RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273482.10

TRPC1-201, Transcript of transient receptor potential cation channel subfamily C member 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPC1, Length 4,324 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1-201ENST00000273482 GPR65Q8IYL9 337 aa16.69■□□□□ 0.26
TRPC1-201ENST00000273482 OR2T29Q8NH02 315 aa16.69■□□□□ 0.26
TRPC1-201ENST00000273482 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa16.69■□□□□ 0.26
TRPC1-201ENST00000273482 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
TRPC1-201ENST00000273482 CREG1O75629 220 aa16.69■□□□□ 0.26
TRPC1-201ENST00000273482 MAP2K4P45985 399 aa16.69■□□□□ 0.26
TRPC1-201ENST00000273482 ATAD3BQ5T9A4 648 aa16.69■□□□□ 0.26
TRPC1-201ENST00000273482 NEK5Q6P3R8 708 aa16.69■□□□□ 0.26
TRPC1-201ENST00000273482 Q6ZNX1 250 aa16.69■□□□□ 0.26
TRPC1-201ENST00000273482 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa16.69■□□□□ 0.26
TRPC1-201ENST00000273482 KIAA1191Q96A73 305 aa16.69■□□□□ 0.26
TRPC1-201ENST00000273482 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
TRPC1-201ENST00000273482 RNF38Q9H0F5 515 aa16.69■□□□□ 0.26
TRPC1-201ENST00000273482 TRPV5Q9NQA5 729 aa16.69■□□□□ 0.26
TRPC1-201ENST00000273482 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
TRPC1-201ENST00000273482 MTMR10Q9NXD2 777 aa16.69■□□□□ 0.26
TRPC1-201ENST00000273482 A0A1B0GTW7 788 aa16.69■□□□□ 0.26
TRPC1-201ENST00000273482 GSTM2P28161 218 aa16.69■□□□□ 0.26
TRPC1-201ENST00000273482 HNF4AP41235 474 aa16.69■□□□□ 0.26
TRPC1-201ENST00000273482 MAGEA3P43357 314 aa16.69■□□□□ 0.26
TRPC1-201ENST00000273482 NUDT6P53370 316 aa16.69■□□□□ 0.26
TRPC1-201ENST00000273482 AP1S1P61966 158 aa16.69■□□□□ 0.26
TRPC1-201ENST00000273482 TEAD2Q15562 447 aa16.69■□□□□ 0.26
TRPC1-201ENST00000273482 KLHL12Q53G59 568 aa16.69■□□□□ 0.26
TRPC1-201ENST00000273482 SPANXN4Q5MJ08 99 aa16.69■□□□□ 0.26
TRPC1-201ENST00000273482 ADGRG5Q8IZF4 528 aa16.69■□□□□ 0.26
TRPC1-201ENST00000273482 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
TRPC1-201ENST00000273482 ZNF840PA6NDX5 716 aa16.68■□□□□ 0.26
TRPC1-201ENST00000273482 NOTOA8MTQ0 251 aa16.68■□□□□ 0.26
TRPC1-201ENST00000273482 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa16.68■□□□□ 0.26
TRPC1-201ENST00000273482 ACOT8O14734 319 aa16.68■□□□□ 0.26
TRPC1-201ENST00000273482 SNX4O95219 450 aa16.68■□□□□ 0.26
TRPC1-201ENST00000273482 CLDN9O95484 217 aa16.68■□□□□ 0.26
TRPC1-201ENST00000273482 GSTT2P0CG29 244 aa16.68■□□□□ 0.26
TRPC1-201ENST00000273482 GSTT2BP0CG30 244 aa16.68■□□□□ 0.26
TRPC1-201ENST00000273482 NR2F6P10588 404 aa16.68■□□□□ 0.26
TRPC1-201ENST00000273482 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
TRPC1-201ENST00000273482 FAM171BQ6P995 826 aa16.68■□□□□ 0.26
TRPC1-201ENST00000273482 PRR23BQ6ZRT6 265 aa16.68■□□□□ 0.26
TRPC1-201ENST00000273482 CLIP4Q8N3C7 705 aa16.68■□□□□ 0.26
TRPC1-201ENST00000273482 KLHDC9Q8NEP7 349 aa16.68■□□□□ 0.26
TRPC1-201ENST00000273482 LGALS12Q96DT0 336 aa16.68■□□□□ 0.26
TRPC1-201ENST00000273482 ITPAQ9BY32 194 aa16.68■□□□□ 0.26
TRPC1-201ENST00000273482 PLOD3O60568 738 aa16.68■□□□□ 0.26
TRPC1-201ENST00000273482 ERN1O75460 977 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
TRPC1-201ENST00000273482 PPP2R1BP30154 601 aa16.68■□□□□ 0.26
TRPC1-201ENST00000273482 CD68P34810 354 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
TRPC1-201ENST00000273482 DGKGP49619 791 aa16.68■□□□□ 0.26
TRPC1-201ENST00000273482 XKR6Q5GH73 641 aa16.68■□□□□ 0.26
