RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489895.5

NISCH-213, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 5,350 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-213ENST00000489895 TP73O15350 636 aa16.57■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 GMFGO60234 142 aa16.57■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 VEGFBP49765 207 aa16.57■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 RAB25P57735 213 aa16.57■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 ABHD18Q0P651 414 aa16.57■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 ANO7Q6IWH7 933 aa16.57■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 B3GNT9Q6UX72 402 aa16.57■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 P2RY8Q86VZ1 359 aa16.57■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 LRRC17Q8N6Y2 441 aa16.57■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 TMEM40Q8WWA1 233 aa16.57■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 ZNF382Q96SR6 550 aa16.57■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 GMEB2Q9UKD1 530 aa16.57■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 HEPACAM2A8MVW5 462 aa16.57■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 TAF4O00268 1085 aa16.57■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 SSNA1O43805 119 aa16.57■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 DAG1Q14118 895 aa16.57■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 PCLAFQ15004 111 aa16.57■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 FBRSQ9HAH7 460 aa16.57■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 DNASE1L1P49184 302 aa16.57■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 ACSBG2Q5FVE4 666 aa16.57■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 C7orf57Q8NEG2 295 aa16.57■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 ZBTB26Q9HCK0 441 aa16.57■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 CYTH4Q9UIA0 394 aa16.57■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 PHF24Q9UPV7 400 aa16.57■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa16.56■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 FAM131AQ6UXB0 335 aa16.56■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 OR10G2Q8NGC3 310 aa16.56■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 MAPK15Q8TD08 544 aa16.56■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 KCNS3Q9BQ31 491 aa16.56■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 PAAF1Q9BRP4 392 aa16.56■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 ARHGEF33A8MVX0 844 aa16.56■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 PGRP06401 933 aa16.56■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 SEC14L1Q92503 715 aa16.56■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 ARPC2O15144 300 aa16.56■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 ACRV1P26436 265 aa16.56■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 GDF5P43026 501 aa16.56■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP16.56■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 EPYCQ99645 322 aa16.56■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 C11orf16Q9NQ32 467 aa16.56■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 C2orf78A6NCI8 922 aa16.56■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 MATN2O00339 956 aa16.56■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 POU2F1P14859 743 aa16.56■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 TM4SF4P48230 202 aa16.56■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 CDK6Q00534 326 aa16.56■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 WDR92Q96MX6 357 aa16.56■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 SDHAF3Q9NRP4 125 aa16.56■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 MKS1Q9NXB0 559 aa16.56■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP16.55■□□□□ 0.241e-8■■■■□ 24.2
NISCH-213ENST00000489895 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 ENPP2Q13822 863 aa16.55■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 DHCR24Q15392 516 aa16.55■□□□□ 0.24
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NISCH-213ENST00000489895 SUN3Q8TAQ9 357 aa16.55■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 TVP23BQ9NYZ1 205 aa16.55■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 RNF11Q9Y3C5 154 aa16.55■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 H0YGN5 161 aa16.55■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 KAT7O95251 611 aa16.55■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 CD2P06729 351 aa16.55■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 CXCR1P25024 350 aa16.55■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 RPS13P62277 151 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 NPAS3Q8IXF0 933 aa16.55■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 MOAP1Q96BY2 351 aa16.55■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 PDCD10Q9BUL8 212 aa16.55■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 PLEKHA1Q9HB21 404 aa16.55■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 MS4A12Q9NXJ0 267 aa16.55■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 ACTR3BQ9P1U1 418 aa16.55■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 NFS1Q9Y697 457 aa16.55■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 CRB2Q5IJ48 1285 aa16.55■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 USP30Q70CQ3 517 aa16.55■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 TCEAL8Q8IYN2 117 aa16.55■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 ANKLE1Q8NAG6 615 aa16.55■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 KLHL31Q9H511 634 aa16.55■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 ING4Q9UNL4 249 aa16.55■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa16.55■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 AQP4P55087 323 aa16.55■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 PPP3R1P63098 170 aa16.55■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 BLMHQ13867 455 aa16.55■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 IGDCC3Q8IVU1 814 aa16.55■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 PLA2G15Q8NCC3 412 aa16.55■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 FAM110BQ8TC76 370 aa16.55■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 KAT2AQ92830 837 aa16.55■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 ACTL8Q9H568 366 aa16.55■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 CXorf21Q9HAI6 301 aa16.55■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 TMEM233B4DJY2 109 aa16.55■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 TPST2O60704 377 aa16.55■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 TNFRSF21O75509 655 aa16.55■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 GKP32189 559 aa16.55■□□□□ 0.24
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