00000426333 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa12.9□□□□□ -0.34
EFTUD2-202ENST00000426333 EIF5P55010 431 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
EFTUD2-202ENST00000426333 SYNMO15061 1565 aa12.89□□□□□ -0.35
EFTUD2-202ENST00000426333 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP12.89□□□□□ -0.35
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM193AP78312 1265 aa12.89□□□□□ -0.35
EFTUD2-202ENST00000426333 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP12.89□□□□□ -0.35
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC57Q2TAC2 916 aa12.89□□□□□ -0.35
EFTUD2-202ENST00000426333 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
EFTUD2-202ENST00000426333 MPHOSPH8Q99549 860 aa12.89□□□□□ -0.35
EFTUD2-202ENST00000426333 UBAC1Q9BSL1 405 aa12.89□□□□□ -0.35
EFTUD2-202ENST00000426333 GBP3Q9H0R5 595 aa12.89□□□□□ -0.35
EFTUD2-202ENST00000426333 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
EFTUD2-202ENST00000426333 PRAM1Q96QH2 718 aa12.89□□□□□ -0.35
EFTUD2-202ENST00000426333 CRACR2AQ9BSW2 395 aa12.89□□□□□ -0.35
EFTUD2-202ENST00000426333 TMCO3Q6UWJ1 677 aa12.89□□□□□ -0.35
EFTUD2-202ENST00000426333 FERMT3Q86UX7 667 aa12.89□□□□□ -0.35
EFTUD2-202ENST00000426333 PRAG1Q86YV5 1406 aa12.89□□□□□ -0.35
EFTUD2-202ENST00000426333 SYCE3A1L190 88 aa12.88□□□□□ -0.35
EFTUD2-202ENST00000426333 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
EFTUD2-202ENST00000426333 TAF4BQ92750 862 aa12.88□□□□□ -0.35
EFTUD2-202ENST00000426333 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
EFTUD2-202ENST00000426333 KIAA1328Q86T90 577 aa12.87□□□□□ -0.35
EFTUD2-202ENST00000426333 PTPN14Q15678 1187 aa12.87□□□□□ -0.35
EFTUD2-202ENST00000426333 TAF3Q5VWG9 929 aa12.87□□□□□ -0.35
EFTUD2-202ENST00000426333 TDO2P48775 406 aa12.87□□□□□ -0.35
EFTUD2-202ENST00000426333 INCENPQ9NQS7 918 aa12.87□□□□□ -0.35
EFTUD2-202ENST00000426333 ESCO1Q5FWF5 840 aa12.87□□□□□ -0.35
EFTUD2-202ENST00000426333 DDX11Q96FC9 970 aa12.86□□□□□ -0.35
EFTUD2-202ENST00000426333 NPATQ14207 1427 aa12.86□□□□□ -0.35
EFTUD2-202ENST00000426333 ERICH4A6NGS2 130 aa12.86□□□□□ -0.35
EFTUD2-202ENST00000426333 WASF1Q92558 559 aa12.86□□□□□ -0.35
EFTUD2-202ENST00000426333 IQGAP1P46940 1657 aa12.86□□□□□ -0.35
EFTUD2-202ENST00000426333 KIF18AQ8NI77 898 aa12.86□□□□□ -0.35
EFTUD2-202ENST00000426333 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
EFTUD2-202ENST00000426333 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
EFTUD2-202ENST00000426333 CABP1Q9NZU7 370 aa12.86□□□□□ -0.35
EFTUD2-202ENST00000426333 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
EFTUD2-202ENST00000426333 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
EFTUD2-202ENST00000426333 TXNDC2Q86VQ3 553 aa12.85□□□□□ -0.35
EFTUD2-202ENST00000426333 PPLO60437 1756 aa12.85□□□□□ -0.35
EFTUD2-202ENST00000426333 CABP4P57796 275 aa12.85□□□□□ -0.35
EFTUD2-202ENST00000426333 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa12.85□□□□□ -0.35
EFTUD2-202ENST00000426333 ADGRB3O60242 1522 aa12.85□□□□□ -0.35
EFTUD2-202ENST00000426333 MYO5BQ9ULV0 1848 aa12.84□□□□□ -0.35
EFTUD2-202ENST00000426333 ZSCAN12O43309 604 aa12.84□□□□□ -0.35
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM69CQ0P6D2 419 aa12.84□□□□□ -0.35
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC148Q8NFR7 591 aa12.84□□□□□ -0.35
EFTUD2-202ENST00000426333 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
EFTUD2-202ENST00000426333 CASTP20810 708 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
