RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411000.1

RNU6-172P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 172, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-172P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-172P-201ENST00000411000 CDCP2Q5VXM1 449 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-172P-201ENST00000411000 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP0.95□□□□□ -2.26
RNU6-172P-201ENST00000411000 ELOA3Q8NG57 546 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-172P-201ENST00000411000 ABHD17AQ96GS6 310 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-172P-201ENST00000411000 NDFIP2Q9NV92 336 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-172P-201ENST00000411000 EVA1BQ9NVM1 165 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-172P-201ENST00000411000 RAXQ9Y2V3 346 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-172P-201ENST00000411000 GRXCR2A6NFK2 248 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-172P-201ENST00000411000 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP0.94□□□□□ -2.26
RNU6-172P-201ENST00000411000 LILRB3O75022 631 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-172P-201ENST00000411000 KCNH2Q12809 1159 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-172P-201ENST00000411000 MSL1Q68DK7 614 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-172P-201ENST00000411000 FOXJ1Q92949 421 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-172P-201ENST00000411000 LRRC10BA6NIK2 292 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-172P-201ENST00000411000 ADH1AP07327 375 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-172P-201ENST00000411000 MS4A1P11836 297 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-172P-201ENST00000411000 GPC1P35052 558 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-172P-201ENST00000411000 PTPRNQ16849 979 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-172P-201ENST00000411000 C4orf48Q5BLP8 95 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-172P-201ENST00000411000 WDR44Q5JSH3 913 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-172P-201ENST00000411000 CIAPIN1Q6FI81 312 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-172P-201ENST00000411000 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP0.93□□□□□ -2.26
RNU6-172P-201ENST00000411000 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP0.93□□□□□ -2.26
RNU6-172P-201ENST00000411000 GPR20Q99678 358 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-172P-201ENST00000411000 MDFIQ99750 246 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-172P-201ENST00000411000 DBNDD2Q9BQY9 259 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-172P-201ENST00000411000 STOML1Q9UBI4 398 aa0.93□□□□□ -2.26
RNU6-172P-201ENST00000411000 BNIP3LO60238 219 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-172P-201ENST00000411000 ALBP02768 609 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLPIP03973 132 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-172P-201ENST00000411000 C1QTNF9P0C862 333 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-172P-201ENST00000411000 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP0.92□□□□□ -2.26
RNU6-172P-201ENST00000411000 MSMPQ1L6U9 139 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM182BQ5T319 152 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-172P-201ENST00000411000 NBPF14Q5TI25 921 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP0.92□□□□□ -2.26
RNU6-172P-201ENST00000411000 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP0.92□□□□□ -2.26
RNU6-172P-201ENST00000411000 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP0.92□□□□□ -2.26
RNU6-172P-201ENST00000411000 NBPF15Q8N660 670 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZIC5Q96T25 663 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-172P-201ENST00000411000 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-172P-201ENST00000411000 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-172P-201ENST00000411000 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-172P-201ENST00000411000 DDX11L8A8MPP1 907 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-172P-201ENST00000411000 NPIPB6E9PJ23 425 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-172P-201ENST00000411000 NFIBO00712 420 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-172P-201ENST00000411000 KRT1P04264 644 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-172P-201ENST00000411000 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP0.91□□□□□ -2.26
RNU6-172P-201ENST00000411000 KRTAP10-11P60412 298 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-172P-201ENST00000411000 POU4F2Q12837 409 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-172P-201ENST00000411000 AGERQ15109 404 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-172P-201ENST00000411000 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP0.91□□□□□ -2.26
RNU6-172P-201ENST00000411000 RNF43Q68DV7 783 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-172P-201ENST00000411000 XKR5Q6UX68 686 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-172P-201ENST00000411000 C8orf86Q6ZUL3 223 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-172P-201ENST00000411000 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP0.91□□□□□ -2.26
RNU6-172P-201ENST00000411000 RETREG3Q86VR2 466 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-172P-201ENST00000411000 PXYLP1Q8TE99 480 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-172P-201ENST00000411000 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP0.91□□□□□ -2.26
RNU6-172P-201ENST00000411000 SEMA6CQ9H3T2 930 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-172P-201ENST00000411000 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-172P-201ENST00000411000 CYR61O00622 381 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-172P-201ENST00000411000 MATN3O15232 486 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-172P-201ENST00000411000 GDF5P43026 501 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-172P-201ENST00000411000 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP0.9□□□□□ -2.27
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM161AQ3B820 660 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-172P-201ENST00000411000 EFHC2Q5JST6 749 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-172P-201ENST00000411000 SULF1Q8IWU6 871 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-172P-201ENST00000411000 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP0.9□□□□□ -2.27
RNU6-172P-201ENST00000411000 FLCNQ8NFG4 579 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-172P-201ENST00000411000 KCNC2Q96PR1 638 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-172P-201ENST00000411000 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP0.9□□□□□ -2.27
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP0.9□□□□□ -2.27
RNU6-172P-201ENST00000411000 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP0.9□□□□□ -2.27
RNU6-172P-201ENST00000411000 STARD13Q9Y3M8 1113 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-172P-201ENST00000411000 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-172P-201ENST00000411000 DHX15O43143 795 aaKnown RBP0.89□□□□□ -2.27
RNU6-172P-201ENST00000411000 OATP04181 439 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-172P-201ENST00000411000 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-172P-201ENST00000411000 BMP7P18075 431 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-172P-201ENST00000411000 KCNA10Q16322 511 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-172P-201ENST00000411000 MLANAQ16655 118 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF792Q3KQV3 632 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-172P-201ENST00000411000 PGBD3Q8N328 593 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-172P-201ENST00000411000 GLIS3Q8NEA6 775 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-172P-201ENST00000411000 SHKBP1Q8TBC3 707 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-172P-201ENST00000411000 GPAMQ9HCL2 828 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-172P-201ENST00000411000 CD320Q9NPF0 282 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-172P-201ENST00000411000 DLL4Q9NR61 685 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-172P-201ENST00000411000 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP0.89□□□□□ -2.27
RNU6-172P-201ENST00000411000 PIM2Q9P1W9 311 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-172P-201ENST00000411000 HRH3Q9Y5N1 445 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-172P-201ENST00000411000 A0A1B0GTH6 734 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-172P-201ENST00000411000 WASLO00401 505 aaPredicted RBP0.88□□□□□ -2.27
RNU6-172P-201ENST00000411000 NUAK1O60285 661 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-172P-201ENST00000411000 LILRB5O75023 590 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-172P-201ENST00000411000 ERBB2P04626 1255 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-172P-201ENST00000411000 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP0.88□□□□□ -2.27
RNU6-172P-201ENST00000411000 FIGNL1Q6PIW4 674 aa0.88□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms