RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316939.2

GADD45GIP1-201, Transcript of GADD45G interacting protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GADD45GIP1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
GADD45GIP1-201ENST00000316939 USP35Q9P2H5 1018 aa27.37■■□□□ 1.97
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ANXA1P04083 346 aa27.36■■□□□ 1.97
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa27.36■■□□□ 1.97
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LRP6O75581 1613 aa27.36■■□□□ 1.97
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KCPQ6ZWJ8 1503 aa27.36■■□□□ 1.97
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TNS2Q63HR2 1409 aa27.35■■□□□ 1.97
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BEND3Q5T5X7 828 aa27.35■■□□□ 1.97
GADD45GIP1-201ENST00000316939 USP44Q9H0E7 712 aa27.35■■□□□ 1.97
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HMMRO75330 724 aa27.34■■□□□ 1.97
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KSR2Q6VAB6 950 aa27.34■■□□□ 1.97
GADD45GIP1-201ENST00000316939 UBAP1LF5GYI3 381 aa27.33■■□□□ 1.97
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ANKRD45Q5TZF3 282 aa27.33■■□□□ 1.97
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LNPKQ9C0E8 428 aa27.32■■□□□ 1.96
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ITGB4P16144 1822 aa27.32■■□□□ 1.96
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ADAMTS2O95450 1211 aa27.31■■□□□ 1.96
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DDX58O95786 925 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
GADD45GIP1-201ENST00000316939 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLIT2O94813 1529 aa27.3■■□□□ 1.96
GADD45GIP1-201ENST00000316939 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa27.3■■□□□ 1.96
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ERBB4Q15303 1308 aa27.3■■□□□ 1.96
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ALDH1L1O75891 902 aa27.29■■□□□ 1.96
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LRP10Q7Z4F1 713 aa27.29■■□□□ 1.96
GADD45GIP1-201ENST00000316939 USP16Q9Y5T5 823 aa27.29■■□□□ 1.96
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa27.28■■□□□ 1.96
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ATP8B2P98198 1209 aa27.26■■□□□ 1.95
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TMOD3Q9NYL9 352 aa27.26■■□□□ 1.95
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MSH5O43196 834 aa27.25■■□□□ 1.95
GADD45GIP1-201ENST00000316939 JCADQ9P266 1359 aa27.24■■□□□ 1.95
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EXOC5O00471 708 aa27.24■■□□□ 1.95
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LINS1Q8NG48 757 aa27.24■■□□□ 1.95
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP27.23■■□□□ 1.95
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP27.23■■□□□ 1.95
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP27.23■■□□□ 1.95
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MYL6BP14649 208 aa27.22■■□□□ 1.95
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa27.22■■□□□ 1.95
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa27.22■■□□□ 1.95
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa27.22■■□□□ 1.95
GADD45GIP1-201ENST00000316939 XAGE3Q8WTP9 111 aa27.22■■□□□ 1.95
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP27.21■■□□□ 1.95
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BMP2KLQ5H9B9 411 aa27.21■■□□□ 1.95
GADD45GIP1-201ENST00000316939 COPS6Q7L5N1 327 aa27.21■■□□□ 1.95
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa27.2■■□□□ 1.95
GADD45GIP1-201ENST00000316939 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.95
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.95
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HDAC5Q9UQL6 1122 aa27.2■■□□□ 1.95
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BCL9O00512 1426 aa27.2■■□□□ 1.94
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SSH3Q8TE77 659 aa27.2■■□□□ 1.94
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PIGBQ92521 554 aa27.2■■□□□ 1.94
GADD45GIP1-201ENST00000316939 UTYO14607 1347 aa27.19■■□□□ 1.94
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DOT1LQ8TEK3 1739 aa27.19■■□□□ 1.94
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RIC3Q7Z5B4 369 aa27.19■■□□□ 1.94
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BARGINQ6ZT62 677 aa27.18■■□□□ 1.94
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
GADD45GIP1-201ENST00000316939 VSIG10Q8N0Z9 540 aa27.17■■□□□ 1.94
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
GADD45GIP1-201ENST00000316939 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
GADD45GIP1-201ENST00000316939 POLA2Q14181 598 aa27.17■■□□□ 1.94
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa27.17■■□□□ 1.94
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NUP188Q5SRE5 1749 aa27.16■■□□□ 1.94
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NEXNQ0ZGT2 675 aa27.16■■□□□ 1.94
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa27.16■■□□□ 1.94
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NBPF26B4DH59 902 aa27.15■■□□□ 1.94
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MTX1Q13505 466 aa27.15■■□□□ 1.94
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NBPF14Q5TI25 921 aa27.15■■□□□ 1.94
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NBPF15Q8N660 670 aa27.15■■□□□ 1.94
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
GADD45GIP1-201ENST00000316939 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IGKV5-2P06315 115 aa27.14■■□□□ 1.94
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ATG3Q9NT62 314 aa27.14■■□□□ 1.94
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GRM8O00222 908 aa27.14■■□□□ 1.93
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DDB1Q16531 1140 aa27.14■■□□□ 1.93
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa27.14■■□□□ 1.93
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.93
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SEC24BO95487 1268 aa27.13■■□□□ 1.93
GADD45GIP1-201ENST00000316939 UNC5CLQ8IV45 518 aa27.13■■□□□ 1.93
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PLBD2Q8NHP8 589 aa27.13■■□□□ 1.93
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CERKQ8TCT0 537 aa27.13■■□□□ 1.93
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ASAP1Q9ULH1 1129 aa27.13■■□□□ 1.93
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NEURL1BA8MQ27 555 aa27.12■■□□□ 1.93
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa27.12■■□□□ 1.93
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa27.12■■□□□ 1.93
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BCL9LQ86UU0 1499 aa27.12■■□□□ 1.93
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LRRCC1Q9C099 1032 aa27.1■■□□□ 1.93
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SRGAP3O43295 1099 aa27.09■■□□□ 1.93
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GCKRQ14397 625 aa27.09■■□□□ 1.93
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KAT6BQ8WYB5 2073 aa27.09■■□□□ 1.93
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MYD88Q99836 296 aa27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.9 ms