RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249330.2

VGF-201, Transcript of VGF nerve growth factor inducible, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VGF, Length 2,575 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGF-201ENST00000249330 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa24.8■■□□□ 1.56
VGF-201ENST00000249330 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP24.8■■□□□ 1.56
VGF-201ENST00000249330 SLC39A6Q13433 755 aa24.8■■□□□ 1.56
VGF-201ENST00000249330 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
VGF-201ENST00000249330 ABCA3Q99758 1704 aa24.8■■□□□ 1.56
VGF-201ENST00000249330 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa24.79■■□□□ 1.56
VGF-201ENST00000249330 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
VGF-201ENST00000249330 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
VGF-201ENST00000249330 CDC45O75419 566 aa24.79■■□□□ 1.56
VGF-201ENST00000249330 SSFA2P28290 1259 aa24.78■■□□□ 1.56
VGF-201ENST00000249330 SIRT2Q8IXJ6 389 aa24.78■■□□□ 1.56
VGF-201ENST00000249330 RRP9O43818 475 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
VGF-201ENST00000249330 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
VGF-201ENST00000249330 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
VGF-201ENST00000249330 KDM3BQ7LBC6 1761 aa24.77■■□□□ 1.56
VGF-201ENST00000249330 ANXA1P04083 346 aa24.77■■□□□ 1.56
VGF-201ENST00000249330 SLC52A2Q9HAB3 445 aa24.77■■□□□ 1.56
VGF-201ENST00000249330 CCDC173Q0VFZ6 552 aa24.76■■□□□ 1.55
VGF-201ENST00000249330 CHPF2Q9P2E5 772 aa24.76■■□□□ 1.55
VGF-201ENST00000249330 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
VGF-201ENST00000249330 CLEC17AQ6ZS10 378 aa24.76■■□□□ 1.55
VGF-201ENST00000249330 MEIS3Q99687 375 aa24.76■■□□□ 1.55
VGF-201ENST00000249330 BTG4Q9NY30 223 aa24.76■■□□□ 1.55
VGF-201ENST00000249330 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa24.75■■□□□ 1.55
VGF-201ENST00000249330 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
VGF-201ENST00000249330 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
VGF-201ENST00000249330 PIP4K2BP78356 416 aa24.73■■□□□ 1.55
VGF-201ENST00000249330 KLHL40Q2TBA0 621 aa24.73■■□□□ 1.55
VGF-201ENST00000249330 DCAF5Q96JK2 942 aa24.73■■□□□ 1.55
VGF-201ENST00000249330 CARD10Q9BWT7 1032 aa24.73■■□□□ 1.55
VGF-201ENST00000249330 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
VGF-201ENST00000249330 NASPP49321 788 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
VGF-201ENST00000249330 ZNF790Q6PG37 636 aa24.73■■□□□ 1.55
VGF-201ENST00000249330 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
VGF-201ENST00000249330 BAG4O95429 457 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
VGF-201ENST00000249330 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
VGF-201ENST00000249330 HOXB7P09629 217 aa24.71■■□□□ 1.55
VGF-201ENST00000249330 PPP1R9BQ96SB3 815 aa24.71■■□□□ 1.55
VGF-201ENST00000249330 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa24.71■■□□□ 1.55
VGF-201ENST00000249330 IL2RBP14784 551 aa24.71■■□□□ 1.55
VGF-201ENST00000249330 RABEP1Q15276 862 aa24.71■■□□□ 1.55
VGF-201ENST00000249330 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.55
VGF-201ENST00000249330 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
VGF-201ENST00000249330 HEG1Q9ULI3 1381 aa24.69■■□□□ 1.54
VGF-201ENST00000249330 SCN11AQ9UI33 1791 aa24.69■■□□□ 1.54
VGF-201ENST00000249330 CCT4P50991 539 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
VGF-201ENST00000249330 PROSER3Q2NL68 480 aa24.69■■□□□ 1.54
VGF-201ENST00000249330 TPM2P07951 284 aa24.68■■□□□ 1.54
