RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000234111.8

ODC1-201, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ODC1, Length 2,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-201ENST00000234111 HSPA4P34932 840 aa25.32■■□□□ 1.64
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ODC1-201ENST00000234111 KLHL34Q8N239 644 aa25.32■■□□□ 1.64
ODC1-201ENST00000234111 TRIM5Q9C035 493 aa25.32■■□□□ 1.64
ODC1-201ENST00000234111 AK2P54819 239 aa25.31■■□□□ 1.64
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ODC1-201ENST00000234111 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
ODC1-201ENST00000234111 G2E3Q7L622 706 aa25.18■■□□□ 1.62
ODC1-201ENST00000234111 FERMT3Q86UX7 667 aa25.18■■□□□ 1.62
ODC1-201ENST00000234111 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
ODC1-201ENST00000234111 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
ODC1-201ENST00000234111 CASTP20810 708 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
ODC1-201ENST00000234111 ZNF165P49910 485 aa25.17■■□□□ 1.62
ODC1-201ENST00000234111 FAM193AP78312 1265 aa25.17■■□□□ 1.62
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