RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294964.5

PKDCC-201, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKDCC, Length 2,502 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-201ENST00000294964 MBD3O95983 291 aa29.85■■■□□ 2.37
PKDCC-201ENST00000294964 AMPHP49418 695 aa29.85■■■□□ 2.37
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PKDCC-201ENST00000294964 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP29.85■■■□□ 2.37
PKDCC-201ENST00000294964 PHF8Q9UPP1 1060 aa29.85■■■□□ 2.37
PKDCC-201ENST00000294964 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP29.84■■■□□ 2.37
PKDCC-201ENST00000294964 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP29.84■■■□□ 2.37
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PKDCC-201ENST00000294964 RGS12O14924 1447 aa29.84■■■□□ 2.37
PKDCC-201ENST00000294964 SPDYE4A6NLX3 237 aa29.83■■■□□ 2.37
PKDCC-201ENST00000294964 PDE4CQ08493 712 aa29.83■■■□□ 2.37
PKDCC-201ENST00000294964 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP29.83■■■□□ 2.37
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PKDCC-201ENST00000294964 BCL2L12Q9HB09 334 aa29.83■■■□□ 2.37
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PKDCC-201ENST00000294964 TSPYL4Q9UJ04 414 aa29.83■■■□□ 2.37
PKDCC-201ENST00000294964 SSH2Q76I76 1423 aa29.82■■■□□ 2.36
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PKDCC-201ENST00000294964 CRB1P82279 1406 aa29.79■■■□□ 2.36
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PKDCC-201ENST00000294964 PDCL2Q8N4E4 241 aa29.78■■■□□ 2.36
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PKDCC-201ENST00000294964 TTC22Q5TAA0 569 aa29.74■■■□□ 2.35
PKDCC-201ENST00000294964 USHBP1Q8N6Y0 703 aa29.74■■■□□ 2.35
PKDCC-201ENST00000294964 USP25Q9UHP3 1055 aa29.74■■■□□ 2.35
PKDCC-201ENST00000294964 PIK3C2AO00443 1686 aa29.73■■■□□ 2.35
PKDCC-201ENST00000294964 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP29.73■■■□□ 2.35
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PKDCC-201ENST00000294964 KIAA0232Q92628 1395 aa29.71■■■□□ 2.35
PKDCC-201ENST00000294964 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP29.71■■■□□ 2.35
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PKDCC-201ENST00000294964 RGPD1P0DJD0 1748 aa29.7■■■□□ 2.35
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PKDCC-201ENST00000294964 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP29.7■■■□□ 2.34
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PKDCC-201ENST00000294964 SDSP20132 328 aa29.69■■■□□ 2.34
PKDCC-201ENST00000294964 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP29.69■■■□□ 2.34
PKDCC-201ENST00000294964 ADCY5O95622 1261 aa29.69■■■□□ 2.34
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PKDCC-201ENST00000294964 ARHGEF10O15013 1369 aa29.68■■■□□ 2.34
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PKDCC-201ENST00000294964 GDPD2Q9HCC8 539 aa29.62■■■□□ 2.33
PKDCC-201ENST00000294964 USP54Q70EL1 1684 aa29.62■■■□□ 2.33
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PKDCC-201ENST00000294964 NPHP3Q7Z494 1330 aa29.57■■■□□ 2.32
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PKDCC-201ENST00000294964 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP29.57■■■□□ 2.32
PKDCC-201ENST00000294964 PYCARDQ9ULZ3 195 aa29.56■■■□□ 2.32
PKDCC-201ENST00000294964 USP48Q86UV5 1035 aa29.56■■■□□ 2.32
PKDCC-201ENST00000294964 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa29.56■■■□□ 2.32
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