RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415172.1

VPS13A-AS1-201, VPS13A antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS13A-AS1, Length 519 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TRIM35Q9UPQ4 493 aa22.77■■□□□ 1.24
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 UBR3Q6ZT12 1888 aa22.76■■□□□ 1.23
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 COL24A1Q17RW2 1714 aa22.76■■□□□ 1.23
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 POLD1P28340 1107 aa22.74■■□□□ 1.23
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 BABAM1Q9NWV8 329 aa22.74■■□□□ 1.23
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TSPYL4Q9UJ04 414 aa22.74■■□□□ 1.23
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa22.73■■□□□ 1.23
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RFC4P35249 363 aa22.72■■□□□ 1.23
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MSL1Q68DK7 614 aa22.72■■□□□ 1.23
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FAM9BQ8IZU0 186 aa22.72■■□□□ 1.23
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CHD4Q14839 1912 aa22.69■■□□□ 1.22
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KDM3BQ7LBC6 1761 aa22.69■■□□□ 1.22
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 COL15A1P39059 1388 aa22.69■■□□□ 1.22
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CANXP27824 592 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ARXQ96QS3 562 aa22.69■■□□□ 1.22
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa22.68■■□□□ 1.22
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 USP16Q9Y5T5 823 aa22.68■■□□□ 1.22
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CCER2I3L3R5 266 aa22.67■■□□□ 1.22
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CHL1O00533 1208 aa22.66■■□□□ 1.22
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CFAP44Q96MT7 982 aa22.66■■□□□ 1.22
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZPR1O75312 459 aa22.65■■□□□ 1.22
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 A1BGP04217 495 aa22.65■■□□□ 1.22
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CCDC27Q2M243 656 aa22.65■■□□□ 1.22
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NLGN1Q8N2Q7 840 aa22.65■■□□□ 1.22
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 A0A087WZG4 1122 aa22.64■■□□□ 1.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GYS1P13807 737 aa22.64■■□□□ 1.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 EIF5P55010 431 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa22.63■■□□□ 1.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 IFT57Q9NWB7 429 aa22.63■■□□□ 1.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GNAI1P63096 354 aa22.62■■□□□ 1.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NARFQ9UHQ1 456 aa22.62■■□□□ 1.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 C4AP0C0L4 1744 aa22.62■■□□□ 1.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 USPL1Q5W0Q7 1092 aa22.61■■□□□ 1.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MMP10P09238 476 aa22.6■■□□□ 1.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 WWC1Q8IX03 1113 aa22.6■■□□□ 1.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KLHL34Q8N239 644 aa22.6■■□□□ 1.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MBIPQ9NS73 344 aa22.6■■□□□ 1.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LAMB4A4D0S4 1761 aa22.6■■□□□ 1.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF853P0CG23 659 aa22.59■■□□□ 1.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NGEFQ8N5V2 710 aa22.59■■□□□ 1.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FKBP8Q14318 412 aa22.58■■□□□ 1.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NBPF26B4DH59 902 aa22.57■■□□□ 1.2
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NBPF15Q8N660 670 aa22.57■■□□□ 1.2
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa22.57■■□□□ 1.2
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ERBB4Q15303 1308 aa22.57■■□□□ 1.2
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HOXB7P09629 217 aa22.55■■□□□ 1.2
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KRT24Q2M2I5 525 aa22.55■■□□□ 1.2
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MIER1Q8N108 512 aa22.55■■□□□ 1.2
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PARP3Q9Y6F1 533 aa22.55■■□□□ 1.2
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 IL16Q14005 1332 aa22.55■■□□□ 1.2
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CAMTA2O94983 1202 aa22.52■■□□□ 1.2
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MYL6BP14649 208 aa22.52■■□□□ 1.2
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 WDR63Q8IWG1 891 aa22.52■■□□□ 1.2
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 BCL2L12Q9HB09 334 aa22.52■■□□□ 1.2
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CD2APQ9Y5K6 639 aa22.52■■□□□ 1.2
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa22.51■■□□□ 1.19
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DUSP27Q5VZP5 1158 aa22.51■■□□□ 1.19
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SCN7AQ01118 1682 aa22.51■■□□□ 1.19
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TM4SF1P30408 202 aa22.5■■□□□ 1.19
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DDR1Q08345 913 aa22.5■■□□□ 1.19
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NFIXQ14938 502 aa22.5■■□□□ 1.19
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NECTIN2Q92692 538 aa22.5■■□□□ 1.19
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF652Q9Y2D9 606 aa22.5■■□□□ 1.19
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GPR162Q16538 588 aa22.49■■□□□ 1.19
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KIF6Q6ZMV9 814 aa22.49■■□□□ 1.19
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NLGN2Q8NFZ4 835 aa22.49■■□□□ 1.19
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RGL2O15211 777 aa22.48■■□□□ 1.19
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CLEC4GQ6UXB4 293 aa22.48■■□□□ 1.19
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 BICDL1Q6ZP65 573 aa22.48■■□□□ 1.19
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PDIA6Q15084 440 aa22.47■■□□□ 1.19
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TBC1D9BQ66K14 1250 aa22.47■■□□□ 1.19
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 C10orf71Q711Q0 1435 aa22.47■■□□□ 1.19
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 C1QTNF8P60827 252 aa22.46■■□□□ 1.19
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CHMP4AQ9BY43 222 aa22.46■■□□□ 1.19
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.6 ms