RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000251203.13

PBX4-201, Transcript of PBX homeobox 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PBX4, Length 1,724 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX4-201ENST00000251203 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
PBX4-201ENST00000251203 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
PBX4-201ENST00000251203 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
PBX4-201ENST00000251203 ZNF790Q6PG37 636 aa26.68■■□□□ 1.86
PBX4-201ENST00000251203 FLIIQ13045 1269 aa26.68■■□□□ 1.86
PBX4-201ENST00000251203 SLC39A6Q13433 755 aa26.68■■□□□ 1.86
PBX4-201ENST00000251203 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
PBX4-201ENST00000251203 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
PBX4-201ENST00000251203 ILDR2Q71H61 639 aa26.67■■□□□ 1.86
PBX4-201ENST00000251203 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
PBX4-201ENST00000251203 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa26.67■■□□□ 1.86
PBX4-201ENST00000251203 BRWD3Q6RI45 1802 aa26.66■■□□□ 1.86
PBX4-201ENST00000251203 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
PBX4-201ENST00000251203 CABP4P57796 275 aa26.65■■□□□ 1.86
PBX4-201ENST00000251203 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
PBX4-201ENST00000251203 CHMP4AQ9BY43 222 aa26.65■■□□□ 1.86
PBX4-201ENST00000251203 RGS3P49796 1198 aa26.65■■□□□ 1.86
PBX4-201ENST00000251203 CHPF2Q9P2E5 772 aa26.64■■□□□ 1.85
PBX4-201ENST00000251203 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa26.63■■□□□ 1.85
PBX4-201ENST00000251203 F6X3S4 739 aa26.63■■□□□ 1.85
PBX4-201ENST00000251203 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
PBX4-201ENST00000251203 PAPPAQ13219 1627 aa26.63■■□□□ 1.85
PBX4-201ENST00000251203 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
PBX4-201ENST00000251203 BARGINQ6ZT62 677 aa26.62■■□□□ 1.85
PBX4-201ENST00000251203 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
PBX4-201ENST00000251203 ERVV-2B6SEH9 535 aa26.62■■□□□ 1.85
PBX4-201ENST00000251203 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
PBX4-201ENST00000251203 UBR2Q8IWV8 1755 aa26.61■■□□□ 1.85
PBX4-201ENST00000251203 A0A0G2JS52 829 aa26.61■■□□□ 1.85
PBX4-201ENST00000251203 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
PBX4-201ENST00000251203 SEPT12Q8IYM1 358 aa26.6■■□□□ 1.85
PBX4-201ENST00000251203 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
PBX4-201ENST00000251203 NFKBIBQ15653 356 aa26.59■■□□□ 1.85
PBX4-201ENST00000251203 C1orf115Q9H7X2 142 aa26.59■■□□□ 1.85
PBX4-201ENST00000251203 PXDNLA1KZ92 1463 aa26.59■■□□□ 1.85
PBX4-201ENST00000251203 CCT4P50991 539 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
PBX4-201ENST00000251203 SLC4A10Q6U841 1118 aa26.59■■□□□ 1.85
PBX4-201ENST00000251203 TTC5Q8N0Z6 440 aa26.58■■□□□ 1.85
PBX4-201ENST00000251203 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
PBX4-201ENST00000251203 LAMB4A4D0S4 1761 aa26.58■■□□□ 1.85
PBX4-201ENST00000251203 ANXA1P04083 346 aa26.56■■□□□ 1.84
PBX4-201ENST00000251203 ITGB4P16144 1822 aa26.56■■□□□ 1.84
PBX4-201ENST00000251203 PROSER3Q2NL68 480 aa26.56■■□□□ 1.84
PBX4-201ENST00000251203 TNS2Q63HR2 1409 aa26.55■■□□□ 1.84
PBX4-201ENST00000251203 FMNL2Q96PY5 1086 aa26.55■■□□□ 1.84
PBX4-201ENST00000251203 MEIS3Q99687 375 aa26.54■■□□□ 1.84
PBX4-201ENST00000251203 KCPQ6ZWJ8 1503 aa26.54■■□□□ 1.84
PBX4-201ENST00000251203 BECN1Q14457 450 aa26.53■■□□□ 1.84
