RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481518.1

PSME4-208, Transcript of proteasome activator subunit 4, humanhuman

TSL 5

Gene PSME4, Length 886 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4-208ENST00000481518 SLC6A12P48065 614 aa21.75■■□□□ 1.07
PSME4-208ENST00000481518 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
PSME4-208ENST00000481518 PWP1Q13610 501 aa21.75■■□□□ 1.07
PSME4-208ENST00000481518 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
PSME4-208ENST00000481518 MINDY4Q4G0A6 757 aa21.75■■□□□ 1.07
PSME4-208ENST00000481518 MFSD4BQ5TF39 518 aa21.75■■□□□ 1.07
PSME4-208ENST00000481518 NXPE4Q6UWF7 544 aa21.75■■□□□ 1.07
PSME4-208ENST00000481518 ISLR2Q6UXK2 745 aa21.75■■□□□ 1.07
PSME4-208ENST00000481518 CTAGE3PQ8IX95 158 aa21.75■■□□□ 1.07
PSME4-208ENST00000481518 NT5CQ8TCD5 201 aa21.75■■□□□ 1.07
PSME4-208ENST00000481518 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
PSME4-208ENST00000481518 TSPAN17Q96FV3 270 aa21.75■■□□□ 1.07
PSME4-208ENST00000481518 RBCK1Q9BYM8 510 aa21.75■■□□□ 1.07
PSME4-208ENST00000481518 PELI2Q9HAT8 420 aa21.75■■□□□ 1.07
PSME4-208ENST00000481518 RIC8BQ9NVN3 520 aa21.75■■□□□ 1.07
PSME4-208ENST00000481518 ASF1BQ9NVP2 202 aa21.75■■□□□ 1.07
PSME4-208ENST00000481518 ZFP69BQ9UJL9 534 aa21.75■■□□□ 1.07
PSME4-208ENST00000481518 KCNE2Q9Y6J6 123 aa21.75■■□□□ 1.07
PSME4-208ENST00000481518 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa21.74■■□□□ 1.07
PSME4-208ENST00000481518 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
PSME4-208ENST00000481518 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
PSME4-208ENST00000481518 PCDH17O14917 1159 aa21.74■■□□□ 1.07
PSME4-208ENST00000481518 WDR47O94967 919 aa21.74■■□□□ 1.07
PSME4-208ENST00000481518 SERPINA7P05543 415 aa21.74■■□□□ 1.07
PSME4-208ENST00000481518 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
PSME4-208ENST00000481518 STMN1P16949 149 aa21.74■■□□□ 1.07
PSME4-208ENST00000481518 VARSP26640 1264 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
PSME4-208ENST00000481518 HNMTP50135 292 aa21.74■■□□□ 1.07
PSME4-208ENST00000481518 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
PSME4-208ENST00000481518 MFAP5Q13361 173 aa21.74■■□□□ 1.07
PSME4-208ENST00000481518 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
PSME4-208ENST00000481518 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP21.74■■□□□ 1.072e-7■■■■□ 24.2
PSME4-208ENST00000481518 TGFBIQ15582 683 aa21.74■■□□□ 1.07
PSME4-208ENST00000481518 OR4D1Q15615 310 aa21.74■■□□□ 1.07
PSME4-208ENST00000481518 DEFB134Q4QY38 66 aa21.74■■□□□ 1.07
PSME4-208ENST00000481518 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa21.74■■□□□ 1.07
PSME4-208ENST00000481518 PPM1NQ8N819 430 aa21.74■■□□□ 1.07
PSME4-208ENST00000481518 FBF1Q8TES7 1133 aa21.74■■□□□ 1.07
PSME4-208ENST00000481518 IMMP1LQ96LU5 166 aa21.74■■□□□ 1.07
PSME4-208ENST00000481518 CYTH2Q99418 400 aa21.74■■□□□ 1.07
PSME4-208ENST00000481518 TMEM79Q9BSE2 394 aa21.74■■□□□ 1.07
PSME4-208ENST00000481518 LRRC1Q9BTT6 524 aa21.74■■□□□ 1.07
PSME4-208ENST00000481518 EPS8L2Q9H6S3 715 aa21.74■■□□□ 1.07
PSME4-208ENST00000481518 PTGFRNQ9P2B2 879 aa21.74■■□□□ 1.07
PSME4-208ENST00000481518 TAPBPO15533 448 aa21.73■■□□□ 1.07
PSME4-208ENST00000481518 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
PSME4-208ENST00000481518 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
PSME4-208ENST00000481518 CD1DP15813 335 aa21.73■■□□□ 1.07
