RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000250237.9

QTRT1-201, Transcript of queuine tRNA-ribosyltransferase catalytic subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene QTRT1, Length 1,317 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
QTRT1-201ENST00000250237 MCM10Q7L590 875 aa26.8■■□□□ 1.88
QTRT1-201ENST00000250237 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
QTRT1-201ENST00000250237 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
QTRT1-201ENST00000250237 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa26.79■■□□□ 1.88
QTRT1-201ENST00000250237 CANXP27824 592 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
QTRT1-201ENST00000250237 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
QTRT1-201ENST00000250237 A0A087WZG4 1122 aa26.77■■□□□ 1.88
QTRT1-201ENST00000250237 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
QTRT1-201ENST00000250237 USPL1Q5W0Q7 1092 aa26.75■■□□□ 1.87
QTRT1-201ENST00000250237 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
QTRT1-201ENST00000250237 C10orf71Q711Q0 1435 aa26.73■■□□□ 1.87
QTRT1-201ENST00000250237 DCTN1Q14203 1278 aa26.73■■□□□ 1.87
QTRT1-201ENST00000250237 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP26.73■■□□□ 1.87
QTRT1-201ENST00000250237 NARFQ9UHQ1 456 aa26.73■■□□□ 1.87
QTRT1-201ENST00000250237 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP26.72■■□□□ 1.87
QTRT1-201ENST00000250237 TGFB2P61812 414 aa26.72■■□□□ 1.87
QTRT1-201ENST00000250237 FKBP8Q14318 412 aa26.72■■□□□ 1.87
QTRT1-201ENST00000250237 NFE2L2Q16236 605 aa26.72■■□□□ 1.87
QTRT1-201ENST00000250237 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
QTRT1-201ENST00000250237 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
QTRT1-201ENST00000250237 WWC3Q9ULE0 1092 aa26.7■■□□□ 1.87
QTRT1-201ENST00000250237 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
QTRT1-201ENST00000250237 PLEKHF1Q96S99 279 aa26.69■■□□□ 1.86
QTRT1-201ENST00000250237 LAMB4A4D0S4 1761 aa26.69■■□□□ 1.86
QTRT1-201ENST00000250237 SCN7AQ01118 1682 aa26.68■■□□□ 1.86
QTRT1-201ENST00000250237 PXDNLA1KZ92 1463 aa26.68■■□□□ 1.86
QTRT1-201ENST00000250237 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
QTRT1-201ENST00000250237 KCNQ3O43525 872 aa26.67■■□□□ 1.86
QTRT1-201ENST00000250237 LMOD3Q0VAK6 560 aa26.67■■□□□ 1.86
QTRT1-201ENST00000250237 KDM3BQ7LBC6 1761 aa26.67■■□□□ 1.86
QTRT1-201ENST00000250237 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
QTRT1-201ENST00000250237 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa26.66■■□□□ 1.86
QTRT1-201ENST00000250237 EIF5P55010 431 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
QTRT1-201ENST00000250237 UTRNP46939 3433 aa26.65■■□□□ 1.86
QTRT1-201ENST00000250237 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.85
QTRT1-201ENST00000250237 DDR1Q08345 913 aa26.64■■□□□ 1.85
QTRT1-201ENST00000250237 BCS1LQ9Y276 419 aa26.64■■□□□ 1.85
QTRT1-201ENST00000250237 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
QTRT1-201ENST00000250237 A0A0G2JLW4 131 aa26.63■■□□□ 1.85
QTRT1-201ENST00000250237 NPHP1O15259 732 aa26.63■■□□□ 1.85
QTRT1-201ENST00000250237 A1BGP04217 495 aa26.63■■□□□ 1.85
QTRT1-201ENST00000250237 RIPK4P57078 832 aa26.63■■□□□ 1.85
QTRT1-201ENST00000250237 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
QTRT1-201ENST00000250237 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
QTRT1-201ENST00000250237 BCORQ6W2J9 1755 aa26.63■■□□□ 1.85
QTRT1-201ENST00000250237 TM4SF1P30408 202 aa26.62■■□□□ 1.85
QTRT1-201ENST00000250237 NFIXQ14938 502 aa26.62■■□□□ 1.85
QTRT1-201ENST00000250237 BICDL1Q6ZP65 573 aa26.62■■□□□ 1.85