EFTUD2-202ENST00000426333 KIF1BO60333 1816 aa12.84□□□□□ -0.35
EFTUD2-202ENST00000426333 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
EFTUD2-202ENST00000426333 MYL6BP14649 208 aa12.84□□□□□ -0.35
EFTUD2-202ENST00000426333 ANO10Q9NW15 660 aa12.84□□□□□ -0.35
EFTUD2-202ENST00000426333 FCHSD2O94868 740 aa12.83□□□□□ -0.35
EFTUD2-202ENST00000426333 NRXN1Q9ULB1 1477 aa12.83□□□□□ -0.36
EFTUD2-202ENST00000426333 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
EFTUD2-202ENST00000426333 TMEM57Q8N5G2 664 aa12.83□□□□□ -0.36
EFTUD2-202ENST00000426333 STRN4Q9NRL3 753 aa12.83□□□□□ -0.36
EFTUD2-202ENST00000426333 URI1O94763 535 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
EFTUD2-202ENST00000426333 KIF1BPQ96EK5 621 aa12.83□□□□□ -0.36
EFTUD2-202ENST00000426333 IDH1O75874 414 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
EFTUD2-202ENST00000426333 CETN2P41208 172 aa12.83□□□□□ -0.36
EFTUD2-202ENST00000426333 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa12.83□□□□□ -0.36
EFTUD2-202ENST00000426333 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
EFTUD2-202ENST00000426333 CEP131Q9UPN4 1083 aa12.83□□□□□ -0.36
EFTUD2-202ENST00000426333 PREX1Q8TCU6 1659 aa12.82□□□□□ -0.36
EFTUD2-202ENST00000426333 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa12.82□□□□□ -0.36
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP12.82□□□□□ -0.36
EFTUD2-202ENST00000426333 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP12.82□□□□□ -0.36
EFTUD2-202ENST00000426333 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa12.82□□□□□ -0.36
EFTUD2-202ENST00000426333 CAMK4Q16566 473 aa12.82□□□□□ -0.36
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC83Q8IWF9 413 aa12.82□□□□□ -0.36
EFTUD2-202ENST00000426333 LRP2BPQ9P2M1 347 aa12.82□□□□□ -0.36
EFTUD2-202ENST00000426333 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa12.82□□□□□ -0.36
EFTUD2-202ENST00000426333 SPA17Q15506 151 aa12.82□□□□□ -0.36
EFTUD2-202ENST00000426333 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP12.82□□□□□ -0.36
EFTUD2-202ENST00000426333 CDK19Q9BWU1 502 aa12.82□□□□□ -0.36
EFTUD2-202ENST00000426333 MAP9Q49MG5 647 aa12.81□□□□□ -0.36
EFTUD2-202ENST00000426333 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
EFTUD2-202ENST00000426333 NOS1P29475 1434 aa12.81□□□□□ -0.36
EFTUD2-202ENST00000426333 SHTN1A0MZ66 631 aa12.81□□□□□ -0.36
EFTUD2-202ENST00000426333 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP12.81□□□□□ -0.36
EFTUD2-202ENST00000426333 SLFN5Q08AF3 891 aa12.81□□□□□ -0.36
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC183Q5T5S1 534 aa12.81□□□□□ -0.36
EFTUD2-202ENST00000426333 RAI14Q9P0K7 980 aa12.81□□□□□ -0.36
EFTUD2-202ENST00000426333 SPG7Q9UQ90 795 aa12.81□□□□□ -0.36
EFTUD2-202ENST00000426333 KIF5CO60282 957 aa12.81□□□□□ -0.36
EFTUD2-202ENST00000426333 DESP17661 470 aa12.81□□□□□ -0.36
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC184Q52MB2 194 aa12.81□□□□□ -0.36
EFTUD2-202ENST00000426333 AGLP35573 1532 aa12.81□□□□□ -0.36
EFTUD2-202ENST00000426333 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP12.81□□□□□ -0.36
EFTUD2-202ENST00000426333 MX1P20591 662 aa12.8□□□□□ -0.36
EFTUD2-202ENST00000426333 TMPOP42166 694 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
EFTUD2-202ENST00000426333 KLHL10Q6JEL2 608 aa12.8□□□□□ -0.36
EFTUD2-202ENST00000426333 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa12.8□□□□□ -0.36
EFTUD2-202ENST00000426333 DYDC1Q8WWB3 177 aa12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms