RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392919.4

GNPTAB-202, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 760 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-202ENST00000392919 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa35.9■■■■□ 3.34
GNPTAB-202ENST00000392919 TTC5Q8N0Z6 440 aa35.9■■■■□ 3.34
GNPTAB-202ENST00000392919 VSIG10Q8N0Z9 540 aa35.9■■■■□ 3.34
GNPTAB-202ENST00000392919 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa35.9■■■■□ 3.34
GNPTAB-202ENST00000392919 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa35.89■■■■□ 3.34
GNPTAB-202ENST00000392919 CCDC146Q8IYE0 955 aa35.89■■■■□ 3.34
GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP35.89■■■■□ 3.34
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GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF790Q6PG37 636 aa35.88■■■■□ 3.33
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GNPTAB-202ENST00000392919 PARP3Q9Y6F1 533 aa35.88■■■■□ 3.33
GNPTAB-202ENST00000392919 C10orf71Q711Q0 1435 aa35.87■■■■□ 3.33
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GNPTAB-202ENST00000392919 DDR1Q08345 913 aa35.85■■■■□ 3.33
GNPTAB-202ENST00000392919 RUNDC1Q96C34 613 aa35.85■■■■□ 3.33
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GNPTAB-202ENST00000392919 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP35.84■■■■□ 3.33
GNPTAB-202ENST00000392919 USPL1Q5W0Q7 1092 aa35.84■■■■□ 3.33
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GNPTAB-202ENST00000392919 HEG1Q9ULI3 1381 aa35.83■■■■□ 3.33
GNPTAB-202ENST00000392919 A0A0G2JLW4 131 aa35.82■■■■□ 3.32
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GNPTAB-202ENST00000392919 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP35.82■■■■□ 3.32
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GNPTAB-202ENST00000392919 TGFB2P61812 414 aa35.81■■■■□ 3.32
GNPTAB-202ENST00000392919 DCTN1Q14203 1278 aa35.81■■■■□ 3.32
GNPTAB-202ENST00000392919 BTBD11A6QL63 1104 aa35.8■■■■□ 3.32
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GNPTAB-202ENST00000392919 NARFQ9UHQ1 456 aa35.79■■■■□ 3.32
GNPTAB-202ENST00000392919 STARD3NLO95772 234 aa35.78■■■■□ 3.32
GNPTAB-202ENST00000392919 DPEP1P16444 411 aa35.78■■■■□ 3.32
GNPTAB-202ENST00000392919 DLG5Q8TDM6 1919 aa35.77■■■■□ 3.32
GNPTAB-202ENST00000392919 FMNL2Q96PY5 1086 aa35.77■■■■□ 3.32
GNPTAB-202ENST00000392919 BCL2L12Q9HB09 334 aa35.77■■■■□ 3.32
GNPTAB-202ENST00000392919 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP35.76■■■■□ 3.32
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GNPTAB-202ENST00000392919 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP35.75■■■■□ 3.31
GNPTAB-202ENST00000392919 EIF5P55010 431 aaKnown RBP35.74■■■■□ 3.31
GNPTAB-202ENST00000392919 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP35.73■■■■□ 3.31
GNPTAB-202ENST00000392919 NFIXQ14938 502 aa35.72■■■■□ 3.31
GNPTAB-202ENST00000392919 BCS1LQ9Y276 419 aa35.72■■■■□ 3.31
GNPTAB-202ENST00000392919 KCNA3P22001 575 aa35.71■■■■□ 3.31
GNPTAB-202ENST00000392919 A1BGP04217 495 aa35.7■■■■□ 3.31
GNPTAB-202ENST00000392919 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP35.7■■■■□ 3.31
GNPTAB-202ENST00000392919 NEUROD2Q15784 382 aa35.7■■■■□ 3.31
GNPTAB-202ENST00000392919 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP35.7■■■■□ 3.31
GNPTAB-202ENST00000392919 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa35.69■■■■□ 3.3
GNPTAB-202ENST00000392919 APAF1O14727 1248 aa35.69■■■■□ 3.3
GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP35.68■■■■□ 3.3
GNPTAB-202ENST00000392919 USP16Q9Y5T5 823 aa35.68■■■■□ 3.3
GNPTAB-202ENST00000392919 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP35.68■■■■□ 3.3
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GNPTAB-202ENST00000392919 ATP10DQ9P241 1426 aa35.66■■■■□ 3.3
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GNPTAB-202ENST00000392919 CHRNA5P30532 468 aa35.65■■■■□ 3.3
GNPTAB-202ENST00000392919 LMOD3Q0VAK6 560 aa35.65■■■■□ 3.3
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GNPTAB-202ENST00000392919 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa35.65■■■■□ 3.3
GNPTAB-202ENST00000392919 A0A087WZG4 1122 aa35.64■■■■□ 3.3
GNPTAB-202ENST00000392919 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP35.64■■■■□ 3.3
GNPTAB-202ENST00000392919 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP35.64■■■■□ 3.3
GNPTAB-202ENST00000392919 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP35.64■■■■□ 3.3
GNPTAB-202ENST00000392919 MIS18AQ9NYP9 233 aa35.64■■■■□ 3.3
GNPTAB-202ENST00000392919 ADCY9O60503 1353 aa35.64■■■■□ 3.3
GNPTAB-202ENST00000392919 NRXN2Q9P2S2 1712 aa35.63■■■■□ 3.29
GNPTAB-202ENST00000392919 BICDL1Q6ZP65 573 aa35.63■■■■□ 3.29
GNPTAB-202ENST00000392919 MIER1Q8N108 512 aa35.63■■■■□ 3.29
GNPTAB-202ENST00000392919 SERPINB2P05120 415 aa35.62■■■■□ 3.29
GNPTAB-202ENST00000392919 PIM2Q9P1W9 311 aa35.61■■■■□ 3.29
GNPTAB-202ENST00000392919 SCN7AQ01118 1682 aa35.6■■■■□ 3.29
GNPTAB-202ENST00000392919 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP35.6■■■■□ 3.29
GNPTAB-202ENST00000392919 TBC1D9BQ66K14 1250 aa35.59■■■■□ 3.29
GNPTAB-202ENST00000392919 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa35.58■■■■□ 3.29
GNPTAB-202ENST00000392919 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP35.57■■■■□ 3.28
GNPTAB-202ENST00000392919 CARMIL3Q8ND23 1372 aa35.56■■■■□ 3.28
GNPTAB-202ENST00000392919 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa35.56■■■■□ 3.28
GNPTAB-202ENST00000392919 C1QTNF8P60827 252 aa35.56■■■■□ 3.28
GNPTAB-202ENST00000392919 CAMTA2O94983 1202 aa35.55■■■■□ 3.28
GNPTAB-202ENST00000392919 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP35.55■■■■□ 3.28
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GNPTAB-202ENST00000392919 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa35.54■■■■□ 3.28
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GNPTAB-202ENST00000392919 NBPF26B4DH59 902 aa35.52■■■■□ 3.28
GNPTAB-202ENST00000392919 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP35.52■■■■□ 3.28
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GNPTAB-202ENST00000392919 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP35.52■■■■□ 3.28
GNPTAB-202ENST00000392919 NBPF15Q8N660 670 aa35.52■■■■□ 3.28
GNPTAB-202ENST00000392919 BCORQ6W2J9 1755 aa35.51■■■■□ 3.27
GNPTAB-202ENST00000392919 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP35.5■■■■□ 3.27
GNPTAB-202ENST00000392919 CCDC24Q8N4L8 307 aa35.49■■■■□ 3.27
GNPTAB-202ENST00000392919 BABAM1Q9NWV8 329 aa35.47■■■■□ 3.27
GNPTAB-202ENST00000392919 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa35.46■■■■□ 3.27
GNPTAB-202ENST00000392919 CCDC27Q2M243 656 aa35.46■■■■□ 3.27
GNPTAB-202ENST00000392919 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP35.46■■■■□ 3.27
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GNPTAB-202ENST00000392919 DLEC1Q9Y238 1755 aa35.46■■■■□ 3.27
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