RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356331.9

SH3BP2-201, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 9,211 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-201ENST00000356331 NDC80O14777 642 aa12.27□□□□□ -0.45
SH3BP2-201ENST00000356331 FERP16591 822 aa12.27□□□□□ -0.45
SH3BP2-201ENST00000356331 GAS2L2Q8NHY3 880 aa12.27□□□□□ -0.45
SH3BP2-201ENST00000356331 RSPH14Q9UHP6 348 aa12.27□□□□□ -0.45
SH3BP2-201ENST00000356331 TIAM1Q13009 1591 aa12.27□□□□□ -0.45
SH3BP2-201ENST00000356331 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.45
SH3BP2-201ENST00000356331 TSG101Q99816 390 aa12.27□□□□□ -0.45
SH3BP2-201ENST00000356331 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa12.27□□□□□ -0.45
SH3BP2-201ENST00000356331 IFT74Q96LB3 600 aa12.27□□□□□ -0.45
SH3BP2-201ENST00000356331 LRRC27Q9C0I9 530 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BP2-201ENST00000356331 FSD2A1L4K1 749 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BP2-201ENST00000356331 CASTP20810 708 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
SH3BP2-201ENST00000356331 CETN1Q12798 172 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BP2-201ENST00000356331 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
SH3BP2-201ENST00000356331 LRRC45Q96CN5 670 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BP2-201ENST00000356331 TANGO6Q9C0B7 1094 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BP2-201ENST00000356331 ATP2B1P20020 1258 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BP2-201ENST00000356331 GBP6Q6ZN66 633 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BP2-201ENST00000356331 NEUROD6Q96NK8 337 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BP2-201ENST00000356331 CAPN2P17655 700 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BP2-201ENST00000356331 HSF2BPO75031 334 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BP2-201ENST00000356331 TACC1O75410 805 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BP2-201ENST00000356331 TCP11L2Q8N4U5 519 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BP2-201ENST00000356331 CCDC155Q8N6L0 562 aa12.25□□□□□ -0.45
SH3BP2-201ENST00000356331 ZBTB17Q13105 803 aa12.25□□□□□ -0.45
SH3BP2-201ENST00000356331 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
SH3BP2-201ENST00000356331 UBE2HP62256 183 aa12.25□□□□□ -0.45
SH3BP2-201ENST00000356331 MICALL1Q8N3F8 863 aa12.25□□□□□ -0.45
SH3BP2-201ENST00000356331 MYRIPQ8NFW9 859 aa12.25□□□□□ -0.45
SH3BP2-201ENST00000356331 RAB11FIP3O75154 756 aa12.25□□□□□ -0.45
SH3BP2-201ENST00000356331 BMP15O95972 392 aa12.25□□□□□ -0.45
SH3BP2-201ENST00000356331 TOP1P11387 765 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
SH3BP2-201ENST00000356331 KIF5BP33176 963 aa12.25□□□□□ -0.45
SH3BP2-201ENST00000356331 EIF5P55010 431 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
SH3BP2-201ENST00000356331 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
SH3BP2-201ENST00000356331 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
SH3BP2-201ENST00000356331 EBAG9O00559 213 aa12.24□□□□□ -0.45
SH3BP2-201ENST00000356331 DMTNQ08495 405 aa12.24□□□□□ -0.45
SH3BP2-201ENST00000356331 MAP3K1Q13233 1512 aa12.24□□□□□ -0.45
SH3BP2-201ENST00000356331 FAM184BQ9ULE4 1060 aa12.24□□□□□ -0.45
SH3BP2-201ENST00000356331 HMOX1P09601 288 aa12.24□□□□□ -0.45
SH3BP2-201ENST00000356331 ATP5DP30049 168 aa12.24□□□□□ -0.45
SH3BP2-201ENST00000356331 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa12.24□□□□□ -0.45
SH3BP2-201ENST00000356331 GRIPAP1Q4V328 841 aa12.24□□□□□ -0.45
SH3BP2-201ENST00000356331 STIM2Q9P246 746 aa12.24□□□□□ -0.45
SH3BP2-201ENST00000356331 KRBA2Q6ZNG9 492 aa12.24□□□□□ -0.45
SH3BP2-201ENST00000356331 SKAP1Q86WV1 359 aa12.24□□□□□ -0.45
SH3BP2-201ENST00000356331 CCDC113Q9H0I3 377 aa12.24□□□□□ -0.45
