RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000343605.4

SLC35E4-201, Transcript of solute carrier family 35 member E4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC35E4, Length 2,714 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35E4-201ENST00000343605 ATP8B2P98198 1209 aa22.19■■□□□ 1.14
SLC35E4-201ENST00000343605 PREX1Q8TCU6 1659 aa22.19■■□□□ 1.14
SLC35E4-201ENST00000343605 AK2P54819 239 aa22.19■■□□□ 1.14
SLC35E4-201ENST00000343605 NUTM1Q86Y26 1132 aa22.19■■□□□ 1.14
SLC35E4-201ENST00000343605 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
SLC35E4-201ENST00000343605 FUCA2Q9BTY2 467 aa22.19■■□□□ 1.14
SLC35E4-201ENST00000343605 SMC3Q9UQE7 1217 aa22.19■■□□□ 1.14
SLC35E4-201ENST00000343605 GNAI3P08754 354 aa22.18■■□□□ 1.14
SLC35E4-201ENST00000343605 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
SLC35E4-201ENST00000343605 NECTIN2Q92692 538 aa22.17■■□□□ 1.14
SLC35E4-201ENST00000343605 SNX14Q9Y5W7 946 aa22.17■■□□□ 1.14
SLC35E4-201ENST00000343605 FOXO3O43524 673 aa22.17■■□□□ 1.14
SLC35E4-201ENST00000343605 STK31Q9BXU1 1019 aa22.17■■□□□ 1.14
SLC35E4-201ENST00000343605 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SLC35E4-201ENST00000343605 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SLC35E4-201ENST00000343605 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa22.16■■□□□ 1.14
SLC35E4-201ENST00000343605 CRB1P82279 1406 aa22.16■■□□□ 1.14
SLC35E4-201ENST00000343605 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP22.16■■□□□ 1.14
SLC35E4-201ENST00000343605 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
SLC35E4-201ENST00000343605 RUFY3Q7L099 469 aa22.16■■□□□ 1.14
SLC35E4-201ENST00000343605 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa22.16■■□□□ 1.14
SLC35E4-201ENST00000343605 CPA1P15085 419 aa22.15■■□□□ 1.14
SLC35E4-201ENST00000343605 RASEFQ8IZ41 740 aa22.15■■□□□ 1.14
SLC35E4-201ENST00000343605 TTC14Q96N46 770 aa22.15■■□□□ 1.14
SLC35E4-201ENST00000343605 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa22.14■■□□□ 1.13
SLC35E4-201ENST00000343605 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
SLC35E4-201ENST00000343605 RAD50Q92878 1312 aa22.14■■□□□ 1.13
SLC35E4-201ENST00000343605 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa22.14■■□□□ 1.13
SLC35E4-201ENST00000343605 SOX12O15370 315 aa22.14■■□□□ 1.13
SLC35E4-201ENST00000343605 TPM3P06753 285 aa22.14■■□□□ 1.13
SLC35E4-201ENST00000343605 DLC1Q96QB1 1528 aa22.13■■□□□ 1.13
SLC35E4-201ENST00000343605 FLIIQ13045 1269 aa22.13■■□□□ 1.13
SLC35E4-201ENST00000343605 CCDC61Q9Y6R9 512 aa22.13■■□□□ 1.13
SLC35E4-201ENST00000343605 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
SLC35E4-201ENST00000343605 LARGE1O95461 756 aa22.13■■□□□ 1.13
SLC35E4-201ENST00000343605 CCDC83Q8IWF9 413 aa22.13■■□□□ 1.13
SLC35E4-201ENST00000343605 CHMP3Q9Y3E7 222 aa22.13■■□□□ 1.13
SLC35E4-201ENST00000343605 TXNDC2Q86VQ3 553 aa22.12■■□□□ 1.13
SLC35E4-201ENST00000343605 SGSM2O43147 1006 aa22.12■■□□□ 1.13
SLC35E4-201ENST00000343605 GJB2P29033 226 aa22.12■■□□□ 1.13
SLC35E4-201ENST00000343605 ANKRD7Q92527 254 aa22.12■■□□□ 1.13
SLC35E4-201ENST00000343605 NUTM2FA1L443 756 aa22.11■■□□□ 1.13
SLC35E4-201ENST00000343605 IGSF3O75054 1194 aa22.11■■□□□ 1.13
SLC35E4-201ENST00000343605 CCDC192P0DO97 292 aa22.11■■□□□ 1.13
SLC35E4-201ENST00000343605 PTGS1P23219 599 aa22.11■■□□□ 1.13
SLC35E4-201ENST00000343605 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SLC35E4-201ENST00000343605 CASTP20810 708 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SLC35E4-201ENST00000343605 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
