RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000406506.3

HOXD12-202, Transcript of homeobox D12, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene HOXD12, Length 1,318 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-202ENST00000406506 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa25.17■■□□□ 1.62
HOXD12-202ENST00000406506 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
HOXD12-202ENST00000406506 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
HOXD12-202ENST00000406506 SMIM5Q71RC9 77 aa25.17■■□□□ 1.62
HOXD12-202ENST00000406506 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
HOXD12-202ENST00000406506 FLAD1Q8NFF5 587 aa25.17■■□□□ 1.62
HOXD12-202ENST00000406506 RPS6KA4O75676 772 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXD12-202ENST00000406506 STARD3NLO95772 234 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXD12-202ENST00000406506 ZNF853P0CG23 659 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXD12-202ENST00000406506 IFT57Q9NWB7 429 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXD12-202ENST00000406506 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXD12-202ENST00000406506 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
HOXD12-202ENST00000406506 NGEFQ8N5V2 710 aa25.15■■□□□ 1.62
HOXD12-202ENST00000406506 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
HOXD12-202ENST00000406506 GNAI1P63096 354 aa25.14■■□□□ 1.62
HOXD12-202ENST00000406506 MBIPQ9NS73 344 aa25.14■■□□□ 1.62
HOXD12-202ENST00000406506 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.61
HOXD12-202ENST00000406506 SCN7AQ01118 1682 aa25.14■■□□□ 1.61
HOXD12-202ENST00000406506 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
HOXD12-202ENST00000406506 ZBTB7AO95365 584 aa25.13■■□□□ 1.61
HOXD12-202ENST00000406506 ADRA2BP18089 450 aa25.13■■□□□ 1.61
HOXD12-202ENST00000406506 USP16Q9Y5T5 823 aa25.13■■□□□ 1.61
HOXD12-202ENST00000406506 COL15A1P39059 1388 aa25.13■■□□□ 1.61
HOXD12-202ENST00000406506 BCORQ6W2J9 1755 aa25.13■■□□□ 1.61
HOXD12-202ENST00000406506 MSH5O43196 834 aa25.12■■□□□ 1.61
HOXD12-202ENST00000406506 SLC16A10Q8TF71 515 aa25.12■■□□□ 1.61
HOXD12-202ENST00000406506 IL16Q14005 1332 aa25.12■■□□□ 1.61
HOXD12-202ENST00000406506 MTFR1LQ9H019 292 aa25.12■■□□□ 1.61
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HOXD12-202ENST00000406506 A1BGP04217 495 aa25.09■■□□□ 1.61
HOXD12-202ENST00000406506 KRT24Q2M2I5 525 aa25.09■■□□□ 1.61
HOXD12-202ENST00000406506 WDR63Q8IWG1 891 aa25.09■■□□□ 1.61
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HOXD12-202ENST00000406506 SPON1Q9HCB6 807 aa25.09■■□□□ 1.61
HOXD12-202ENST00000406506 ZNF521Q96K83 1311 aa25.08■■□□□ 1.61
HOXD12-202ENST00000406506 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.6
HOXD12-202ENST00000406506 EIF5P55010 431 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
HOXD12-202ENST00000406506 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
HOXD12-202ENST00000406506 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
HOXD12-202ENST00000406506 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
HOXD12-202ENST00000406506 RFC4P35249 363 aa25.05■■□□□ 1.6
HOXD12-202ENST00000406506 PTGER2P43116 358 aa25.05■■□□□ 1.6
HOXD12-202ENST00000406506 SGIP1Q9BQI5 828 aa25.05■■□□□ 1.6
HOXD12-202ENST00000406506 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
HOXD12-202ENST00000406506 NBPF26B4DH59 902 aa25.04■■□□□ 1.6
HOXD12-202ENST00000406506 HOXB7P09629 217 aa25.04■■□□□ 1.6
HOXD12-202ENST00000406506 MSL1Q68DK7 614 aa25.04■■□□□ 1.6
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HOXD12-202ENST00000406506 NBPF15Q8N660 670 aa25.04■■□□□ 1.6
HOXD12-202ENST00000406506 ERBB4Q15303 1308 aa25.03■■□□□ 1.6
HOXD12-202ENST00000406506 FANCIQ9NVI1 1328 aa25.03■■□□□ 1.6
HOXD12-202ENST00000406506 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
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HOXD12-202ENST00000406506 NARFQ9UHQ1 456 aa25■■□□□ 1.59
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HOXD12-202ENST00000406506 CACNA1FO60840 1977 aa24.98■■□□□ 1.59
HOXD12-202ENST00000406506 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
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HOXD12-202ENST00000406506 NECTIN2Q92692 538 aa24.97■■□□□ 1.59
HOXD12-202ENST00000406506 PDIA6Q15084 440 aa24.96■■□□□ 1.59
HOXD12-202ENST00000406506 MYH16Q9H6N6 1097 aa24.96■■□□□ 1.59
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HOXD12-202ENST00000406506 GOLGA2Q08379 1002 aa24.95■■□□□ 1.58
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HOXD12-202ENST00000406506 NLGN1Q8N2Q7 840 aa24.95■■□□□ 1.58
HOXD12-202ENST00000406506 TSPYL6Q8N831 410 aa24.95■■□□□ 1.58
HOXD12-202ENST00000406506 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa24.95■■□□□ 1.58
HOXD12-202ENST00000406506 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa24.95■■□□□ 1.58
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HOXD12-202ENST00000406506 BCL2L12Q9HB09 334 aa24.94■■□□□ 1.58
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HOXD12-202ENST00000406506 CAMTA2O94983 1202 aa24.93■■□□□ 1.58
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HOXD12-202ENST00000406506 CHPF2Q9P2E5 772 aa24.93■■□□□ 1.58
HOXD12-202ENST00000406506 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
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HOXD12-202ENST00000406506 ARXQ96QS3 562 aa24.92■■□□□ 1.58
HOXD12-202ENST00000406506 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP24.92■■□□□ 1.58
HOXD12-202ENST00000406506 MMP10P09238 476 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXD12-202ENST00000406506 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
HOXD12-202ENST00000406506 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXD12-202ENST00000406506 E9PSI1 815 aa24.9■■□□□ 1.58
HOXD12-202ENST00000406506 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
HOXD12-202ENST00000406506 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
HOXD12-202ENST00000406506 SLFN5Q08AF3 891 aa24.88■■□□□ 1.57
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