RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296026.4

CXCL3-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CXCL3, Length 1,075 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3-201ENST00000296026 GNAT3A8MTJ3 354 aa26.38■■□□□ 1.81
CXCL3-201ENST00000296026 TTC5Q8N0Z6 440 aa26.38■■□□□ 1.81
CXCL3-201ENST00000296026 PIM2Q9P1W9 311 aa26.38■■□□□ 1.81
CXCL3-201ENST00000296026 TEFQ10587 303 aa26.37■■□□□ 1.81
CXCL3-201ENST00000296026 IL17REQ8NFR9 667 aa26.37■■□□□ 1.81
CXCL3-201ENST00000296026 NARFQ9UHQ1 456 aa26.37■■□□□ 1.81
CXCL3-201ENST00000296026 CFAP53Q96M91 514 aa26.35■■□□□ 1.81
CXCL3-201ENST00000296026 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa26.35■■□□□ 1.81
CXCL3-201ENST00000296026 CANXP27824 592 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
CXCL3-201ENST00000296026 CHRNA5P30532 468 aa26.34■■□□□ 1.81
CXCL3-201ENST00000296026 STARD3NLO95772 234 aa26.33■■□□□ 1.81
CXCL3-201ENST00000296026 NFIXQ14938 502 aa26.33■■□□□ 1.81
CXCL3-201ENST00000296026 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
CXCL3-201ENST00000296026 PRKAR2BP31323 418 aa26.32■■□□□ 1.8
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF790Q6PG37 636 aa26.32■■□□□ 1.8
CXCL3-201ENST00000296026 BCL2L12Q9HB09 334 aa26.32■■□□□ 1.8
CXCL3-201ENST00000296026 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
CXCL3-201ENST00000296026 KIF3CO14782 793 aa26.31■■□□□ 1.8
CXCL3-201ENST00000296026 PHACTR3Q96KR7 559 aa26.31■■□□□ 1.8
CXCL3-201ENST00000296026 RSPH6AQ9H0K4 717 aa26.31■■□□□ 1.8
CXCL3-201ENST00000296026 HEG1Q9ULI3 1381 aa26.31■■□□□ 1.8
CXCL3-201ENST00000296026 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
CXCL3-201ENST00000296026 NUDCQ9Y266 331 aa26.29■■□□□ 1.8
CXCL3-201ENST00000296026 NRXN2Q9P2S2 1712 aa26.28■■□□□ 1.8
CXCL3-201ENST00000296026 SERPINB2P05120 415 aa26.28■■□□□ 1.8
CXCL3-201ENST00000296026 PPP2R1AP30153 589 aa26.28■■□□□ 1.8
CXCL3-201ENST00000296026 EIF5P55010 431 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
CXCL3-201ENST00000296026 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
CXCL3-201ENST00000296026 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa26.28■■□□□ 1.8
CXCL3-201ENST00000296026 C9orf131Q5VYM1 1079 aa26.27■■□□□ 1.8
CXCL3-201ENST00000296026 A0A087WZG4 1122 aa26.26■■□□□ 1.79
CXCL3-201ENST00000296026 HSPA6P17066 643 aa26.26■■□□□ 1.79
CXCL3-201ENST00000296026 FMNL2Q96PY5 1086 aa26.26■■□□□ 1.79
CXCL3-201ENST00000296026 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
CXCL3-201ENST00000296026 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP26.25■■□□□ 1.79
CXCL3-201ENST00000296026 BTBD11A6QL63 1104 aa26.24■■□□□ 1.79
CXCL3-201ENST00000296026 BICDL1Q6ZP65 573 aa26.24■■□□□ 1.79
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
CXCL3-201ENST00000296026 KCNQ3O43525 872 aa26.23■■□□□ 1.79
CXCL3-201ENST00000296026 NMRK2Q9NPI5 230 aa26.22■■□□□ 1.79
CXCL3-201ENST00000296026 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
CXCL3-201ENST00000296026 RNF181Q9P0P0 153 aa26.21■■□□□ 1.79
CXCL3-201ENST00000296026 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa26.21■■□□□ 1.79
CXCL3-201ENST00000296026 SCN7AQ01118 1682 aa26.2■■□□□ 1.78
CXCL3-201ENST00000296026 A1BGP04217 495 aa26.2■■□□□ 1.78
CXCL3-201ENST00000296026 TBC1D9BQ66K14 1250 aa26.2■■□□□ 1.78
CXCL3-201ENST00000296026 DLEC1Q9Y238 1755 aa26.2■■□□□ 1.78
CXCL3-201ENST00000296026 CARMIL3Q8ND23 1372 aa26.2■■□□□ 1.78
CXCL3-201ENST00000296026 TOMM70O94826 608 aa26.19■■□□□ 1.78