VGF-201ENST00000249330 PKD1L3Q7Z443 1732 aa24.67■■□□□ 1.54
VGF-201ENST00000249330 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
VGF-201ENST00000249330 CABP4P57796 275 aa24.67■■□□□ 1.54
VGF-201ENST00000249330 PKNOX2Q96KN3 472 aa24.67■■□□□ 1.54
VGF-201ENST00000249330 NUCB2P80303 420 aa24.67■■□□□ 1.54
VGF-201ENST00000249330 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
VGF-201ENST00000249330 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
VGF-201ENST00000249330 ADAMTS2O95450 1211 aa24.66■■□□□ 1.54
VGF-201ENST00000249330 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa24.66■■□□□ 1.54
VGF-201ENST00000249330 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa24.66■■□□□ 1.54
VGF-201ENST00000249330 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa24.66■■□□□ 1.54
VGF-201ENST00000249330 ZSCAN30Q86W11 494 aa24.65■■□□□ 1.54
VGF-201ENST00000249330 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
VGF-201ENST00000249330 CEP85Q6P2H3 762 aa24.65■■□□□ 1.54
VGF-201ENST00000249330 PI4KAP2A4QPH2 592 aa24.64■■□□□ 1.54
VGF-201ENST00000249330 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa24.64■■□□□ 1.54
VGF-201ENST00000249330 CACNA1FO60840 1977 aa24.64■■□□□ 1.54
VGF-201ENST00000249330 AK9Q5TCS8 1911 aa24.64■■□□□ 1.53
VGF-201ENST00000249330 ATP10DQ9P241 1426 aa24.64■■□□□ 1.53
VGF-201ENST00000249330 TTC22Q5TAA0 569 aa24.63■■□□□ 1.53
VGF-201ENST00000249330 MCTP1Q6DN14 999 aa24.63■■□□□ 1.53
VGF-201ENST00000249330 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa24.63■■□□□ 1.53
VGF-201ENST00000249330 ANKRD44Q8N8A2 993 aa24.63■■□□□ 1.53
VGF-201ENST00000249330 ZNF445P59923 1031 aa24.62■■□□□ 1.53
VGF-201ENST00000249330 TTC5Q8N0Z6 440 aa24.62■■□□□ 1.53
VGF-201ENST00000249330 DCTPP1Q9H773 170 aa24.62■■□□□ 1.53
VGF-201ENST00000249330 TOM1O60784 492 aa24.61■■□□□ 1.53
VGF-201ENST00000249330 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
VGF-201ENST00000249330 CHMP4AQ9BY43 222 aa24.61■■□□□ 1.53
VGF-201ENST00000249330 USP16Q9Y5T5 823 aa24.61■■□□□ 1.53
VGF-201ENST00000249330 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
VGF-201ENST00000249330 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
VGF-201ENST00000249330 NCLP19338 710 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
VGF-201ENST00000249330 MSNP26038 577 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
VGF-201ENST00000249330 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
VGF-201ENST00000249330 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
VGF-201ENST00000249330 USP26Q9BXU7 913 aa24.6■■□□□ 1.53
VGF-201ENST00000249330 USP44Q9H0E7 712 aa24.6■■□□□ 1.53
VGF-201ENST00000249330 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
VGF-201ENST00000249330 PDIA6Q15084 440 aa24.59■■□□□ 1.53
VGF-201ENST00000249330 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
VGF-201ENST00000249330 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
VGF-201ENST00000249330 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
VGF-201ENST00000249330 DNAAF4Q8WXU2 420 aa24.58■■□□□ 1.53
VGF-201ENST00000249330 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
VGF-201ENST00000249330 MRC1P22897 1456 aa24.58■■□□□ 1.53
VGF-201ENST00000249330 MYL6BP14649 208 aa24.58■■□□□ 1.53
VGF-201ENST00000249330 CASC1Q6TDU7 716 aa24.58■■□□□ 1.53
VGF-201ENST00000249330 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa24.58■■□□□ 1.53
VGF-201ENST00000249330 GNAI2P04899 355 aa24.57■■□□□ 1.52
VGF-201ENST00000249330 LMBRD1Q9NUN5 540 aa24.57■■□□□ 1.52
VGF-201ENST00000249330 ADCY9O60503 1353 aa24.57■■□□□ 1.52
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