RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273482.10

TRPC1-201, Transcript of transient receptor potential cation channel subfamily C member 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPC1, Length 4,324 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1-201ENST00000273482 SDF4Q9BRK5 362 aa20.28■□□□□ 0.84
TRPC1-201ENST00000273482 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa20.28■□□□□ 0.84
TRPC1-201ENST00000273482 PSMA5P28066 241 aa20.27■□□□□ 0.84
TRPC1-201ENST00000273482 FMNL2Q96PY5 1086 aa20.27■□□□□ 0.84
TRPC1-201ENST00000273482 CNNM1Q9NRU3 951 aa20.27■□□□□ 0.84
TRPC1-201ENST00000273482 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa20.27■□□□□ 0.84
TRPC1-201ENST00000273482 ABCA9Q8IUA7 1624 aa20.27■□□□□ 0.84
TRPC1-201ENST00000273482 PTPRCP08575 1304 aa20.27■□□□□ 0.84
TRPC1-201ENST00000273482 PRR36Q9H6K5 1346 aa20.27■□□□□ 0.84
TRPC1-201ENST00000273482 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
TRPC1-201ENST00000273482 HS1BP3Q53T59 392 aa20.27■□□□□ 0.84
TRPC1-201ENST00000273482 ERC1Q8IUD2 1116 aa20.27■□□□□ 0.84
TRPC1-201ENST00000273482 TSHZ3Q63HK5 1081 aa20.26■□□□□ 0.83
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TRPC1-201ENST00000273482 MNS1Q8NEH6 495 aa20.26■□□□□ 0.83
TRPC1-201ENST00000273482 EXOC5O00471 708 aa20.26■□□□□ 0.83
TRPC1-201ENST00000273482 SDSP20132 328 aa20.26■□□□□ 0.83
TRPC1-201ENST00000273482 CCDC66A2RUB6 948 aa20.26■□□□□ 0.83
TRPC1-201ENST00000273482 ADCY5O95622 1261 aa20.26■□□□□ 0.83
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TRPC1-201ENST00000273482 ANTXR1Q9H6X2 564 aa20.26■□□□□ 0.83
TRPC1-201ENST00000273482 CCDC57Q2TAC2 916 aa20.26■□□□□ 0.83
TRPC1-201ENST00000273482 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa20.26■□□□□ 0.83
TRPC1-201ENST00000273482 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
TRPC1-201ENST00000273482 FSD2A1L4K1 749 aa20.25■□□□□ 0.83
TRPC1-201ENST00000273482 STARD3NLO95772 234 aa20.25■□□□□ 0.83
TRPC1-201ENST00000273482 BICDL1Q6ZP65 573 aa20.25■□□□□ 0.83
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TRPC1-201ENST00000273482 NUP62CLQ9H1M0 184 aa20.25■□□□□ 0.83
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TRPC1-201ENST00000273482 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
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TRPC1-201ENST00000273482 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
TRPC1-201ENST00000273482 ZNF521Q96K83 1311 aa20.24■□□□□ 0.83
TRPC1-201ENST00000273482 SIRT1Q96EB6 747 aa20.24■□□□□ 0.83
TRPC1-201ENST00000273482 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
TRPC1-201ENST00000273482 ARHGAP45Q92619 1136 aa20.23■□□□□ 0.83
TRPC1-201ENST00000273482 CHMP4CQ96CF2 233 aa20.23■□□□□ 0.83
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TRPC1-201ENST00000273482 NBPF4Q96M43 638 aa20.23■□□□□ 0.83
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TRPC1-201ENST00000273482 A0A087WZG4 1122 aa20.23■□□□□ 0.83
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TRPC1-201ENST00000273482 LGR6Q9HBX8 967 aa20.22■□□□□ 0.83
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TRPC1-201ENST00000273482 MAP3K11Q16584 847 aa20.22■□□□□ 0.83
TRPC1-201ENST00000273482 CREBRFQ8IUR6 639 aa20.22■□□□□ 0.83
TRPC1-201ENST00000273482 CAMK4Q16566 473 aa20.21■□□□□ 0.83
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TRPC1-201ENST00000273482 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa20.21■□□□□ 0.83
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TRPC1-201ENST00000273482 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
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TRPC1-201ENST00000273482 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa20.21■□□□□ 0.83
TRPC1-201ENST00000273482 SBNO1A3KN83 1393 aa20.21■□□□□ 0.83
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TRPC1-201ENST00000273482 CEP126Q9P2H0 1117 aa20.21■□□□□ 0.83
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TRPC1-201ENST00000273482 UBAP1LF5GYI3 381 aa20.2■□□□□ 0.82
TRPC1-201ENST00000273482 COPS6Q7L5N1 327 aa20.2■□□□□ 0.82
TRPC1-201ENST00000273482 CPLX1O14810 134 aa20.2■□□□□ 0.82
TRPC1-201ENST00000273482 CASTP20810 708 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
TRPC1-201ENST00000273482 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP20.2■□□□□ 0.82
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TRPC1-201ENST00000273482 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
TRPC1-201ENST00000273482 SPDYE4A6NLX3 237 aa20.19■□□□□ 0.82
TRPC1-201ENST00000273482 TRDNQ13061 729 aa20.19■□□□□ 0.82
TRPC1-201ENST00000273482 XAGE3Q8WTP9 111 aa20.19■□□□□ 0.82
TRPC1-201ENST00000273482 PIK3R4Q99570 1358 aa20.18■□□□□ 0.82
TRPC1-201ENST00000273482 MPHOSPH8Q99549 860 aa20.18■□□□□ 0.82
TRPC1-201ENST00000273482 BOLA2Q9H3K6 86 aa20.18■□□□□ 0.82
TRPC1-201ENST00000273482 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
TRPC1-201ENST00000273482 USP19O94966 1318 aa20.18■□□□□ 0.82
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