RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612680.1

AC006441.5-201, humanhuman

BASIC

Gene AC006441.5, Length 209 nt, Biotype unprocessed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC006441.5-201ENST00000612680 TLR1Q15399 786 aa3.41□□□□□ -1.86
AC006441.5-201ENST00000612680 TRIM52Q96A61 297 aa3.41□□□□□ -1.86
AC006441.5-201ENST00000612680 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
AC006441.5-201ENST00000612680 H7C1W4 665 aa3.4□□□□□ -1.87
AC006441.5-201ENST00000612680 SKIP12755 728 aa3.4□□□□□ -1.87
AC006441.5-201ENST00000612680 MSX1P28360 303 aa3.4□□□□□ -1.87
AC006441.5-201ENST00000612680 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
AC006441.5-201ENST00000612680 IRS1P35568 1242 aa3.4□□□□□ -1.87
AC006441.5-201ENST00000612680 PLA2G4AP47712 749 aa3.4□□□□□ -1.87
AC006441.5-201ENST00000612680 MARSP56192 900 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
AC006441.5-201ENST00000612680 RASSF7Q02833 373 aa3.4□□□□□ -1.87
AC006441.5-201ENST00000612680 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
AC006441.5-201ENST00000612680 KCNMA1Q12791 1236 aa3.4□□□□□ -1.87
AC006441.5-201ENST00000612680 WASHC4Q2M389 1173 aa3.4□□□□□ -1.87
AC006441.5-201ENST00000612680 GNASQ5JWF2 1037 aa3.4□□□□□ -1.87
AC006441.5-201ENST00000612680 FOXR1Q6PIV2 292 aa3.4□□□□□ -1.87
AC006441.5-201ENST00000612680 DEPDC4Q8N2C3 294 aa3.4□□□□□ -1.87
AC006441.5-201ENST00000612680 ACDQ96AP0 544 aa3.4□□□□□ -1.87
AC006441.5-201ENST00000612680 AIDAQ96BJ3 306 aa3.4□□□□□ -1.87
AC006441.5-201ENST00000612680 MBIPQ9NS73 344 aa3.4□□□□□ -1.87
AC006441.5-201ENST00000612680 CHIC2Q9UKJ5 165 aa3.4□□□□□ -1.87
AC006441.5-201ENST00000612680 PARP3Q9Y6F1 533 aa3.4□□□□□ -1.87
AC006441.5-201ENST00000612680 USP3Q9Y6I4 520 aa3.4□□□□□ -1.87
AC006441.5-201ENST00000612680 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa3.4□□□□□ -1.87
AC006441.5-201ENST00000612680 TMEM229AB2RXF0 380 aa3.39□□□□□ -1.87
AC006441.5-201ENST00000612680 GDF11O95390 407 aa3.39□□□□□ -1.87
AC006441.5-201ENST00000612680 INHAP05111 366 aa3.39□□□□□ -1.87
AC006441.5-201ENST00000612680 MX2P20592 715 aa3.39□□□□□ -1.87
AC006441.5-201ENST00000612680 MAP3K10Q02779 954 aa3.39□□□□□ -1.87
AC006441.5-201ENST00000612680 ESCO1Q5FWF5 840 aa3.39□□□□□ -1.87
AC006441.5-201ENST00000612680 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
AC006441.5-201ENST00000612680 TRERF1Q96PN7 1200 aa3.39□□□□□ -1.87
AC006441.5-201ENST00000612680 A0A1B0GTH6 734 aa3.38□□□□□ -1.87
AC006441.5-201ENST00000612680 C2CD2LO14523 706 aa3.38□□□□□ -1.87
AC006441.5-201ENST00000612680 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa3.38□□□□□ -1.87
AC006441.5-201ENST00000612680 SMTNP53814 917 aa3.38□□□□□ -1.87
AC006441.5-201ENST00000612680 NCOA4Q13772 614 aa3.38□□□□□ -1.87
AC006441.5-201ENST00000612680 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
AC006441.5-201ENST00000612680 WDR44Q5JSH3 913 aa3.38□□□□□ -1.87
AC006441.5-201ENST00000612680 TBCELQ5QJ74 424 aa3.38□□□□□ -1.87
AC006441.5-201ENST00000612680 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
AC006441.5-201ENST00000612680 PGBD3Q8N328 593 aa3.38□□□□□ -1.87
AC006441.5-201ENST00000612680 TMEM151AQ8N4L1 468 aa3.38□□□□□ -1.87
AC006441.5-201ENST00000612680 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP3.38□□□□□ -1.87
AC006441.5-201ENST00000612680 NEDD1Q8NHV4 660 aa3.38□□□□□ -1.87
AC006441.5-201ENST00000612680 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa3.38□□□□□ -1.87
AC006441.5-201ENST00000612680 RHBDD1Q8TEB9 315 aa3.38□□□□□ -1.87
AC006441.5-201ENST00000612680 CLUAP1Q96AJ1 413 aa3.38□□□□□ -1.87
AC006441.5-201ENST00000612680 SIRT1Q96EB6 747 aa3.38□□□□□ -1.87
AC006441.5-201ENST00000612680 ABHD17AQ96GS6 310 aa3.38□□□□□ -1.87