SH3BP2-201ENST00000356331 GPRASP1Q5JY77 1395 aa12.23□□□□□ -0.45
SH3BP2-201ENST00000356331 C20orf194Q5TEA3 1177 aa12.23□□□□□ -0.45
SH3BP2-201ENST00000356331 NUTM1Q86Y26 1132 aa12.23□□□□□ -0.45
SH3BP2-201ENST00000356331 KLHL34Q8N239 644 aa12.23□□□□□ -0.45
SH3BP2-201ENST00000356331 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP12.23□□□□□ -0.45
SH3BP2-201ENST00000356331 IGSF3O75054 1194 aa12.23□□□□□ -0.45
SH3BP2-201ENST00000356331 SLU7O95391 586 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
SH3BP2-201ENST00000356331 SLFN5Q08AF3 891 aa12.23□□□□□ -0.45
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP12.23□□□□□ -0.45
SH3BP2-201ENST00000356331 TMX1Q9H3N1 280 aa12.23□□□□□ -0.45
SH3BP2-201ENST00000356331 PPFIA3O75145 1194 aa12.23□□□□□ -0.45
SH3BP2-201ENST00000356331 KIF4AO95239 1232 aa12.23□□□□□ -0.45
SH3BP2-201ENST00000356331 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
SH3BP2-201ENST00000356331 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
SH3BP2-201ENST00000356331 ARHGAP25P42331 645 aa12.22□□□□□ -0.45
SH3BP2-201ENST00000356331 ANAPC15P60006 121 aa12.22□□□□□ -0.45
SH3BP2-201ENST00000356331 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa12.22□□□□□ -0.45
SH3BP2-201ENST00000356331 PDRG1Q9NUG6 133 aa12.22□□□□□ -0.45
SH3BP2-201ENST00000356331 RAI14Q9P0K7 980 aa12.22□□□□□ -0.45
SH3BP2-201ENST00000356331 TTC21AQ8NDW8 1320 aa12.22□□□□□ -0.45
SH3BP2-201ENST00000356331 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP12.22□□□□□ -0.45
SH3BP2-201ENST00000356331 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP12.22□□□□□ -0.45
SH3BP2-201ENST00000356331 RIC3Q7Z5B4 369 aa12.22□□□□□ -0.45
SH3BP2-201ENST00000356331 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP12.22□□□□□ -0.45
SH3BP2-201ENST00000356331 NCAPD3P42695 1498 aa12.22□□□□□ -0.45
SH3BP2-201ENST00000356331 TSGA10Q9BZW7 698 aa12.22□□□□□ -0.45
SH3BP2-201ENST00000356331 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP12.22□□□□□ -0.45
SH3BP2-201ENST00000356331 IKBKGQ9Y6K9 419 aa12.22□□□□□ -0.45
SH3BP2-201ENST00000356331 CCDC69A6NI79 296 aa12.22□□□□□ -0.45
SH3BP2-201ENST00000356331 ALDH3A1P30838 453 aa12.22□□□□□ -0.45
SH3BP2-201ENST00000356331 TSNARE1Q96NA8 513 aa12.22□□□□□ -0.45
SH3BP2-201ENST00000356331 GOPCQ9HD26 462 aa12.22□□□□□ -0.45
SH3BP2-201ENST00000356331 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP12.22□□□□□ -0.45
SH3BP2-201ENST00000356331 CCDC77Q9BR77 488 aa12.21□□□□□ -0.45
SH3BP2-201ENST00000356331 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP12.21□□□□□ -0.45
SH3BP2-201ENST00000356331 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.45
SH3BP2-201ENST00000356331 CCDC158Q5M9N0 1113 aa12.21□□□□□ -0.45
SH3BP2-201ENST00000356331 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa12.21□□□□□ -0.45
SH3BP2-201ENST00000356331 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP12.21□□□□□ -0.46
SH3BP2-201ENST00000356331 SPAG1Q07617 926 aa12.21□□□□□ -0.46
SH3BP2-201ENST00000356331 AMPD3Q01432 767 aa12.21□□□□□ -0.46
SH3BP2-201ENST00000356331 SMC6Q96SB8 1091 aa12.21□□□□□ -0.46
SH3BP2-201ENST00000356331 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.46
SH3BP2-201ENST00000356331 RMND1Q9NWS8 449 aa12.21□□□□□ -0.46
SH3BP2-201ENST00000356331 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
SH3BP2-201ENST00000356331 CCDC121Q6ZUS5 278 aa12.2□□□□□ -0.46
SH3BP2-201ENST00000356331 FBF1Q8TES7 1133 aa12.2□□□□□ -0.46
SH3BP2-201ENST00000356331 MYO1BO43795 1136 aa12.2□□□□□ -0.46
SH3BP2-201ENST00000356331 C8orf34Q49A92 452 aa12.2□□□□□ -0.46
SH3BP2-201ENST00000356331 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP12.2□□□□□ -0.46
SH3BP2-201ENST00000356331 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP12.2□□□□□ -0.46
SH3BP2-201ENST00000356331 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.1 ms