RNA–Protein interactions for RNA: YKL040C

NFU1, Transcript of Protein involved in iron metabolism in mitochondria, yeast

Gene NFU1, Length 771 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NFU1	YKL040C	WHI5	Q12416	295 aa		5.05	□□□□□ -1.6
NFU1	YKL040C	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
NFU1	YKL040C	PNS1	Q12412	539 aa		5.04	□□□□□ -1.6
NFU1	YKL040C	PUF4	P25339	888 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.03	□□□□□ -1.6	not detected
NFU1	YKL040C	DOM34	P33309	386 aa		5.03	□□□□□ -1.6
NFU1	YKL040C	MSC6	Q08818	692 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
NFU1	YKL040C	YPL260W	Q08977	551 aa		5.03	□□□□□ -1.6
NFU1	YKL040C	GAL10	P04397	699 aa		5.02	□□□□□ -1.61
NFU1	YKL040C	SRM1	P21827	482 aa		5.02	□□□□□ -1.61
NFU1	YKL040C	YFL054C	P43549	646 aa		5.02	□□□□□ -1.61
NFU1	YKL040C	RPT1	P33299	467 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
NFU1	YKL040C	STM1	P39015	273 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
NFU1	YKL040C	RAT1	Q02792	1006 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
NFU1	YKL040C	RIB2	Q12362	591 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
NFU1	YKL040C	TAF13	P11747	167 aa		5	□□□□□ -1.61
NFU1	YKL040C	CMP2	P14747	604 aa		5	□□□□□ -1.61
NFU1	YKL040C	TRM2	P33753	639 aa		5	□□□□□ -1.61
NFU1	YKL040C	ROD1	Q02805	837 aa		5	□□□□□ -1.61
NFU1	YKL040C	RSM24	Q03976	319 aa		5	□□□□□ -1.61
NFU1	YKL040C	TAD3	Q9URQ3	322 aa		5	□□□□□ -1.61
NFU1	YKL040C	CDC20	P26309	610 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NFU1	YKL040C	RFC5	P38251	354 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NFU1	YKL040C	THI12	P42883	340 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NFU1	YKL040C	THI5	P43534	340 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NFU1	YKL040C	THI11	P47183	340 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NFU1	YKL040C	THI13	Q07748	340 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NFU1	YKL040C	PUS9	Q12069	462 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NFU1	YKL040C	CDC6	P09119	513 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NFU1	YKL040C	MKK2	P32491	506 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NFU1	YKL040C	LST4	P34239	828 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NFU1	YKL040C	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
NFU1	YKL040C	SIW14	P53965	281 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFU1	YKL040C	TMA10	Q06177	86 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFU1	YKL040C	RXT3	Q07458	294 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFU1	YKL040C	GPB1	Q08886	897 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFU1	YKL040C	PRE9	P23638	258 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
NFU1	YKL040C	HCM1	P25364	564 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NFU1	YKL040C	MSE1	P48525	536 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NFU1	YKL040C	SLI1	P53304	468 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NFU1	YKL040C	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.96	□□□□□ -1.62	not detected
NFU1	YKL040C	MCD1	Q12158	566 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NFU1	YKL040C	YER152C	P10356	443 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFU1	YKL040C	STE11	P23561	717 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFU1	YKL040C	RGD1	P38339	666 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFU1	YKL040C	HXT13	P39924	564 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFU1	YKL040C	ENT3	P47160	408 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFU1	YKL040C	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NFU1	YKL040C	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NFU1	YKL040C	YGR122W	P53272	402 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFU1	YKL040C	HXT17	P53631	564 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFU1	YKL040C	HXT15	P54854	567 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFU1	YKL040C	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.95	□□□□□ -1.62	not detected
NFU1	YKL040C	SVS1	Q12254	260 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFU1	YKL040C	MRPS18	P42847	217 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFU1	YKL040C	GNP1	P48813	663 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFU1	YKL040C	SUN4	P53616	420 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFU1	YKL040C	NTO1	Q12311	748 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFU1	YKL040C	KIN2	P13186	1147 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NFU1	YKL040C	SEC8	P32855	1065 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFU1	YKL040C	VPS62	P53285	467 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFU1	YKL040C	PBP1	P53297	722 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NFU1	YKL040C	YAP6	Q03935	383 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFU1	YKL040C	SIZ1	Q04195	904 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFU1	YKL040C	SYP1	P25623	870 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NFU1	YKL040C	APL1	P27351	700 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFU1	YKL040C	MLS1	P30952	554 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFU1	YKL040C	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NFU1	YKL040C	RAD2	P07276	1031 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFU1	YKL040C	SEC20	P28791	383 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFU1	YKL040C	PMI40	P29952	429 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NFU1	YKL040C	IPL1	P38991	367 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFU1	YKL040C	CNN1	P43618	361 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFU1	YKL040C	PHO23	P50947	330 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFU1	YKL040C	YLR224W	Q05947	369 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFU1	YKL040C	ATG13	Q06628	738 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFU1	YKL040C	HMI1	Q12039	706 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFU1	YKL040C	GCV2	P49095	1034 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NFU1	YKL040C	MRL1	Q06815	381 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NFU1	YKL040C	CYC8	P14922	966 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NFU1	YKL040C	DBP5	P20449	482 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NFU1	YKL040C	BAS1	P22035	811 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NFU1	YKL040C	EMC1	P25574	760 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NFU1	YKL040C	MPH1	P40562	993 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NFU1	YKL040C	AIM21	P40563	679 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NFU1	YKL040C	MSC2	Q03455	724 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NFU1	YKL040C	PMA1	P05030	918 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NFU1	YKL040C	GCR1	P07261	785 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NFU1	YKL040C	RPS26A	P39938	119 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NFU1	YKL040C	RPS26B	P39939	119 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NFU1	YKL040C	ACE2	P21192	770 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFU1	YKL040C	CHS7	P38843	316 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFU1	YKL040C	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NFU1	YKL040C	DCG1	P32460	244 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NFU1	YKL040C	MXR1	P40029	184 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NFU1	YKL040C	CTF4	Q01454	927 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NFU1	YKL040C	YPT53	P36019	220 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NFU1	YKL040C	UGA2	P38067	497 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NFU1	YKL040C	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
NFU1	YKL040C	KIN4	Q01919	800 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NFU1	YKL040C	SEN54	Q02825	467 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63

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