QTRT1-201ENST00000250237 DPEP1P16444 411 aa26.61■■□□□ 1.85
QTRT1-201ENST00000250237 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa26.61■■□□□ 1.85
QTRT1-201ENST00000250237 USP16Q9Y5T5 823 aa26.61■■□□□ 1.85
QTRT1-201ENST00000250237 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
QTRT1-201ENST00000250237 MIS18AQ9NYP9 233 aa26.6■■□□□ 1.85
QTRT1-201ENST00000250237 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa26.59■■□□□ 1.85
QTRT1-201ENST00000250237 NRXN2Q9P2S2 1712 aa26.59■■□□□ 1.85
QTRT1-201ENST00000250237 SERPINB2P05120 415 aa26.59■■□□□ 1.85
QTRT1-201ENST00000250237 PIM2Q9P1W9 311 aa26.59■■□□□ 1.85
QTRT1-201ENST00000250237 ZNF652Q9Y2D9 606 aa26.59■■□□□ 1.85
QTRT1-201ENST00000250237 CCDC146Q8IYE0 955 aa26.58■■□□□ 1.85
QTRT1-201ENST00000250237 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
QTRT1-201ENST00000250237 CARMIL3Q8ND23 1372 aa26.57■■□□□ 1.84
QTRT1-201ENST00000250237 NEUROD2Q15784 382 aa26.57■■□□□ 1.84
QTRT1-201ENST00000250237 RUNDC1Q96C34 613 aa26.57■■□□□ 1.84
QTRT1-201ENST00000250237 BCL2L12Q9HB09 334 aa26.57■■□□□ 1.84
QTRT1-201ENST00000250237 TSPYL4Q9UJ04 414 aa26.57■■□□□ 1.84
QTRT1-201ENST00000250237 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa26.56■■□□□ 1.84
QTRT1-201ENST00000250237 TMPOP42166 694 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
QTRT1-201ENST00000250237 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
QTRT1-201ENST00000250237 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
QTRT1-201ENST00000250237 SETDB2Q96T68 719 aa26.55■■□□□ 1.84
QTRT1-201ENST00000250237 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
QTRT1-201ENST00000250237 DLEC1Q9Y238 1755 aa26.54■■□□□ 1.84
QTRT1-201ENST00000250237 TBC1D9BQ66K14 1250 aa26.53■■□□□ 1.84
QTRT1-201ENST00000250237 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
QTRT1-201ENST00000250237 CAMTA2O94983 1202 aa26.51■■□□□ 1.83
QTRT1-201ENST00000250237 CHRNA5P30532 468 aa26.51■■□□□ 1.83
QTRT1-201ENST00000250237 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
QTRT1-201ENST00000250237 ST5P78524 1137 aa26.51■■□□□ 1.83
QTRT1-201ENST00000250237 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa26.51■■□□□ 1.83
QTRT1-201ENST00000250237 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
QTRT1-201ENST00000250237 BABAM1Q9NWV8 329 aa26.5■■□□□ 1.83
QTRT1-201ENST00000250237 ADAMTS8Q9UP79 889 aa26.5■■□□□ 1.83
QTRT1-201ENST00000250237 H0YIN7 160 aa26.49■■□□□ 1.83
QTRT1-201ENST00000250237 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
QTRT1-201ENST00000250237 CLEC4GQ6UXB4 293 aa26.49■■□□□ 1.83
QTRT1-201ENST00000250237 CNBD1Q8NA66 436 aa26.49■■□□□ 1.83
QTRT1-201ENST00000250237 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa26.49■■□□□ 1.83
QTRT1-201ENST00000250237 ATP10DQ9P241 1426 aa26.48■■□□□ 1.83
QTRT1-201ENST00000250237 KIF6Q6ZMV9 814 aa26.48■■□□□ 1.83
QTRT1-201ENST00000250237 PDE6BP35913 854 aa26.47■■□□□ 1.83
QTRT1-201ENST00000250237 C2CD5Q86YS7 1000 aa26.47■■□□□ 1.83
QTRT1-201ENST00000250237 KCNA3P22001 575 aa26.46■■□□□ 1.83
QTRT1-201ENST00000250237 NGEFQ8N5V2 710 aa26.46■■□□□ 1.83
QTRT1-201ENST00000250237 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
QTRT1-201ENST00000250237 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa26.46■■□□□ 1.83
QTRT1-201ENST00000250237 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.83
QTRT1-201ENST00000250237 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.83
QTRT1-201ENST00000250237 ERBB4Q15303 1308 aa26.45■■□□□ 1.82
QTRT1-201ENST00000250237 NBPF26B4DH59 902 aa26.44■■□□□ 1.82
QTRT1-201ENST00000250237 RGL2O15211 777 aa26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 118.6 ms