PSME4-208ENST00000481518 ALOX12P18054 663 aa21.73■■□□□ 1.07
PSME4-208ENST00000481518 SOX11P35716 441 aa21.73■■□□□ 1.07
PSME4-208ENST00000481518 AHRP35869 848 aa21.73■■□□□ 1.07
PSME4-208ENST00000481518 OLR1P78380 273 aa21.73■■□□□ 1.07
PSME4-208ENST00000481518 GUCY2DQ02846 1103 aa21.73■■□□□ 1.07
PSME4-208ENST00000481518 HYAL2Q12891 473 aa21.73■■□□□ 1.07
PSME4-208ENST00000481518 HERC3Q15034 1050 aa21.73■■□□□ 1.07
PSME4-208ENST00000481518 FBXO48Q5FWF7 155 aa21.73■■□□□ 1.07
PSME4-208ENST00000481518 C8orf74Q6P047 294 aa21.73■■□□□ 1.07
PSME4-208ENST00000481518 FAM26EQ8N5C1 309 aa21.73■■□□□ 1.07
PSME4-208ENST00000481518 TBC1D19Q8N5T2 526 aa21.73■■□□□ 1.07
PSME4-208ENST00000481518 SIRT6Q8N6T7 355 aa21.73■■□□□ 1.07
PSME4-208ENST00000481518 DNAJB14Q8TBM8 379 aa21.73■■□□□ 1.07
PSME4-208ENST00000481518 PEX11GQ96HA9 241 aa21.73■■□□□ 1.07
PSME4-208ENST00000481518 AICDAQ9GZX7 198 aa21.73■■□□□ 1.07
PSME4-208ENST00000481518 LANCL2Q9NS86 450 aa21.73■■□□□ 1.07
PSME4-208ENST00000481518 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa21.73■■□□□ 1.07
PSME4-208ENST00000481518 HECTD1Q9ULT8 2610 aa21.72■■□□□ 1.07
PSME4-208ENST00000481518 C4orf51C9J302 202 aa21.72■■□□□ 1.07
PSME4-208ENST00000481518 URI1O94763 535 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
PSME4-208ENST00000481518 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
PSME4-208ENST00000481518 ITGAMP11215 1152 aa21.72■■□□□ 1.07
PSME4-208ENST00000481518 GLRBP48167 497 aa21.72■■□□□ 1.07
PSME4-208ENST00000481518 RAB10P61026 200 aa21.72■■□□□ 1.07
PSME4-208ENST00000481518 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
PSME4-208ENST00000481518 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa21.72■■□□□ 1.07
PSME4-208ENST00000481518 CMC1Q7Z7K0 106 aa21.72■■□□□ 1.07
PSME4-208ENST00000481518 CATSPER1Q8NEC5 780 aa21.72■■□□□ 1.07
PSME4-208ENST00000481518 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
PSME4-208ENST00000481518 METTL21AQ8WXB1 218 aa21.72■■□□□ 1.07
PSME4-208ENST00000481518 CNDP1Q96KN2 507 aa21.72■■□□□ 1.07
PSME4-208ENST00000481518 UBXN10Q96LJ8 280 aa21.72■■□□□ 1.07
PSME4-208ENST00000481518 LMF1Q96S06 567 aa21.72■■□□□ 1.07
PSME4-208ENST00000481518 AIF1LQ9BQI0 150 aa21.72■■□□□ 1.07
PSME4-208ENST00000481518 SLC6A16Q9GZN6 736 aa21.72■■□□□ 1.07
PSME4-208ENST00000481518 CYSRT1A8MQ03 144 aa21.71■■□□□ 1.07
PSME4-208ENST00000481518 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
PSME4-208ENST00000481518 CYC1P08574 325 aa21.71■■□□□ 1.07
PSME4-208ENST00000481518 STX2P32856 288 aa21.71■■□□□ 1.07
PSME4-208ENST00000481518 SPRP35270 261 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
PSME4-208ENST00000481518 HNF4AP41235 474 aa21.71■■□□□ 1.07
PSME4-208ENST00000481518 RHAGQ02094 409 aa21.71■■□□□ 1.07
PSME4-208ENST00000481518 RGS1Q08116 209 aa21.71■■□□□ 1.07
PSME4-208ENST00000481518 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
PSME4-208ENST00000481518 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
PSME4-208ENST00000481518 GRTP1Q5TC63 336 aa21.71■■□□□ 1.07
PSME4-208ENST00000481518 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa21.71■■□□□ 1.07
PSME4-208ENST00000481518 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
PSME4-208ENST00000481518 ANKRD37Q7Z713 158 aa21.71■■□□□ 1.07
PSME4-208ENST00000481518 GPSM1Q86YR5 675 aa21.71■■□□□ 1.07
PSME4-208ENST00000481518 CREB3L4Q8TEY5 395 aa21.71■■□□□ 1.07
PSME4-208ENST00000481518 ESAMQ96AP7 390 aa21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.8 ms