RNA–Protein interactions for RNA: YJL201W

ECM25, Transcript of Non-essential protein of unknown function, yeast

Gene ECM25, Length 1,800 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ECM25	YJL201W	TY1A-ML2	P0CX76	440 aa		3.42	□□□□□ -1.86
ECM25	YJL201W	BUD6	P41697	788 aa		3.42	□□□□□ -1.86
ECM25	YJL201W	SLS1	P42900	643 aa		3.42	□□□□□ -1.86
ECM25	YJL201W	GNP1	P48813	663 aa		3.42	□□□□□ -1.86
ECM25	YJL201W	YGR125W	P53273	1036 aa		3.42	□□□□□ -1.86
ECM25	YJL201W	ALG12	P53730	551 aa		3.42	□□□□□ -1.86
ECM25	YJL201W	UBP3	Q01477	912 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.42	□□□□□ -1.86	not detected
ECM25	YJL201W	SPO20	Q04359	397 aa		3.42	□□□□□ -1.86
ECM25	YJL201W	TY1A-GR1	Q12085	440 aa		3.42	□□□□□ -1.86
ECM25	YJL201W	TY1A-PR3	Q6Q5H1	440 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
ECM25	YJL201W	TY1A-OL	Q92392	440 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
ECM25	YJL201W	STE5	P32917	917 aa		3.42	□□□□□ -1.86
ECM25	YJL201W	HXT13	P39924	564 aa		3.42	□□□□□ -1.86
ECM25	YJL201W	HXT17	P53631	564 aa		3.42	□□□□□ -1.86
ECM25	YJL201W	SIW14	P53965	281 aa		3.42	□□□□□ -1.86
ECM25	YJL201W	HXT15	P54854	567 aa		3.42	□□□□□ -1.86
ECM25	YJL201W	EST2	Q06163	884 aa		3.42	□□□□□ -1.86
ECM25	YJL201W	TRE1	Q08919	783 aa		3.42	□□□□□ -1.86
ECM25	YJL201W	YIG1	Q08956	461 aa		3.42	□□□□□ -1.86
ECM25	YJL201W	MET6	P05694	767 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
ECM25	YJL201W	VMA4	P22203	233 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
ECM25	YJL201W	LYP1	P32487	611 aa		3.41	□□□□□ -1.86
ECM25	YJL201W	TIM23	P32897	222 aa		3.41	□□□□□ -1.86
ECM25	YJL201W	THI80	P35202	319 aa		3.41	□□□□□ -1.86
ECM25	YJL201W	VBA5	P36172	582 aa		3.41	□□□□□ -1.86
ECM25	YJL201W	ATG14	P38270	344 aa		3.41	□□□□□ -1.86
ECM25	YJL201W	NUP82	P40368	713 aa		3.41	□□□□□ -1.86
ECM25	YJL201W	UTP22	P53254	1237 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
ECM25	YJL201W	ORC3	P54790	616 aa		3.41	□□□□□ -1.86
ECM25	YJL201W	RAT1	Q02792	1006 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
ECM25	YJL201W	SSY1	Q03770	852 aa		3.41	□□□□□ -1.86
ECM25	YJL201W	SPO75	Q07798	868 aa		3.41	□□□□□ -1.86
ECM25	YJL201W	FLC1	Q08967	793 aa		3.41	□□□□□ -1.86
ECM25	YJL201W	OSH2	Q12451	1283 aa		3.41	□□□□□ -1.86
ECM25	YJL201W	INO1	P11986	533 aa		3.4	□□□□□ -1.86
ECM25	YJL201W	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.86
ECM25	YJL201W	MKK2	P32491	506 aa		3.4	□□□□□ -1.86
ECM25	YJL201W	RDH54	P38086	958 aa		3.4	□□□□□ -1.86
ECM25	YJL201W	MCM7	P38132	845 aa		3.4	□□□□□ -1.86
ECM25	YJL201W	NEM1	P38757	446 aa		3.4	□□□□□ -1.86
ECM25	YJL201W	MTR4	P47047	1073 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.86
ECM25	YJL201W	ALG6	Q12001	544 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.86
ECM25	YJL201W	SCP160	P06105	1222 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.4	□□□□□ -1.87	RIP-Chip
ECM25	YJL201W	ARE1	P25628	610 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ECM25	YJL201W	PRO1	P32264	428 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ECM25	YJL201W	RRP14	P36080	434 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
ECM25	YJL201W	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
ECM25	YJL201W	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
ECM25	YJL201W	MSH4	P40965	878 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
ECM25	YJL201W	ALT1	P52893	592 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ECM25	YJL201W	DOS2	P54858	310 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ECM25	YJL201W	TIF35	Q04067	274 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
ECM25	YJL201W	UTP5	Q04177	643 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
ECM25	YJL201W	EAF1	Q06337	982 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ECM25	YJL201W	TAF13	P11747	167 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ECM25	YJL201W	PUF4	P25339	888 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.39	□□□□□ -1.87	RIP-Chip
ECM25	YJL201W	AGP1	P25376	633 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ECM25	YJL201W	SYP1	P25623	870 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
ECM25	YJL201W	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
ECM25	YJL201W	ADD66	P36040	267 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ECM25	YJL201W	FLR1	P38124	548 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ECM25	YJL201W	YGL176C	P46945	554 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ECM25	YJL201W	MEC3	Q02574	474 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ECM25	YJL201W	YVC1	Q12324	675 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ECM25	YJL201W	ERR1	P0CX10	437 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ECM25	YJL201W	ERR2	P0CX11	437 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ECM25	YJL201W	PHO8	P11491	566 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ECM25	YJL201W	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
ECM25	YJL201W	REI1	P38344	393 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
ECM25	YJL201W	MBP1	P39678	833 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ECM25	YJL201W	IRR1	P40541	1150 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ECM25	YJL201W	UBX5	Q06682	500 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ECM25	YJL201W	SBA1	P28707	216 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
ECM25	YJL201W	THI4	P32318	326 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ECM25	YJL201W	YKL107W	P34251	309 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ECM25	YJL201W	MRP8	P35719	219 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ECM25	YJL201W	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
ECM25	YJL201W	MNN1	P39106	762 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ECM25	YJL201W	EAR1	Q03212	550 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ECM25	YJL201W	GIS1	Q03833	894 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ECM25	YJL201W	SHE9	Q04172	456 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ECM25	YJL201W	FMP25	Q08023	583 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ECM25	YJL201W	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
ECM25	YJL201W	CAN1	P04817	590 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ECM25	YJL201W	NFS1	P25374	497 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ECM25	YJL201W	MLS1	P30952	554 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ECM25	YJL201W	ALG3	P38179	458 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ECM25	YJL201W	PEX7	P39108	375 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ECM25	YJL201W	CHZ1	P40019	153 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
ECM25	YJL201W	KRI1	P42846	591 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
ECM25	YJL201W	ALR2	P43553	858 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ECM25	YJL201W	AVO1	Q08236	1176 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ECM25	YJL201W	PPM2	Q08282	695 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ECM25	YJL201W	YPL066W	Q12194	479 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ECM25	YJL201W	CIT1	P00890	479 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ECM25	YJL201W	SMY2	P32909	740 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
ECM25	YJL201W	PTC7	P38797	343 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ECM25	YJL201W	FPR3	P38911	411 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
ECM25	YJL201W	CNN1	P43618	361 aa		3.36	□□□□□ -1.87
ECM25	YJL201W	PFD1	P46988	109 aa		3.36	□□□□□ -1.87

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