AC006441.5-201ENST00000612680 GMCL1Q96IK5 515 aa3.38□□□□□ -1.87
AC006441.5-201ENST00000612680 ALG2Q9H553 416 aa3.38□□□□□ -1.87
AC006441.5-201ENST00000612680 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa3.38□□□□□ -1.87
AC006441.5-201ENST00000612680 RAD21O60216 631 aa3.37□□□□□ -1.87
AC006441.5-201ENST00000612680 BNIP3LO60238 219 aa3.37□□□□□ -1.87
AC006441.5-201ENST00000612680 BCRP11274 1271 aa3.37□□□□□ -1.87
AC006441.5-201ENST00000612680 UBTFP17480 764 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
AC006441.5-201ENST00000612680 GTF2IP78347 998 aa3.37□□□□□ -1.87
AC006441.5-201ENST00000612680 CTBSQ01459 385 aa3.37□□□□□ -1.87
AC006441.5-201ENST00000612680 PSME1Q06323 249 aa3.37□□□□□ -1.87
AC006441.5-201ENST00000612680 EML3Q32P44 896 aa3.37□□□□□ -1.87
AC006441.5-201ENST00000612680 MAP7D1Q3KQU3 841 aa3.37□□□□□ -1.87
AC006441.5-201ENST00000612680 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa3.37□□□□□ -1.87
AC006441.5-201ENST00000612680 KLRG1Q96E93 195 aa3.37□□□□□ -1.87
AC006441.5-201ENST00000612680 CABP1Q9NZU7 370 aa3.37□□□□□ -1.87
AC006441.5-201ENST00000612680 DCDC2BA2VCK2 349 aa3.36□□□□□ -1.87
AC006441.5-201ENST00000612680 A6NJY4 79 aa3.36□□□□□ -1.87
AC006441.5-201ENST00000612680 SHISA8B8ZZ34 492 aa3.36□□□□□ -1.87
AC006441.5-201ENST00000612680 BMP4P12644 408 aa3.36□□□□□ -1.87
AC006441.5-201ENST00000612680 ATP4AP20648 1035 aa3.36□□□□□ -1.87
AC006441.5-201ENST00000612680 SOX11P35716 441 aa3.36□□□□□ -1.87
AC006441.5-201ENST00000612680 TXLNAP40222 546 aa3.36□□□□□ -1.87
AC006441.5-201ENST00000612680 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
AC006441.5-201ENST00000612680 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
AC006441.5-201ENST00000612680 EFHC2Q5JST6 749 aa3.36□□□□□ -1.87
AC006441.5-201ENST00000612680 GPAT2Q6NUI2 795 aa3.36□□□□□ -1.87
AC006441.5-201ENST00000612680 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa3.36□□□□□ -1.87
AC006441.5-201ENST00000612680 TNS4Q8IZW8 715 aa3.36□□□□□ -1.87
AC006441.5-201ENST00000612680 GALNT6Q8NCL4 622 aa3.36□□□□□ -1.87
AC006441.5-201ENST00000612680 CFHR5Q9BXR6 569 aa3.36□□□□□ -1.87
AC006441.5-201ENST00000612680 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
AC006441.5-201ENST00000612680 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
AC006441.5-201ENST00000612680 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
AC006441.5-201ENST00000612680 HCN2Q9UL51 889 aa3.36□□□□□ -1.87
AC006441.5-201ENST00000612680 KIAA1024Q9UPX6 916 aa3.36□□□□□ -1.87
AC006441.5-201ENST00000612680 NOD1Q9Y239 953 aa3.36□□□□□ -1.87
AC006441.5-201ENST00000612680 A0A1W2PNR3 127 aa3.35□□□□□ -1.87
AC006441.5-201ENST00000612680 USP17L5A8MUK1 530 aa3.35□□□□□ -1.87
AC006441.5-201ENST00000612680 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
AC006441.5-201ENST00000612680 OIP5O43482 229 aa3.35□□□□□ -1.87
AC006441.5-201ENST00000612680 LGR5O75473 907 aa3.35□□□□□ -1.87
AC006441.5-201ENST00000612680 FGFR3P22607 806 aa3.35□□□□□ -1.87
AC006441.5-201ENST00000612680 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa3.35□□□□□ -1.87
AC006441.5-201ENST00000612680 WWC1Q8IX03 1113 aa3.35□□□□□ -1.87
AC006441.5-201ENST00000612680 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa3.35□□□□□ -1.87
AC006441.5-201ENST00000612680 GAS2L2Q8NHY3 880 aa3.35□□□□□ -1.87
AC006441.5-201ENST00000612680 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa3.35□□□□□ -1.87
AC006441.5-201ENST00000612680 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
AC006441.5-201ENST00000612680 SLC4A9Q96Q91 983 aa3.35□□□□□ -1.87
AC006441.5-201ENST00000612680 UCN2Q96RP3 112 aa3.35□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.7 ms