RNA–Protein interactions for RNA: YCL028W

RNQ1, Transcript of [PIN(+)] prion, yeast

Gene RNQ1, Length 1,218 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RNQ1	YCL028W	SPH1	Q06160	661 aa		12.53	□□□□□ -0.4
RNQ1	YCL028W	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	12.52	□□□□□ -0.41
RNQ1	YCL028W	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	12.52	□□□□□ -0.41
RNQ1	YCL028W	GSY1	P23337	708 aa		12.52	□□□□□ -0.41
RNQ1	YCL028W	BMH1	P29311	267 aa	Known RBP	12.52	□□□□□ -0.41
RNQ1	YCL028W	KNS1	P32350	737 aa	Predicted RBP	12.52	□□□□□ -0.41
RNQ1	YCL028W	UTR4	P32626	227 aa		12.52	□□□□□ -0.41
RNQ1	YCL028W	GAA1	P39012	614 aa		12.52	□□□□□ -0.41
RNQ1	YCL028W	RSC1	P53236	928 aa		12.52	□□□□□ -0.41
RNQ1	YCL028W	YAF9	P53930	226 aa		12.52	□□□□□ -0.41
RNQ1	YCL028W	ARP6	Q12509	438 aa		12.52	□□□□□ -0.41
RNQ1	YCL028W	ASH1	P34233	588 aa		12.51	□□□□□ -0.41
RNQ1	YCL028W	APE3	P37302	537 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
RNQ1	YCL028W	GPB2	P39717	880 aa		12.51	□□□□□ -0.41
RNQ1	YCL028W	DAK2	P43550	591 aa		12.51	□□□□□ -0.41
RNQ1	YCL028W	YGR153W	P48238	217 aa		12.51	□□□□□ -0.41
RNQ1	YCL028W	OYE2	Q03558	400 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
RNQ1	YCL028W	GUD1	Q07729	489 aa		12.51	□□□□□ -0.41
RNQ1	YCL028W	PSR2	Q07949	397 aa		12.51	□□□□□ -0.41
RNQ1	YCL028W	ILV1	P00927	576 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
RNQ1	YCL028W	CDC60	P26637	1090 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
RNQ1	YCL028W	CDC15	P27636	974 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RNQ1	YCL028W	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
RNQ1	YCL028W	SHP1	P34223	423 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RNQ1	YCL028W	ERG7	P38604	731 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RNQ1	YCL028W	RSC30	P38781	883 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RNQ1	YCL028W	UBA2	P52488	636 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RNQ1	YCL028W	ORC4	P54791	529 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RNQ1	YCL028W	MFM1	Q02783	413 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RNQ1	YCL028W	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
RNQ1	YCL028W	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
RNQ1	YCL028W	CDC19	P00549	500 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
RNQ1	YCL028W	RPL22A	P05749	121 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
RNQ1	YCL028W	PKC1	P24583	1151 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RNQ1	YCL028W	EUG1	P32474	517 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RNQ1	YCL028W	MCR1	P36060	302 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
RNQ1	YCL028W	RKM3	P38222	552 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RNQ1	YCL028W	YLH47	Q06493	454 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RNQ1	YCL028W	SMC6	Q12749	1114 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RNQ1	YCL028W	ISW1	P38144	1129 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RNQ1	YCL028W	ETP1	P38748	585 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
RNQ1	YCL028W	RRM3	P38766	723 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RNQ1	YCL028W	SPR3	P41901	512 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RNQ1	YCL028W	YLR326W	Q06170	240 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
