RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000007264.6

RPUSD1-201, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RPUSD1, Length 2,050 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1-201ENST00000007264 FMNL2Q96PY5 1086 aa29.74■■■□□ 2.35
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RPUSD1-201ENST00000007264 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa29.73■■■□□ 2.35
RPUSD1-201ENST00000007264 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa29.73■■■□□ 2.35
RPUSD1-201ENST00000007264 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP29.73■■■□□ 2.35
RPUSD1-201ENST00000007264 TBC1D32Q96NH3 1257 aa29.73■■■□□ 2.35
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RPUSD1-201ENST00000007264 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP29.7■■■□□ 2.34
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RPUSD1-201ENST00000007264 USP16Q9Y5T5 823 aa29.64■■■□□ 2.34
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RPUSD1-201ENST00000007264 COPS6Q7L5N1 327 aa29.6■■■□□ 2.33
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RPUSD1-201ENST00000007264 UBR2Q8IWV8 1755 aa29.58■■■□□ 2.33
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RPUSD1-201ENST00000007264 LRP10Q7Z4F1 713 aa29.52■■■□□ 2.32
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RPUSD1-201ENST00000007264 NBR1Q14596 966 aa29.46■■■□□ 2.31
RPUSD1-201ENST00000007264 SUCLG2Q96I99 432 aa29.46■■■□□ 2.31
RPUSD1-201ENST00000007264 PLBD2Q8NHP8 589 aa29.46■■■□□ 2.31
RPUSD1-201ENST00000007264 PIP4K2BP78356 416 aa29.45■■■□□ 2.31
RPUSD1-201ENST00000007264 EXOC5O00471 708 aa29.44■■■□□ 2.3
RPUSD1-201ENST00000007264 STAP2Q9UGK3 403 aa29.44■■■□□ 2.3
RPUSD1-201ENST00000007264 TSHZ3Q63HK5 1081 aa29.44■■■□□ 2.3
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