SLC35E4-201ENST00000343605 SPG7Q9UQ90 795 aa22.1■■□□□ 1.13
SLC35E4-201ENST00000343605 AOX1Q06278 1338 aa22.1■■□□□ 1.13
SLC35E4-201ENST00000343605 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SLC35E4-201ENST00000343605 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SLC35E4-201ENST00000343605 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SLC35E4-201ENST00000343605 MTMR6Q9Y217 621 aa22.09■■□□□ 1.13
SLC35E4-201ENST00000343605 NRKQ7Z2Y5 1582 aa22.09■■□□□ 1.13
SLC35E4-201ENST00000343605 KIF20AO95235 890 aa22.09■■□□□ 1.13
SLC35E4-201ENST00000343605 MON2Q7Z3U7 1717 aa22.08■■□□□ 1.13
SLC35E4-201ENST00000343605 SURF6O75683 361 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
SLC35E4-201ENST00000343605 CTIFO43310 598 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
SLC35E4-201ENST00000343605 CAMK4Q16566 473 aa22.08■■□□□ 1.13
SLC35E4-201ENST00000343605 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
SLC35E4-201ENST00000343605 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
SLC35E4-201ENST00000343605 PI4K2BQ8TCG2 481 aa22.07■■□□□ 1.12
SLC35E4-201ENST00000343605 LUZP1Q86V48 1076 aa22.07■■□□□ 1.12
SLC35E4-201ENST00000343605 USP44Q9H0E7 712 aa22.07■■□□□ 1.12
SLC35E4-201ENST00000343605 HYPKQ9NX55 129 aa22.07■■□□□ 1.12
SLC35E4-201ENST00000343605 CCDC30Q5VVM6 783 aa22.06■■□□□ 1.12
SLC35E4-201ENST00000343605 DRC7Q8IY82 874 aa22.06■■□□□ 1.12
SLC35E4-201ENST00000343605 C3P01024 1663 aa22.06■■□□□ 1.12
SLC35E4-201ENST00000343605 CNTROBQ8N137 903 aa22.06■■□□□ 1.12
SLC35E4-201ENST00000343605 FAM200AQ8TCP9 573 aa22.06■■□□□ 1.12
SLC35E4-201ENST00000343605 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
SLC35E4-201ENST00000343605 MAP3K19Q56UN5 1328 aa22.05■■□□□ 1.12
SLC35E4-201ENST00000343605 LRMPQ12912 555 aa22.05■■□□□ 1.12
SLC35E4-201ENST00000343605 CCDC186Q7Z3E2 898 aa22.05■■□□□ 1.12
SLC35E4-201ENST00000343605 RHPN1Q8TCX5 695 aa22.05■■□□□ 1.12
SLC35E4-201ENST00000343605 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
SLC35E4-201ENST00000343605 ARHGEF10O15013 1369 aa22.04■■□□□ 1.12
SLC35E4-201ENST00000343605 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
SLC35E4-201ENST00000343605 MAP3K11Q16584 847 aa22.04■■□□□ 1.12
SLC35E4-201ENST00000343605 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa22.04■■□□□ 1.12
SLC35E4-201ENST00000343605 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
SLC35E4-201ENST00000343605 PDRG1Q9NUG6 133 aa22.04■■□□□ 1.12
SLC35E4-201ENST00000343605 SSH3Q8TE77 659 aa22.04■■□□□ 1.12
SLC35E4-201ENST00000343605 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
SLC35E4-201ENST00000343605 TYRO3Q06418 890 aa22.03■■□□□ 1.12
SLC35E4-201ENST00000343605 ITSN1Q15811 1721 aa22.03■■□□□ 1.12
SLC35E4-201ENST00000343605 CKAP2LQ8IYA6 745 aa22.03■■□□□ 1.12
SLC35E4-201ENST00000343605 NUP62CLQ9H1M0 184 aa22.03■■□□□ 1.12
SLC35E4-201ENST00000343605 MRVI1Q9Y6F6 885 aa22.03■■□□□ 1.12
SLC35E4-201ENST00000343605 ADCK5Q3MIX3 580 aa22.03■■□□□ 1.12
SLC35E4-201ENST00000343605 TTC6Q86TZ1 520 aa22.03■■□□□ 1.12
SLC35E4-201ENST00000343605 FERMT3Q86UX7 667 aa22.03■■□□□ 1.12
SLC35E4-201ENST00000343605 NECAB1Q8N987 351 aa22.03■■□□□ 1.12
SLC35E4-201ENST00000343605 NRBP1Q9UHY1 535 aa22.03■■□□□ 1.12
SLC35E4-201ENST00000343605 LIG1P18858 919 aa22.02■■□□□ 1.12
SLC35E4-201ENST00000343605 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa22.02■■□□□ 1.12
SLC35E4-201ENST00000343605 PRR36Q9H6K5 1346 aa22.02■■□□□ 1.12
SLC35E4-201ENST00000343605 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
SLC35E4-201ENST00000343605 RAB11FIP3O75154 756 aa22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.4 ms