PBX4-201ENST00000251203 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
PBX4-201ENST00000251203 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa26.53■■□□□ 1.84
PBX4-201ENST00000251203 GSE1Q14687 1217 aa26.52■■□□□ 1.84
PBX4-201ENST00000251203 SIRT2Q8IXJ6 389 aa26.52■■□□□ 1.84
PBX4-201ENST00000251203 SMC5Q8IY18 1101 aa26.52■■□□□ 1.84
PBX4-201ENST00000251203 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
PBX4-201ENST00000251203 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP26.52■■□□□ 1.84
PBX4-201ENST00000251203 ATP10DQ9P241 1426 aa26.52■■□□□ 1.84
PBX4-201ENST00000251203 EXOC5O00471 708 aa26.51■■□□□ 1.83
PBX4-201ENST00000251203 PDIA6Q15084 440 aa26.51■■□□□ 1.83
PBX4-201ENST00000251203 ADCY9O60503 1353 aa26.5■■□□□ 1.83
PBX4-201ENST00000251203 HYPKQ9NX55 129 aa26.5■■□□□ 1.83
PBX4-201ENST00000251203 USP16Q9Y5T5 823 aa26.49■■□□□ 1.83
PBX4-201ENST00000251203 TMOD3Q9NYL9 352 aa26.48■■□□□ 1.83
PBX4-201ENST00000251203 PI4KAP2A4QPH2 592 aa26.48■■□□□ 1.83
PBX4-201ENST00000251203 DDB1Q16531 1140 aa26.48■■□□□ 1.83
PBX4-201ENST00000251203 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa26.48■■□□□ 1.83
PBX4-201ENST00000251203 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
PBX4-201ENST00000251203 DNAAF4Q8WXU2 420 aa26.47■■□□□ 1.83
PBX4-201ENST00000251203 DOT1LQ8TEK3 1739 aa26.46■■□□□ 1.83
PBX4-201ENST00000251203 FAM182BQ5T319 152 aa26.46■■□□□ 1.83
PBX4-201ENST00000251203 KRT27Q7Z3Y8 459 aa26.46■■□□□ 1.83
PBX4-201ENST00000251203 ANKRD44Q8N8A2 993 aa26.45■■□□□ 1.83
PBX4-201ENST00000251203 CEP85Q6P2H3 762 aa26.45■■□□□ 1.82
PBX4-201ENST00000251203 PIGBQ92521 554 aa26.44■■□□□ 1.82
PBX4-201ENST00000251203 SLC4A3P48751 1232 aa26.43■■□□□ 1.82
PBX4-201ENST00000251203 BEND3Q5T5X7 828 aa26.43■■□□□ 1.82
PBX4-201ENST00000251203 KSR2Q6VAB6 950 aa26.43■■□□□ 1.82
PBX4-201ENST00000251203 LRP10Q7Z4F1 713 aa26.43■■□□□ 1.82
PBX4-201ENST00000251203 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
PBX4-201ENST00000251203 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa26.42■■□□□ 1.82
PBX4-201ENST00000251203 BCL9O00512 1426 aa26.42■■□□□ 1.82
PBX4-201ENST00000251203 GNAI3P08754 354 aa26.42■■□□□ 1.82
PBX4-201ENST00000251203 MYL6BP14649 208 aa26.42■■□□□ 1.82
PBX4-201ENST00000251203 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa26.42■■□□□ 1.82
PBX4-201ENST00000251203 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
PBX4-201ENST00000251203 GCC1Q96CN9 775 aa26.41■■□□□ 1.82
PBX4-201ENST00000251203 USP44Q9H0E7 712 aa26.41■■□□□ 1.82
PBX4-201ENST00000251203 GNAI2P04899 355 aa26.4■■□□□ 1.82
PBX4-201ENST00000251203 NUCB1Q02818 461 aa26.4■■□□□ 1.82
PBX4-201ENST00000251203 ASAP1Q9ULH1 1129 aa26.4■■□□□ 1.82
PBX4-201ENST00000251203 KAT6BQ8WYB5 2073 aa26.4■■□□□ 1.82
PBX4-201ENST00000251203 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
PBX4-201ENST00000251203 XAGE3Q8WTP9 111 aa26.39■■□□□ 1.82
PBX4-201ENST00000251203 TBC1D32Q96NH3 1257 aa26.39■■□□□ 1.82
PBX4-201ENST00000251203 ATG3Q9NT62 314 aa26.39■■□□□ 1.82
PBX4-201ENST00000251203 DDX58O95786 925 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.81
PBX4-201ENST00000251203 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.81
PBX4-201ENST00000251203 ERBB4Q15303 1308 aa26.39■■□□□ 1.81
PBX4-201ENST00000251203 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
PBX4-201ENST00000251203 COPS6Q7L5N1 327 aa26.36■■□□□ 1.81
PBX4-201ENST00000251203 DCTPP1Q9H773 170 aa26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.4 ms