RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393193.6

NME1-NME2-202, Transcript of NME1-NME2 readthrough, humanhuman

APPRIS P2 TSL 2 BASIC

Gene NME1-NME2, Length 1,021 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1-NME2-202ENST00000393193 COL15A1P39059 1388 aa21.67■■□□□ 1.06
NME1-NME2-202ENST00000393193 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
NME1-NME2-202ENST00000393193 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
NME1-NME2-202ENST00000393193 MMP10P09238 476 aa21.66■■□□□ 1.06
NME1-NME2-202ENST00000393193 RFC4P35249 363 aa21.66■■□□□ 1.06
NME1-NME2-202ENST00000393193 NLGN1Q8N2Q7 840 aa21.66■■□□□ 1.06
NME1-NME2-202ENST00000393193 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
NME1-NME2-202ENST00000393193 FMNL2Q96PY5 1086 aa21.66■■□□□ 1.06
NME1-NME2-202ENST00000393193 EIF5P55010 431 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
NME1-NME2-202ENST00000393193 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
NME1-NME2-202ENST00000393193 FKBP8Q14318 412 aa21.64■■□□□ 1.05
NME1-NME2-202ENST00000393193 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
NME1-NME2-202ENST00000393193 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
NME1-NME2-202ENST00000393193 BCL2L12Q9HB09 334 aa21.64■■□□□ 1.05
NME1-NME2-202ENST00000393193 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa21.63■■□□□ 1.05
NME1-NME2-202ENST00000393193 DDR1Q08345 913 aa21.63■■□□□ 1.05
NME1-NME2-202ENST00000393193 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
NME1-NME2-202ENST00000393193 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
NME1-NME2-202ENST00000393193 PXDNLA1KZ92 1463 aa21.63■■□□□ 1.05
NME1-NME2-202ENST00000393193 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa21.62■■□□□ 1.05
NME1-NME2-202ENST00000393193 STARD3NLO95772 234 aa21.62■■□□□ 1.05
NME1-NME2-202ENST00000393193 TMPOP42166 694 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
NME1-NME2-202ENST00000393193 NARFQ9UHQ1 456 aa21.62■■□□□ 1.05
NME1-NME2-202ENST00000393193 ADAMTS8Q9UP79 889 aa21.62■■□□□ 1.05
NME1-NME2-202ENST00000393193 TM4SF1P30408 202 aa21.61■■□□□ 1.05
NME1-NME2-202ENST00000393193 KLHL34Q8N239 644 aa21.61■■□□□ 1.05
NME1-NME2-202ENST00000393193 USP16Q9Y5T5 823 aa21.61■■□□□ 1.05
NME1-NME2-202ENST00000393193 NEFMP07197 916 aa21.6■■□□□ 1.05
NME1-NME2-202ENST00000393193 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP21.6■■□□□ 1.053e-9■■□□□ 12.4
NME1-NME2-202ENST00000393193 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
NME1-NME2-202ENST00000393193 CCDC184Q52MB2 194 aa21.59■■□□□ 1.05
NME1-NME2-202ENST00000393193 USPL1Q5W0Q7 1092 aa21.59■■□□□ 1.05
NME1-NME2-202ENST00000393193 MIS18AQ9NYP9 233 aa21.59■■□□□ 1.05
NME1-NME2-202ENST00000393193 A1BGP04217 495 aa21.58■■□□□ 1.05
NME1-NME2-202ENST00000393193 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
NME1-NME2-202ENST00000393193 CANXP27824 592 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
NME1-NME2-202ENST00000393193 RIPK4P57078 832 aa21.58■■□□□ 1.05
NME1-NME2-202ENST00000393193 CCDC146Q8IYE0 955 aa21.58■■□□□ 1.05
NME1-NME2-202ENST00000393193 RUNDC1Q96C34 613 aa21.58■■□□□ 1.05
