RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355396.7

SUSD1-201, Transcript of sushi domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2

Gene SUSD1, Length 2,861 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1-201ENST00000355396 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
SUSD1-201ENST00000355396 ERBB4Q15303 1308 aa14.97□□□□□ -0.01
SUSD1-201ENST00000355396 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
SUSD1-201ENST00000355396 KRT24Q2M2I5 525 aa14.97□□□□□ -0.01
SUSD1-201ENST00000355396 DEFB132Q7Z7B7 95 aa14.97□□□□□ -0.01
SUSD1-201ENST00000355396 DNAJC10Q8IXB1 793 aa14.97□□□□□ -0.01
SUSD1-201ENST00000355396 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
SUSD1-201ENST00000355396 VAMP4O75379 141 aa14.96□□□□□ -0.01
SUSD1-201ENST00000355396 TSPYL6Q8N831 410 aa14.96□□□□□ -0.01
SUSD1-201ENST00000355396 LINC00116Q8NCU8 138 aa14.96□□□□□ -0.01
SUSD1-201ENST00000355396 CHMP4AQ9BY43 222 aa14.96□□□□□ -0.01
SUSD1-201ENST00000355396 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa14.96□□□□□ -0.01
SUSD1-201ENST00000355396 ZNF428Q96B54 188 aa14.96□□□□□ -0.01
SUSD1-201ENST00000355396 USP16Q9Y5T5 823 aa14.96□□□□□ -0.01
SUSD1-201ENST00000355396 UBR3Q6ZT12 1888 aa14.95□□□□□ -0.02
SUSD1-201ENST00000355396 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
SUSD1-201ENST00000355396 STARD3NLO95772 234 aa14.95□□□□□ -0.02
SUSD1-201ENST00000355396 AKT1S1Q96B36 256 aa14.95□□□□□ -0.02
SUSD1-201ENST00000355396 CACNA1FO60840 1977 aa14.94□□□□□ -0.02
SUSD1-201ENST00000355396 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
SUSD1-201ENST00000355396 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
SUSD1-201ENST00000355396 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa14.93□□□□□ -0.02
SUSD1-201ENST00000355396 CRKLP46109 303 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
SUSD1-201ENST00000355396 PDIA6Q15084 440 aa14.93□□□□□ -0.02
SUSD1-201ENST00000355396 LRP10Q7Z4F1 713 aa14.93□□□□□ -0.02
SUSD1-201ENST00000355396 CCDC87Q9NVE4 849 aa14.92□□□□□ -0.02
SUSD1-201ENST00000355396 KCNQ4P56696 695 aa14.92□□□□□ -0.02
SUSD1-201ENST00000355396 CCDC30Q5VVM6 783 aa14.91□□□□□ -0.02
SUSD1-201ENST00000355396 NBPF26B4DH59 902 aa14.91□□□□□ -0.02
SUSD1-201ENST00000355396 RPS6KA4O75676 772 aa14.91□□□□□ -0.02
SUSD1-201ENST00000355396 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
SUSD1-201ENST00000355396 ALDH1L2Q3SY69 923 aa14.91□□□□□ -0.02
SUSD1-201ENST00000355396 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa14.91□□□□□ -0.02
SUSD1-201ENST00000355396 NBPF14Q5TI25 921 aa14.91□□□□□ -0.02
SUSD1-201ENST00000355396 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
SUSD1-201ENST00000355396 NBPF15Q8N660 670 aa14.91□□□□□ -0.02
SUSD1-201ENST00000355396 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP14.91□□□□□ -0.02
SUSD1-201ENST00000355396 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
SUSD1-201ENST00000355396 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
SUSD1-201ENST00000355396 EIF5P55010 431 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
SUSD1-201ENST00000355396 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
SUSD1-201ENST00000355396 A1BGP04217 495 aa14.89□□□□□ -0.03
SUSD1-201ENST00000355396 ZNF827Q17R98 1081 aa14.89□□□□□ -0.03
SUSD1-201ENST00000355396 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa14.89□□□□□ -0.03
SUSD1-201ENST00000355396 ADRA2BP18089 450 aa14.89□□□□□ -0.03
SUSD1-201ENST00000355396 C4AP0C0L4 1744 aa14.88□□□□□ -0.03
SUSD1-201ENST00000355396 SLC15A2Q16348 729 aa14.88□□□□□ -0.03
SUSD1-201ENST00000355396 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
