RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311694.7

HECTD4-201, Transcript of HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 2

Gene HECTD4, Length 2,734 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4-201ENST00000311694 LMBRD1Q9NUN5 540 aa9.66□□□□□ -0.86
HECTD4-201ENST00000311694 MST1RQ04912 1400 aa9.65□□□□□ -0.86
HECTD4-201ENST00000311694 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
HECTD4-201ENST00000311694 C1orf141Q5JVX7 400 aa9.65□□□□□ -0.86
HECTD4-201ENST00000311694 CADPS2Q86UW7 1296 aa9.65□□□□□ -0.86
HECTD4-201ENST00000311694 CHD1LQ86WJ1 897 aa9.65□□□□□ -0.86
HECTD4-201ENST00000311694 ZNF710Q8N1W2 664 aa9.65□□□□□ -0.86
HECTD4-201ENST00000311694 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
HECTD4-201ENST00000311694 ANXA1P04083 346 aa9.65□□□□□ -0.86
HECTD4-201ENST00000311694 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
HECTD4-201ENST00000311694 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
HECTD4-201ENST00000311694 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
HECTD4-201ENST00000311694 CCDC39Q9UFE4 941 aa9.65□□□□□ -0.86
HECTD4-201ENST00000311694 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa9.64□□□□□ -0.87
HECTD4-201ENST00000311694 CCDC30Q5VVM6 783 aa9.64□□□□□ -0.87
HECTD4-201ENST00000311694 RGS12O14924 1447 aa9.64□□□□□ -0.87
HECTD4-201ENST00000311694 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
HECTD4-201ENST00000311694 FLIIQ13045 1269 aa9.64□□□□□ -0.87
HECTD4-201ENST00000311694 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
HECTD4-201ENST00000311694 PTPRCP08575 1304 aa9.64□□□□□ -0.87
HECTD4-201ENST00000311694 BTBD11A6QL63 1104 aa9.63□□□□□ -0.87
HECTD4-201ENST00000311694 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
HECTD4-201ENST00000311694 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP9.63□□□□□ -0.87
HECTD4-201ENST00000311694 NPHP3Q7Z494 1330 aa9.63□□□□□ -0.87
HECTD4-201ENST00000311694 USP54Q70EL1 1684 aa9.63□□□□□ -0.87
HECTD4-201ENST00000311694 BMP2KLQ5H9B9 411 aa9.63□□□□□ -0.87
HECTD4-201ENST00000311694 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
HECTD4-201ENST00000311694 ERBB3P21860 1342 aa9.63□□□□□ -0.87
HECTD4-201ENST00000311694 PXDNQ92626 1479 aa9.63□□□□□ -0.87
HECTD4-201ENST00000311694 RGPD5Q99666 1765 aa9.63□□□□□ -0.87
HECTD4-201ENST00000311694 CBX1P83916 185 aa9.62□□□□□ -0.87
HECTD4-201ENST00000311694 AKAP4Q5JQC9 854 aa9.62□□□□□ -0.87
HECTD4-201ENST00000311694 MCTP1Q6DN14 999 aa9.62□□□□□ -0.87
HECTD4-201ENST00000311694 GCC1Q96CN9 775 aa9.62□□□□□ -0.87
HECTD4-201ENST00000311694 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
HECTD4-201ENST00000311694 ATP2B3Q16720 1220 aa9.62□□□□□ -0.87
HECTD4-201ENST00000311694 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa9.62□□□□□ -0.87
HECTD4-201ENST00000311694 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
HECTD4-201ENST00000311694 TMEM51Q9NW97 253 aa9.62□□□□□ -0.87
HECTD4-201ENST00000311694 RNMTO43148 476 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
HECTD4-201ENST00000311694 BRINP3Q76B58 766 aa9.62□□□□□ -0.87
HECTD4-201ENST00000311694 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
HECTD4-201ENST00000311694 PRIMPOLQ96LW4 560 aa9.62□□□□□ -0.87
HECTD4-201ENST00000311694 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
HECTD4-201ENST00000311694 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa9.61□□□□□ -0.87
HECTD4-201ENST00000311694 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
HECTD4-201ENST00000311694 AMOTQ4VCS5 1084 aa9.61□□□□□ -0.87
HECTD4-201ENST00000311694 CEP85Q6P2H3 762 aa9.61□□□□□ -0.87
HECTD4-201ENST00000311694 LRSAM1Q6UWE0 723 aa9.61□□□□□ -0.87
HECTD4-201ENST00000311694 GPT2Q8TD30 523 aa9.61□□□□□ -0.87