NME1-NME2-202ENST00000393193 DLEC1Q9Y238 1755 aa21.57■■□□□ 1.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 TRIM35Q9UPQ4 493 aa21.57■■□□□ 1.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa21.57■■□□□ 1.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 NBPF26B4DH59 902 aa21.56■■□□□ 1.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 NBPF15Q8N660 670 aa21.56■■□□□ 1.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa21.56■■□□□ 1.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 NFIXQ14938 502 aa21.55■■□□□ 1.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP21.55■■□□□ 1.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 DCAF8L1A6NGE4 600 aa21.54■■□□□ 1.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 ZPR1O75312 459 aa21.54■■□□□ 1.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 CAMTA2O94983 1202 aa21.53■■□□□ 1.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 BABAM1Q9NWV8 329 aa21.53■■□□□ 1.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 A0A087WZG4 1122 aa21.52■■□□□ 1.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 GPR162Q16538 588 aa21.52■■□□□ 1.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 PARP3Q9Y6F1 533 aa21.52■■□□□ 1.04
NME1-NME2-202ENST00000393193 NUP98P52948 1817 aa21.51■■□□□ 1.03
NME1-NME2-202ENST00000393193 KCNA3P22001 575 aa21.51■■□□□ 1.03
NME1-NME2-202ENST00000393193 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
NME1-NME2-202ENST00000393193 TGFB2P61812 414 aa21.51■■□□□ 1.03
NME1-NME2-202ENST00000393193 LMOD3Q0VAK6 560 aa21.5■■□□□ 1.03
NME1-NME2-202ENST00000393193 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa21.5■■□□□ 1.03
NME1-NME2-202ENST00000393193 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
NME1-NME2-202ENST00000393193 YY1P25490 414 aa21.49■■□□□ 1.03
NME1-NME2-202ENST00000393193 CARMIL3Q8ND23 1372 aa21.48■■□□□ 1.03
NME1-NME2-202ENST00000393193 CHL1O00533 1208 aa21.48■■□□□ 1.03
NME1-NME2-202ENST00000393193 TBC1D9BQ66K14 1250 aa21.48■■□□□ 1.03
NME1-NME2-202ENST00000393193 RGL2O15211 777 aa21.47■■□□□ 1.03
NME1-NME2-202ENST00000393193 DPEP1P16444 411 aa21.47■■□□□ 1.03
NME1-NME2-202ENST00000393193 LRP10Q7Z4F1 713 aa21.47■■□□□ 1.03
NME1-NME2-202ENST00000393193 A0A0G2JLW4 131 aa21.46■■□□□ 1.03
NME1-NME2-202ENST00000393193 NEUROD2Q15784 382 aa21.46■■□□□ 1.03
NME1-NME2-202ENST00000393193 TSPYL4Q9UJ04 414 aa21.46■■□□□ 1.03
NME1-NME2-202ENST00000393193 GRIN3BO60391 1043 aa21.45■■□□□ 1.02
NME1-NME2-202ENST00000393193 SERPINB2P05120 415 aa21.45■■□□□ 1.02
NME1-NME2-202ENST00000393193 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
NME1-NME2-202ENST00000393193 APAF1O14727 1248 aa21.44■■□□□ 1.02
NME1-NME2-202ENST00000393193 ZNF853P0CG23 659 aa21.44■■□□□ 1.02
NME1-NME2-202ENST00000393193 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
NME1-NME2-202ENST00000393193 PDIA6Q15084 440 aa21.43■■□□□ 1.02
NME1-NME2-202ENST00000393193 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
NME1-NME2-202ENST00000393193 ERBB4Q15303 1308 aa21.43■■□□□ 1.02
NME1-NME2-202ENST00000393193 ADCY9O60503 1353 aa21.42■■□□□ 1.02
NME1-NME2-202ENST00000393193 CLEC4GQ6UXB4 293 aa21.42■■□□□ 1.02
NME1-NME2-202ENST00000393193 WWC3Q9ULE0 1092 aa21.42■■□□□ 1.02
NME1-NME2-202ENST00000393193 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa21.42■■□□□ 1.02
NME1-NME2-202ENST00000393193 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa21.41■■□□□ 1.02
NME1-NME2-202ENST00000393193 SBF1O95248 1867 aa21.41■■□□□ 1.02
NME1-NME2-202ENST00000393193 CHRNA5P30532 468 aa21.4■■□□□ 1.02
NME1-NME2-202ENST00000393193 KRT24Q2M2I5 525 aa21.4■■□□□ 1.02
NME1-NME2-202ENST00000393193 PRR5LQ6MZQ0 368 aa21.4■■□□□ 1.02
NME1-NME2-202ENST00000393193 CFAP44Q96MT7 982 aa21.4■■□□□ 1.02
NME1-NME2-202ENST00000393193 ANP32CO43423 234 aa21.39■■□□□ 1.01
NME1-NME2-202ENST00000393193 HLFQ16534 295 aa21.39■■□□□ 1.01
NME1-NME2-202ENST00000393193 BICDL1Q6ZP65 573 aa21.39■■□□□ 1.01
NME1-NME2-202ENST00000393193 ATP10DQ9P241 1426 aa21.38■■□□□ 1.01
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