RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641482.1

MFSD8-233, Transcript of major facilitator superfamily domain containing 8, human

BASIC

Gene MFSD8, Length 4,860 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MFSD8-233	ENST00000641482	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MFSD8-233	ENST00000641482	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MFSD8-233	ENST00000641482	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MFSD8-233	ENST00000641482	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MFSD8-233	ENST00000641482	FBXO41	Q8TF61	875 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MFSD8-233	ENST00000641482	MEGF6	O75095	1541 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MFSD8-233	ENST00000641482	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MFSD8-233	ENST00000641482	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MFSD8-233	ENST00000641482	ITGB4	P16144	1822 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MFSD8-233	ENST00000641482	DCAF5	Q96JK2	942 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MFSD8-233	ENST00000641482	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MFSD8-233	ENST00000641482	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MFSD8-233	ENST00000641482	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MFSD8-233	ENST00000641482	CHL1	O00533	1208 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MFSD8-233	ENST00000641482	PRKAR2B	P31323	418 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MFSD8-233	ENST00000641482	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MFSD8-233	ENST00000641482	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MFSD8-233	ENST00000641482	ZNF579	Q8NAF0	562 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MFSD8-233	ENST00000641482	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MFSD8-233	ENST00000641482	IL2RB	P14784	551 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MFSD8-233	ENST00000641482	CCDC184	Q52MB2	194 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MFSD8-233	ENST00000641482	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MFSD8-233	ENST00000641482	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MFSD8-233	ENST00000641482	TJP1	Q07157	1748 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MFSD8-233	ENST00000641482	COL15A1	P39059	1388 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MFSD8-233	ENST00000641482	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	4.55	□□□□□ -1.68
MFSD8-233	ENST00000641482	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MFSD8-233	ENST00000641482	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MFSD8-233	ENST00000641482	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MFSD8-233	ENST00000641482	TAOK2	Q9UL54	1235 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MFSD8-233	ENST00000641482	SBF2	Q86WG5	1849 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MFSD8-233	ENST00000641482	KIF16B	Q96L93	1317 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MFSD8-233	ENST00000641482	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MFSD8-233	ENST00000641482	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MFSD8-233	ENST00000641482	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MFSD8-233	ENST00000641482	RIOK3	O14730	519 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MFSD8-233	ENST00000641482	PDE3A	Q14432	1141 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MFSD8-233	ENST00000641482	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MFSD8-233	ENST00000641482	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MFSD8-233	ENST00000641482	LAMB2	P55268	1798 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MFSD8-233	ENST00000641482	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MFSD8-233	ENST00000641482	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MFSD8-233	ENST00000641482	PTPRC	P08575	1304 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MFSD8-233	ENST00000641482	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MFSD8-233	ENST00000641482	RIPK4	P57078	832 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MFSD8-233	ENST00000641482	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MFSD8-233	ENST00000641482	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MFSD8-233	ENST00000641482	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MFSD8-233	ENST00000641482	KIF12	Q96FN5	646 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MFSD8-233	ENST00000641482	PHF12	Q96QT6	1004 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MFSD8-233	ENST00000641482	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MFSD8-233	ENST00000641482	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MFSD8-233	ENST00000641482	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MFSD8-233	ENST00000641482	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MFSD8-233	ENST00000641482	NBPF4	Q96M43	638 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MFSD8-233	ENST00000641482	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MFSD8-233	ENST00000641482	PHKG2	P15735	406 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MFSD8-233	ENST00000641482	FAM83G	A6ND36	823 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MFSD8-233	ENST00000641482	APAF1	O14727	1248 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MFSD8-233	ENST00000641482	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MFSD8-233	ENST00000641482	ZNF467	Q7Z7K2	595 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MFSD8-233	ENST00000641482	SCN7A	Q01118	1682 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MFSD8-233	ENST00000641482	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MFSD8-233	ENST00000641482	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MFSD8-233	ENST00000641482	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MFSD8-233	ENST00000641482	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MFSD8-233	ENST00000641482	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		4.53	□□□□□ -1.69
MFSD8-233	ENST00000641482	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
MFSD8-233	ENST00000641482	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
MFSD8-233	ENST00000641482	CLCN6	P51797	869 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MFSD8-233	ENST00000641482	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
MFSD8-233	ENST00000641482	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
MFSD8-233	ENST00000641482	MAP3K13	O43283	966 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MFSD8-233	ENST00000641482	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MFSD8-233	ENST00000641482	PCDHB13	Q9Y5F0	798 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MFSD8-233	ENST00000641482	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MFSD8-233	ENST00000641482	NUTM2F	A1L443	756 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MFSD8-233	ENST00000641482	EVX2	Q03828	476 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MFSD8-233	ENST00000641482	RNF25	Q96BH1	459 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
MFSD8-233	ENST00000641482	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MFSD8-233	ENST00000641482	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MFSD8-233	ENST00000641482	EVA1C	P58658	441 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MFSD8-233	ENST00000641482	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
MFSD8-233	ENST00000641482	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MFSD8-233	ENST00000641482	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
MFSD8-233	ENST00000641482	BTAF1	O14981	1849 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MFSD8-233	ENST00000641482	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MFSD8-233	ENST00000641482	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		4.5	□□□□□ -1.69
MFSD8-233	ENST00000641482	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		4.5	□□□□□ -1.69
MFSD8-233	ENST00000641482	PCDHB8	Q9UN66	801 aa		4.5	□□□□□ -1.69
MFSD8-233	ENST00000641482	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		4.5	□□□□□ -1.69
MFSD8-233	ENST00000641482	BTG4	Q9NY30	223 aa		4.5	□□□□□ -1.69
MFSD8-233	ENST00000641482	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		4.5	□□□□□ -1.69
MFSD8-233	ENST00000641482	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
MFSD8-233	ENST00000641482	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
MFSD8-233	ENST00000641482	NGLY1	Q96IV0	654 aa		4.5	□□□□□ -1.69
MFSD8-233	ENST00000641482	IFNL1	Q8IU54	200 aa		4.5	□□□□□ -1.69
MFSD8-233	ENST00000641482	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		4.5	□□□□□ -1.69
MFSD8-233	ENST00000641482	ABCC4	O15439	1325 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MFSD8-233	ENST00000641482	EXOC5	O00471	708 aa		4.49	□□□□□ -1.69

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.2 ms