RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416021.5

SH3BP4-204, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 593 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-204ENST00000416021 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP27.76■■■□□ 2.03
SH3BP4-204ENST00000416021 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP27.76■■■□□ 2.03
SH3BP4-204ENST00000416021 GYS1P13807 737 aa27.76■■■□□ 2.03
SH3BP4-204ENST00000416021 USP16Q9Y5T5 823 aa27.76■■■□□ 2.03
SH3BP4-204ENST00000416021 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP27.75■■■□□ 2.03
SH3BP4-204ENST00000416021 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP27.75■■■□□ 2.03
SH3BP4-204ENST00000416021 TJP1Q07157 1748 aa27.74■■■□□ 2.03
SH3BP4-204ENST00000416021 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP27.73■■■□□ 2.03
SH3BP4-204ENST00000416021 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP27.73■■■□□ 2.03
SH3BP4-204ENST00000416021 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa27.73■■■□□ 2.03
SH3BP4-204ENST00000416021 A1BGP04217 495 aa27.73■■■□□ 2.03
SH3BP4-204ENST00000416021 DCAF8L1A6NGE4 600 aa27.72■■■□□ 2.03
SH3BP4-204ENST00000416021 ZPR1O75312 459 aa27.72■■■□□ 2.03
SH3BP4-204ENST00000416021 MMP10P09238 476 aa27.72■■■□□ 2.03
SH3BP4-204ENST00000416021 MRS2Q9HD23 443 aa27.72■■■□□ 2.03
SH3BP4-204ENST00000416021 TRIM35Q9UPQ4 493 aa27.72■■■□□ 2.03
SH3BP4-204ENST00000416021 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP27.71■■■□□ 2.03
SH3BP4-204ENST00000416021 EIF5P55010 431 aaKnown RBP27.71■■■□□ 2.03
SH3BP4-204ENST00000416021 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP27.7■■■□□ 2.03
SH3BP4-204ENST00000416021 COL24A1Q17RW2 1714 aa27.7■■■□□ 2.03
SH3BP4-204ENST00000416021 APAF1O14727 1248 aa27.7■■■□□ 2.02
SH3BP4-204ENST00000416021 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP27.7■■■□□ 2.02
SH3BP4-204ENST00000416021 USPL1Q5W0Q7 1092 aa27.7■■■□□ 2.02
SH3BP4-204ENST00000416021 UBR2Q8IWV8 1755 aa27.69■■■□□ 2.02
SH3BP4-204ENST00000416021 FKBP8Q14318 412 aa27.69■■■□□ 2.02
SH3BP4-204ENST00000416021 NARFQ9UHQ1 456 aa27.69■■■□□ 2.02
SH3BP4-204ENST00000416021 TSPYL4Q9UJ04 414 aa27.69■■■□□ 2.02
SH3BP4-204ENST00000416021 CD2APQ9Y5K6 639 aa27.69■■■□□ 2.02
SH3BP4-204ENST00000416021 A0A087WZG4 1122 aa27.68■■■□□ 2.02
SH3BP4-204ENST00000416021 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP27.68■■■□□ 2.02
SH3BP4-204ENST00000416021 BABAM1Q9NWV8 329 aa27.68■■■□□ 2.02
SH3BP4-204ENST00000416021 NLGN2Q8NFZ4 835 aa27.67■■■□□ 2.02
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP27.67■■■□□ 2.02
SH3BP4-204ENST00000416021 COL15A1P39059 1388 aa27.67■■■□□ 2.02
SH3BP4-204ENST00000416021 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP27.66■■■□□ 2.02
SH3BP4-204ENST00000416021 DLG5Q8TDM6 1919 aa27.65■■■□□ 2.02
SH3BP4-204ENST00000416021 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP27.65■■■□□ 2.02
SH3BP4-204ENST00000416021 PARP3Q9Y6F1 533 aa27.65■■■□□ 2.02
SH3BP4-204ENST00000416021 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP27.64■■■□□ 2.02
SH3BP4-204ENST00000416021 TM4SF1P30408 202 aa27.63■■■□□ 2.01
SH3BP4-204ENST00000416021 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa27.63■■■□□ 2.01
SH3BP4-204ENST00000416021 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP27.63■■■□□ 2.01
SH3BP4-204ENST00000416021 CHL1O00533 1208 aa27.62■■■□□ 2.01
SH3BP4-204ENST00000416021 BCL2L12Q9HB09 334 aa27.62■■■□□ 2.01
SH3BP4-204ENST00000416021 NBPF26B4DH59 902 aa27.6■■■□□ 2.01
SH3BP4-204ENST00000416021 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
SH3BP4-204ENST00000416021 NBPF15Q8N660 670 aa27.6■■■□□ 2.01