SUSD1-201ENST00000355396 RGL2O15211 777 aa14.88□□□□□ -0.03
SUSD1-201ENST00000355396 SSFA2P28290 1259 aa14.88□□□□□ -0.03
SUSD1-201ENST00000355396 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
SUSD1-201ENST00000355396 BCORQ6W2J9 1755 aa14.87□□□□□ -0.03
SUSD1-201ENST00000355396 RARSP54136 660 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
SUSD1-201ENST00000355396 AK7Q96M32 723 aa14.87□□□□□ -0.03
SUSD1-201ENST00000355396 HYPKQ9NX55 129 aa14.87□□□□□ -0.03
SUSD1-201ENST00000355396 CHPF2Q9P2E5 772 aa14.87□□□□□ -0.03
SUSD1-201ENST00000355396 SCN7AQ01118 1682 aa14.86□□□□□ -0.03
SUSD1-201ENST00000355396 FLAD1Q8NFF5 587 aa14.86□□□□□ -0.03
SUSD1-201ENST00000355396 STK32BQ9NY57 414 aa14.86□□□□□ -0.03
SUSD1-201ENST00000355396 CASZ1Q86V15 1759 aa14.86□□□□□ -0.03
SUSD1-201ENST00000355396 COL15A1P39059 1388 aa14.86□□□□□ -0.03
SUSD1-201ENST00000355396 PROSER3Q2NL68 480 aa14.86□□□□□ -0.03
SUSD1-201ENST00000355396 AMIGO3Q86WK7 504 aa14.86□□□□□ -0.03
SUSD1-201ENST00000355396 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
SUSD1-201ENST00000355396 COL24A1Q17RW2 1714 aa14.86□□□□□ -0.03
SUSD1-201ENST00000355396 GNPATO15228 680 aa14.85□□□□□ -0.03
SUSD1-201ENST00000355396 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
SUSD1-201ENST00000355396 A0A087WZG4 1122 aa14.85□□□□□ -0.03
SUSD1-201ENST00000355396 SSH1Q8WYL5 1049 aa14.85□□□□□ -0.03
SUSD1-201ENST00000355396 STK31Q9BXU1 1019 aa14.85□□□□□ -0.03
SUSD1-201ENST00000355396 FKBP8Q14318 412 aa14.84□□□□□ -0.03
SUSD1-201ENST00000355396 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa14.84□□□□□ -0.03
SUSD1-201ENST00000355396 CANXP27824 592 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
SUSD1-201ENST00000355396 SLC4A2P04920 1241 aa14.83□□□□□ -0.04
SUSD1-201ENST00000355396 NECTIN2Q92692 538 aa14.83□□□□□ -0.04
SUSD1-201ENST00000355396 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
SUSD1-201ENST00000355396 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
SUSD1-201ENST00000355396 ERVV-1B6SEH8 477 aa14.82□□□□□ -0.04
SUSD1-201ENST00000355396 TRAPPC3LQ5T215 181 aa14.82□□□□□ -0.04
SUSD1-201ENST00000355396 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa14.82□□□□□ -0.04
SUSD1-201ENST00000355396 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
SUSD1-201ENST00000355396 NARFQ9UHQ1 456 aa14.82□□□□□ -0.04
SUSD1-201ENST00000355396 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa14.81□□□□□ -0.04
SUSD1-201ENST00000355396 MYL6BP14649 208 aa14.81□□□□□ -0.04
SUSD1-201ENST00000355396 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
SUSD1-201ENST00000355396 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
SUSD1-201ENST00000355396 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
SUSD1-201ENST00000355396 ANXA1P04083 346 aa14.81□□□□□ -0.04
SUSD1-201ENST00000355396 ARHGAP45Q92619 1136 aa14.81□□□□□ -0.04
SUSD1-201ENST00000355396 PTPRCP08575 1304 aa14.8□□□□□ -0.04
SUSD1-201ENST00000355396 CAMTA2O94983 1202 aa14.8□□□□□ -0.04
SUSD1-201ENST00000355396 COPS6Q7L5N1 327 aa14.8□□□□□ -0.04
SUSD1-201ENST00000355396 G2E3Q7L622 706 aa14.8□□□□□ -0.04
SUSD1-201ENST00000355396 XAGE3Q8WTP9 111 aa14.8□□□□□ -0.04
SUSD1-201ENST00000355396 RCAN3Q9UKA8 241 aa14.8□□□□□ -0.04
SUSD1-201ENST00000355396 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
SUSD1-201ENST00000355396 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa14.8□□□□□ -0.04
SUSD1-201ENST00000355396 FLIIQ13045 1269 aa14.8□□□□□ -0.04
SUSD1-201ENST00000355396 NUP98P52948 1817 aa14.8□□□□□ -0.04
SUSD1-201ENST00000355396 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.5 ms