TRPC1-201ENST00000273482 PPP2R2DQ66LE6 453 aa16.68■□□□□ 0.26
TRPC1-201ENST00000273482 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
TRPC1-201ENST00000273482 Q6ZVU0 165 aa16.68■□□□□ 0.26
TRPC1-201ENST00000273482 GRPEL2Q8TAA5 225 aa16.68■□□□□ 0.26
TRPC1-201ENST00000273482 OR8D1Q8WZ84 308 aa16.68■□□□□ 0.26
TRPC1-201ENST00000273482 YIPF2Q9BWQ6 316 aa16.68■□□□□ 0.26
TRPC1-201ENST00000273482 CAPN10Q9HC96 672 aa16.68■□□□□ 0.26
TRPC1-201ENST00000273482 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa16.68■□□□□ 0.26
TRPC1-201ENST00000273482 TDP1Q9NUW8 608 aa16.68■□□□□ 0.26
TRPC1-201ENST00000273482 FAM118AQ9NWS6 357 aa16.68■□□□□ 0.26
TRPC1-201ENST00000273482 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa16.68■□□□□ 0.26
TRPC1-201ENST00000273482 TRBC1P01850 177 aa16.68■□□□□ 0.26
TRPC1-201ENST00000273482 CST5P28325 142 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
TRPC1-201ENST00000273482 AGTR2P50052 363 aa16.68■□□□□ 0.26
TRPC1-201ENST00000273482 CDH12P55289 794 aa16.68■□□□□ 0.26
TRPC1-201ENST00000273482 TUBA1BP68363 451 aa16.68■□□□□ 0.26
TRPC1-201ENST00000273482 ZNF33AQ06730 810 aa16.68■□□□□ 0.26
TRPC1-201ENST00000273482 TUBA1AQ71U36 451 aa16.68■□□□□ 0.26
TRPC1-201ENST00000273482 SERPINA9Q86WD7 417 aa16.68■□□□□ 0.26
TRPC1-201ENST00000273482 FLCNQ8NFG4 579 aa16.68■□□□□ 0.26
TRPC1-201ENST00000273482 CNPPD1Q9BV87 410 aa16.68■□□□□ 0.26
TRPC1-201ENST00000273482 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
TRPC1-201ENST00000273482 ERVK-18Q9QC07 812 aa16.68■□□□□ 0.26
TRPC1-201ENST00000273482 CORO2BQ9UQ03 480 aa16.68■□□□□ 0.26
TRPC1-201ENST00000273482 CARD8Q9Y2G2 431 aa16.68■□□□□ 0.26
TRPC1-201ENST00000273482 AP2A2O94973 939 aa16.67■□□□□ 0.26
TRPC1-201ENST00000273482 POP4O95707 220 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
TRPC1-201ENST00000273482 PGRP06401 933 aa16.67■□□□□ 0.26
TRPC1-201ENST00000273482 ALDH3B2P48448 385 aa16.67■□□□□ 0.26
TRPC1-201ENST00000273482 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
TRPC1-201ENST00000273482 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa16.67■□□□□ 0.26
TRPC1-201ENST00000273482 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
TRPC1-201ENST00000273482 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa16.67■□□□□ 0.26
TRPC1-201ENST00000273482 PCDH10Q9P2E7 1040 aa16.67■□□□□ 0.26
TRPC1-201ENST00000273482 CFL2Q9Y281 166 aa16.67■□□□□ 0.26
TRPC1-201ENST00000273482 CCRL2O00421 344 aa16.67■□□□□ 0.26
TRPC1-201ENST00000273482 ADAM12O43184 909 aa16.67■□□□□ 0.26
TRPC1-201ENST00000273482 ESR1P03372 595 aa16.67■□□□□ 0.26
TRPC1-201ENST00000273482 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
TRPC1-201ENST00000273482 PPIBP23284 216 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
TRPC1-201ENST00000273482 ITPKAP23677 461 aa16.67■□□□□ 0.26
TRPC1-201ENST00000273482 CAP1Q01518 475 aa16.67■□□□□ 0.26
TRPC1-201ENST00000273482 SERINC3Q13530 473 aa16.67■□□□□ 0.26
TRPC1-201ENST00000273482 APOFQ13790 326 aa16.67■□□□□ 0.26
TRPC1-201ENST00000273482 SLC36A3Q495N2 470 aa16.67■□□□□ 0.26
TRPC1-201ENST00000273482 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
TRPC1-201ENST00000273482 TLR9Q9NR96 1032 aa16.67■□□□□ 0.26
TRPC1-201ENST00000273482 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
TRPC1-201ENST00000273482 VPS4AQ9UN37 437 aa16.67■□□□□ 0.26
TRPC1-201ENST00000273482 LCHNA4D1U4 455 aa16.67■□□□□ 0.26
TRPC1-201ENST00000273482 DNAJB5O75953 348 aa16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38 ms