SH3BP4-204ENST00000416021 DDR1Q08345 913 aa27.58■■■□□ 2.01
SH3BP4-204ENST00000416021 NFIXQ14938 502 aa27.58■■■□□ 2.01
SH3BP4-204ENST00000416021 GPR162Q16538 588 aa27.58■■■□□ 2.01
SH3BP4-204ENST00000416021 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP27.57■■■□□ 2
SH3BP4-204ENST00000416021 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
SH3BP4-204ENST00000416021 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
SH3BP4-204ENST00000416021 CFAP44Q96MT7 982 aa27.56■■■□□ 2
SH3BP4-204ENST00000416021 CAMTA2O94983 1202 aa27.55■■■□□ 2
SH3BP4-204ENST00000416021 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa27.54■■■□□ 2
SH3BP4-204ENST00000416021 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP27.54■■■□□ 2
SH3BP4-204ENST00000416021 BICDL1Q6ZP65 573 aa27.54■■■□□ 2
SH3BP4-204ENST00000416021 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
SH3BP4-204ENST00000416021 TGFB2P61812 414 aa27.53■■■□□ 2
SH3BP4-204ENST00000416021 C4AP0C0L4 1744 aa27.53■■■□□ 2
SH3BP4-204ENST00000416021 TBC1D9BQ66K14 1250 aa27.52■■■□□ 2
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM9BQ8IZU0 186 aa27.52■■■□□ 2
SH3BP4-204ENST00000416021 NGEFQ8N5V2 710 aa27.52■■■□□ 2
SH3BP4-204ENST00000416021 SERPINB2P05120 415 aa27.51■■□□□ 1.99
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF853P0CG23 659 aa27.51■■□□□ 1.99
SH3BP4-204ENST00000416021 KDM3BQ7LBC6 1761 aa27.5■■□□□ 1.99
SH3BP4-204ENST00000416021 MYL6BP14649 208 aa27.5■■□□□ 1.99
SH3BP4-204ENST00000416021 KRT24Q2M2I5 525 aa27.5■■□□□ 1.99
SH3BP4-204ENST00000416021 IFT57Q9NWB7 429 aa27.5■■□□□ 1.99
SH3BP4-204ENST00000416021 A0A0G2JLW4 131 aa27.49■■□□□ 1.99
SH3BP4-204ENST00000416021 GNAI1P63096 354 aa27.49■■□□□ 1.99
SH3BP4-204ENST00000416021 CCDC27Q2M243 656 aa27.49■■□□□ 1.99
SH3BP4-204ENST00000416021 MBIPQ9NS73 344 aa27.49■■□□□ 1.99
SH3BP4-204ENST00000416021 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP27.48■■□□□ 1.997e-6■■■□□ 17.2
SH3BP4-204ENST00000416021 CLEC4GQ6UXB4 293 aa27.48■■□□□ 1.99
SH3BP4-204ENST00000416021 SETDB2Q96T68 719 aa27.48■■□□□ 1.99
SH3BP4-204ENST00000416021 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP27.47■■□□□ 1.99
SH3BP4-204ENST00000416021 WWC1Q8IX03 1113 aa27.47■■□□□ 1.99
SH3BP4-204ENST00000416021 ERBB4Q15303 1308 aa27.46■■□□□ 1.99
SH3BP4-204ENST00000416021 DPEP1P16444 411 aa27.46■■□□□ 1.99
SH3BP4-204ENST00000416021 PDIA6Q15084 440 aa27.46■■□□□ 1.99
SH3BP4-204ENST00000416021 NECTIN2Q92692 538 aa27.46■■□□□ 1.99
SH3BP4-204ENST00000416021 WWC3Q9ULE0 1092 aa27.46■■□□□ 1.99
SH3BP4-204ENST00000416021 C10orf71Q711Q0 1435 aa27.46■■□□□ 1.99
SH3BP4-204ENST00000416021 GRIN3BO60391 1043 aa27.45■■□□□ 1.98
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF652Q9Y2D9 606 aa27.45■■□□□ 1.98
SH3BP4-204ENST00000416021 HLFQ16534 295 aa27.44■■□□□ 1.98
SH3BP4-204ENST00000416021 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP27.44■■□□□ 1.98
SH3BP4-204ENST00000416021 RGL2O15211 777 aa27.43■■□□□ 1.98
SH3BP4-204ENST00000416021 DUSP27Q5VZP5 1158 aa27.43■■□□□ 1.98
SH3BP4-204ENST00000416021 TTLL7Q6ZT98 887 aa27.43■■□□□ 1.98
SH3BP4-204ENST00000416021 ERVV-1B6SEH8 477 aa27.42■■□□□ 1.98
SH3BP4-204ENST00000416021 KCNA3P22001 575 aa27.42■■□□□ 1.98
SH3BP4-204ENST00000416021 HOXB7P09629 217 aa27.41■■□□□ 1.98
SH3BP4-204ENST00000416021 PROSER3Q2NL68 480 aa27.41■■□□□ 1.98
SH3BP4-204ENST00000416021 KIF6Q6ZMV9 814 aa27.41■■□□□ 1.98
SH3BP4-204ENST00000416021 LRP10Q7Z4F1 713 aa27.41■■□□□ 1.98
SH3BP4-204ENST00000416021 PXDNLA1KZ92 1463 aa27.4■■□□□ 1.98
SH3BP4-204ENST00000416021 ANXA1P04083 346 aa27.4■■□□□ 1.98
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