HECTD4-201ENST00000311694 CHPF2Q9P2E5 772 aa9.61□□□□□ -0.87
HECTD4-201ENST00000311694 SLIT3O75094 1523 aa9.61□□□□□ -0.87
HECTD4-201ENST00000311694 NUCB2P80303 420 aa9.61□□□□□ -0.87
HECTD4-201ENST00000311694 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
HECTD4-201ENST00000311694 SLC39A6Q13433 755 aa9.61□□□□□ -0.87
HECTD4-201ENST00000311694 TSC1Q92574 1164 aa9.61□□□□□ -0.87
HECTD4-201ENST00000311694 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
HECTD4-201ENST00000311694 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa9.6□□□□□ -0.87
HECTD4-201ENST00000311694 ANKRD44Q8N8A2 993 aa9.6□□□□□ -0.87
HECTD4-201ENST00000311694 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
HECTD4-201ENST00000311694 CCT4P50991 539 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
HECTD4-201ENST00000311694 KIAA2012Q0VF49 1180 aa9.6□□□□□ -0.87
HECTD4-201ENST00000311694 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
HECTD4-201ENST00000311694 SLAIN2Q9P270 581 aa9.6□□□□□ -0.87
HECTD4-201ENST00000311694 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
HECTD4-201ENST00000311694 KIF1AQ12756 1690 aa9.59□□□□□ -0.87
HECTD4-201ENST00000311694 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP9.59□□□□□ -0.87
HECTD4-201ENST00000311694 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa9.59□□□□□ -0.87
HECTD4-201ENST00000311694 TATP17735 454 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
HECTD4-201ENST00000311694 PRDM11Q9NQV5 511 aa9.59□□□□□ -0.87
HECTD4-201ENST00000311694 TMEM63CQ9P1W3 806 aa9.59□□□□□ -0.87
HECTD4-201ENST00000311694 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
HECTD4-201ENST00000311694 LRRC37A3O60309 1634 aa9.59□□□□□ -0.87
HECTD4-201ENST00000311694 ATP10DQ9P241 1426 aa9.58□□□□□ -0.88
HECTD4-201ENST00000311694 DCTPP1Q9H773 170 aa9.58□□□□□ -0.88
HECTD4-201ENST00000311694 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa9.58□□□□□ -0.88
HECTD4-201ENST00000311694 LMTK3Q96Q04 1460 aa9.58□□□□□ -0.88
HECTD4-201ENST00000311694 TNS3Q68CZ2 1445 aa9.58□□□□□ -0.88
HECTD4-201ENST00000311694 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
HECTD4-201ENST00000311694 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
HECTD4-201ENST00000311694 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa9.58□□□□□ -0.88
HECTD4-201ENST00000311694 ALS2Q96Q42 1657 aa9.57□□□□□ -0.88
HECTD4-201ENST00000311694 PI4KAP2A4QPH2 592 aa9.57□□□□□ -0.88
HECTD4-201ENST00000311694 GNAI2P04899 355 aa9.57□□□□□ -0.88
HECTD4-201ENST00000311694 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
HECTD4-201ENST00000311694 PKP1Q13835 747 aa9.57□□□□□ -0.88
HECTD4-201ENST00000311694 PROSER3Q2NL68 480 aa9.57□□□□□ -0.88
HECTD4-201ENST00000311694 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa9.57□□□□□ -0.88
HECTD4-201ENST00000311694 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa9.57□□□□□ -0.88
HECTD4-201ENST00000311694 STRN4Q9NRL3 753 aa9.57□□□□□ -0.88
HECTD4-201ENST00000311694 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
HECTD4-201ENST00000311694 DCCP43146 1447 aa9.57□□□□□ -0.88
HECTD4-201ENST00000311694 SYCE3A1L190 88 aa9.57□□□□□ -0.88
HECTD4-201ENST00000311694 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
HECTD4-201ENST00000311694 TAF3Q5VWG9 929 aa9.57□□□□□ -0.88
HECTD4-201ENST00000311694 PIBF1Q8WXW3 757 aa9.57□□□□□ -0.88
HECTD4-201ENST00000311694 BABAM1Q9NWV8 329 aa9.57□□□□□ -0.88
HECTD4-201ENST00000311694 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa9.56□□□□□ -0.88
HECTD4-201ENST00000311694 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
HECTD4-201ENST00000311694 ZDHHC9Q9Y397 364 aa9.56□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.5 ms