RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000308271.13

USP48-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP48, Length 4,595 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP48-201ENST00000308271 CCDC186Q7Z3E2 898 aa22.62■■□□□ 1.21
USP48-201ENST00000308271 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa22.62■■□□□ 1.21
USP48-201ENST00000308271 FAM83GA6ND36 823 aa22.62■■□□□ 1.21
USP48-201ENST00000308271 CDKL5O76039 1030 aa22.62■■□□□ 1.21
USP48-201ENST00000308271 F13A1P00488 732 aa22.61■■□□□ 1.21
USP48-201ENST00000308271 CCDC158Q5M9N0 1113 aa22.61■■□□□ 1.21
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USP48-201ENST00000308271 C8orf58Q8NAV2 365 aa22.61■■□□□ 1.21
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USP48-201ENST00000308271 ZNF521Q96K83 1311 aa22.55■■□□□ 1.2
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USP48-201ENST00000308271 SKILP12757 684 aa22.54■■□□□ 1.2
USP48-201ENST00000308271 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa22.54■■□□□ 1.2
USP48-201ENST00000308271 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
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USP48-201ENST00000308271 TMC6Q7Z403 805 aa22.53■■□□□ 1.2
USP48-201ENST00000308271 USP8P40818 1118 aa22.53■■□□□ 1.2
USP48-201ENST00000308271 C8orf76Q96K31 380 aa22.53■■□□□ 1.2
USP48-201ENST00000308271 TYRO3Q06418 890 aa22.52■■□□□ 1.2
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USP48-201ENST00000308271 PIK3R4Q99570 1358 aa22.51■■□□□ 1.19
USP48-201ENST00000308271 GAS2L3Q86XJ1 694 aa22.51■■□□□ 1.19
USP48-201ENST00000308271 NPHP3Q7Z494 1330 aa22.51■■□□□ 1.19
USP48-201ENST00000308271 KIAA0754O94854 1291 aa22.51■■□□□ 1.19
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USP48-201ENST00000308271 DEF6Q9H4E7 631 aa22.51■■□□□ 1.19
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USP48-201ENST00000308271 OGFRQ9NZT2 677 aa22.5■■□□□ 1.19
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USP48-201ENST00000308271 CHMLP26374 656 aa22.5■■□□□ 1.19
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USP48-201ENST00000308271 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.5■■□□□ 1.19
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USP48-201ENST00000308271 VPS37DQ86XT2 251 aa22.5■■□□□ 1.19
USP48-201ENST00000308271 POLKQ9UBT6 870 aa22.5■■□□□ 1.19
USP48-201ENST00000308271 PLCH2O75038 1416 aa22.49■■□□□ 1.19
USP48-201ENST00000308271 CEP126Q9P2H0 1117 aa22.49■■□□□ 1.19
USP48-201ENST00000308271 KIF20AO95235 890 aa22.49■■□□□ 1.19
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