CXCL3-201ENST00000296026 C2CD5Q86YS7 1000 aa26.19■■□□□ 1.78
CXCL3-201ENST00000296026 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
CXCL3-201ENST00000296026 MCM10Q7L590 875 aa26.18■■□□□ 1.78
CXCL3-201ENST00000296026 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
CXCL3-201ENST00000296026 SBF1O95248 1867 aa26.17■■□□□ 1.78
CXCL3-201ENST00000296026 H0YIN7 160 aa26.17■■□□□ 1.78
CXCL3-201ENST00000296026 TTLL6Q8N841 843 aa26.17■■□□□ 1.78
CXCL3-201ENST00000296026 USP16Q9Y5T5 823 aa26.16■■□□□ 1.78
CXCL3-201ENST00000296026 RASSF7Q02833 373 aa26.15■■□□□ 1.78
CXCL3-201ENST00000296026 DCTN1Q14203 1278 aa26.14■■□□□ 1.78
CXCL3-201ENST00000296026 KDM2BQ8NHM5 1336 aa26.14■■□□□ 1.77
CXCL3-201ENST00000296026 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa26.13■■□□□ 1.77
CXCL3-201ENST00000296026 CAMTA2O94983 1202 aa26.13■■□□□ 1.77
CXCL3-201ENST00000296026 PRR5LQ6MZQ0 368 aa26.13■■□□□ 1.77
CXCL3-201ENST00000296026 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa26.13■■□□□ 1.77
CXCL3-201ENST00000296026 CEP350Q5VT06 3117 aa26.12■■□□□ 1.77
CXCL3-201ENST00000296026 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
CXCL3-201ENST00000296026 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
CXCL3-201ENST00000296026 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
CXCL3-201ENST00000296026 CCDC24Q8N4L8 307 aa26.12■■□□□ 1.77
CXCL3-201ENST00000296026 BRIP1Q9BX63 1249 aa26.12■■□□□ 1.77
CXCL3-201ENST00000296026 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
CXCL3-201ENST00000296026 PDE6BP35913 854 aa26.11■■□□□ 1.77
CXCL3-201ENST00000296026 SETDB2Q96T68 719 aa26.11■■□□□ 1.77
CXCL3-201ENST00000296026 BCORQ6W2J9 1755 aa26.1■■□□□ 1.77
CXCL3-201ENST00000296026 LMNB1P20700 586 aa26.1■■□□□ 1.77
CXCL3-201ENST00000296026 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
CXCL3-201ENST00000296026 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa26.1■■□□□ 1.77
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP26.09■■□□□ 1.77
CXCL3-201ENST00000296026 NPHP1O15259 732 aa26.08■■□□□ 1.77
CXCL3-201ENST00000296026 APLP1P51693 650 aa26.08■■□□□ 1.77
CXCL3-201ENST00000296026 PRELPP51888 382 aa26.08■■□□□ 1.77
CXCL3-201ENST00000296026 CNBD1Q8NA66 436 aa26.08■■□□□ 1.77
CXCL3-201ENST00000296026 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
CXCL3-201ENST00000296026 RRAGCQ9HB90 399 aa26.08■■□□□ 1.77
CXCL3-201ENST00000296026 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
CXCL3-201ENST00000296026 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
CXCL3-201ENST00000296026 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
CXCL3-201ENST00000296026 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
CXCL3-201ENST00000296026 NEFMP07197 916 aa26.06■■□□□ 1.76
CXCL3-201ENST00000296026 NFKBIEO00221 500 aa26.05■■□□□ 1.76
CXCL3-201ENST00000296026 ST5P78524 1137 aa26.04■■□□□ 1.76
CXCL3-201ENST00000296026 CLEC4GQ6UXB4 293 aa26.04■■□□□ 1.76
CXCL3-201ENST00000296026 MIS18AQ9NYP9 233 aa26.04■■□□□ 1.76
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
CXCL3-201ENST00000296026 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa26.04■■□□□ 1.76
CXCL3-201ENST00000296026 NBPF26B4DH59 902 aa26.03■■□□□ 1.76
CXCL3-201ENST00000296026 C21orf2O43822 256 aa26.03■■□□□ 1.76
CXCL3-201ENST00000296026 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
CXCL3-201ENST00000296026 NBPF15Q8N660 670 aa26.03■■□□□ 1.76
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