RNQ1	YCL028W	TY1B-A	O13527	1196 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
RNQ1	YCL028W	PET10	P36139	283 aa		12.47	□□□□□ -0.41
RNQ1	YCL028W	YGR125W	P53273	1036 aa		12.47	□□□□□ -0.41
RNQ1	YCL028W	CBK1	P53894	756 aa		12.47	□□□□□ -0.41
RNQ1	YCL028W	ADY4	Q05955	493 aa		12.47	□□□□□ -0.41
RNQ1	YCL028W	HIR1	P32479	840 aa		12.46	□□□□□ -0.41
RNQ1	YCL028W	SRP40	P32583	406 aa	Predicted RBP	12.46	□□□□□ -0.41
RNQ1	YCL028W	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	12.46	□□□□□ -0.41
RNQ1	YCL028W	THI6	P41835	540 aa		12.46	□□□□□ -0.41
RNQ1	YCL028W	LCD1	Q04377	747 aa		12.46	□□□□□ -0.41
RNQ1	YCL028W	TIF6	Q12522	245 aa	Known RBP	12.46	□□□□□ -0.41
RNQ1	YCL028W	FOB1	O13329	566 aa		12.45	□□□□□ -0.42
RNQ1	YCL028W	TAF13	P11747	167 aa		12.45	□□□□□ -0.42
RNQ1	YCL028W	CKA2	P19454	339 aa		12.45	□□□□□ -0.42
RNQ1	YCL028W	MOT2	P34909	587 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
RNQ1	YCL028W	RSM7	P47150	247 aa		12.45	□□□□□ -0.42
RNQ1	YCL028W	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
RNQ1	YCL028W	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	12.45	□□□□□ -0.42
RNQ1	YCL028W	SLD5	Q03406	294 aa		12.45	□□□□□ -0.42
RNQ1	YCL028W	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
RNQ1	YCL028W	ISA1	Q07821	250 aa	Predicted RBP	12.45	□□□□□ -0.42
RNQ1	YCL028W	TY3A-G	Q12173	290 aa		12.45	□□□□□ -0.42
RNQ1	YCL028W	TY3A-I	Q99219	290 aa		12.45	□□□□□ -0.42
RNQ1	YCL028W	ATE1	P16639	503 aa		12.44	□□□□□ -0.42
RNQ1	YCL028W	GSY2	P27472	705 aa		12.44	□□□□□ -0.42
RNQ1	YCL028W	PGM1	P33401	570 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
RNQ1	YCL028W	FYV10	P40492	516 aa		12.44	□□□□□ -0.42
RNQ1	YCL028W	VTC2	P43585	828 aa		12.44	□□□□□ -0.42
RNQ1	YCL028W	CTR1	P49573	406 aa		12.44	□□□□□ -0.42
RNQ1	YCL028W	HUL5	P53119	910 aa		12.44	□□□□□ -0.42
RNQ1	YCL028W	DUS4	Q06063	367 aa		12.44	□□□□□ -0.42
RNQ1	YCL028W	ERP3	Q12403	225 aa		12.44	□□□□□ -0.42
RNQ1	YCL028W	UBP11	P36026	717 aa		12.43	□□□□□ -0.42
RNQ1	YCL028W	ROG3	P43602	733 aa		12.43	□□□□□ -0.42
RNQ1	YCL028W	PGA2	P53903	129 aa		12.43	□□□□□ -0.42
RNQ1	YCL028W	SSL2	Q00578	843 aa		12.43	□□□□□ -0.42
RNQ1	YCL028W	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		12.42	□□□□□ -0.42
RNQ1	YCL028W	YLR464W	P0CX17	216 aa		12.42	□□□□□ -0.42
RNQ1	YCL028W	ESS1	P22696	170 aa		12.42	□□□□□ -0.42
RNQ1	YCL028W	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	12.42	□□□□□ -0.42
RNQ1	YCL028W	CLB5	P30283	435 aa		12.42	□□□□□ -0.42
RNQ1	YCL028W	REG2	P38232	338 aa		12.42	□□□□□ -0.42
RNQ1	YCL028W	VPS29	P38759	282 aa		12.42	□□□□□ -0.42
RNQ1	YCL028W	YEL076C	P39971	216 aa		12.42	□□□□□ -0.42
RNQ1	YCL028W	ATG1	P53104	897 aa		12.42	□□□□□ -0.42
RNQ1	YCL028W	DIP5	P53388	608 aa		12.42	□□□□□ -0.42
RNQ1	YCL028W	SVF1	Q05515	481 aa		12.42	□□□□□ -0.42
RNQ1	YCL028W	PHM6	Q05637	104 aa		12.42	□□□□□ -0.42
RNQ1	YCL028W	YPR148C	Q06523	435 aa		12.42	□□□□□ -0.42
RNQ1	YCL028W	TLG2	Q08144	397 aa		12.42	□□□□□ -0.42
RNQ1	YCL028W	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	12.41	□□□□□ -0.42
RNQ1	YCL028W	CLN3	P13365	580 aa		12.41	□□□□□ -0.42
RNQ1	YCL028W	RAM2	P29703	316 aa		12.41	□□□□□ -0.42
RNQ1	YCL028W	GPD2	P41911	440 aa	Known RBP	12.41	□□□□□ -0.42
RNQ1	YCL028W	BRE2	P43132	505 aa		12.41	□□□□□ -0.42
RNQ1	YCL028W	YGL039W	P53183	348 aa	Known RBP	12.41	□□□□□ -0.42

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 45 ms