RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
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RABGGTB-201ENST00000319942 NBPF4Q96M43 638 aa13.01□□□□□ -0.33
RABGGTB-201ENST00000319942 TNS3Q68CZ2 1445 aa13□□□□□ -0.33
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RABGGTB-201ENST00000319942 MS4A1P11836 297 aa13□□□□□ -0.33
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RABGGTB-201ENST00000319942 C20orf194Q5TEA3 1177 aa12.94□□□□□ -0.34
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RABGGTB-201ENST00000319942 IL17REQ8NFR9 667 aa12.92□□□□□ -0.34
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RABGGTB-201ENST00000319942 MAP3K5Q99683 1374 aa12.91□□□□□ -0.34
RABGGTB-201ENST00000319942 COL9A1P20849 921 aa12.91□□□□□ -0.34
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RABGGTB-201ENST00000319942 TYW1BQ6NUM6 668 aa12.88□□□□□ -0.35
RABGGTB-201ENST00000319942 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa12.88□□□□□ -0.35
RABGGTB-201ENST00000319942 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
RABGGTB-201ENST00000319942 KIAA1468Q9P260 1216 aa12.88□□□□□ -0.35
RABGGTB-201ENST00000319942 COG6Q9Y2V7 657 aa12.88□□□□□ -0.35
RABGGTB-201ENST00000319942 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
RABGGTB-201ENST00000319942 LCE2BO14633 110 aa12.87□□□□□ -0.35
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