RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 MTFR1LQ9H019 292 aa32.92■■■□□ 2.86
CAPNS1-204ENST00000587718 SGIP1Q9BQI5 828 aa32.92■■■□□ 2.86
CAPNS1-204ENST00000587718 KCNQ4P56696 695 aa32.91■■■□□ 2.86
CAPNS1-204ENST00000587718 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP32.89■■■□□ 2.86
CAPNS1-204ENST00000587718 LY75O60449 1722 aa32.89■■■□□ 2.85
CAPNS1-204ENST00000587718 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP32.87■■■□□ 2.85
CAPNS1-204ENST00000587718 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP32.86■■■□□ 2.85
CAPNS1-204ENST00000587718 CRBNQ96SW2 442 aa32.86■■■□□ 2.85
CAPNS1-204ENST00000587718 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP32.86■■■□□ 2.85
CAPNS1-204ENST00000587718 PKD1L3Q7Z443 1732 aa32.85■■■□□ 2.85
CAPNS1-204ENST00000587718 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP32.84■■■□□ 2.85
CAPNS1-204ENST00000587718 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP32.84■■■□□ 2.85
CAPNS1-204ENST00000587718 MS4A1P11836 297 aa32.83■■■□□ 2.85
CAPNS1-204ENST00000587718 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP32.83■■■□□ 2.85
CAPNS1-204ENST00000587718 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa32.82■■■□□ 2.84
CAPNS1-204ENST00000587718 SPG7Q9UQ90 795 aa32.82■■■□□ 2.84
CAPNS1-204ENST00000587718 PLIN1O60240 522 aa32.81■■■□□ 2.84
CAPNS1-204ENST00000587718 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP32.81■■■□□ 2.84
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC16A10Q8TF71 515 aa32.79■■■□□ 2.84
CAPNS1-204ENST00000587718 PDE3AQ14432 1141 aa32.79■■■□□ 2.84
CAPNS1-204ENST00000587718 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa32.79■■■□□ 2.84
CAPNS1-204ENST00000587718 QSER1Q2KHR3 1735 aa32.78■■■□□ 2.84
CAPNS1-204ENST00000587718 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP32.78■■■□□ 2.84
CAPNS1-204ENST00000587718 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa32.78■■■□□ 2.84
CAPNS1-204ENST00000587718 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa32.78■■■□□ 2.84
CAPNS1-204ENST00000587718 IGSF1Q8N6C5 1336 aa32.77■■■□□ 2.84
CAPNS1-204ENST00000587718 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP32.77■■■□□ 2.84
CAPNS1-204ENST00000587718 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP32.77■■■□□ 2.84
CAPNS1-204ENST00000587718 AAMPQ13685 434 aa32.77■■■□□ 2.84
CAPNS1-204ENST00000587718 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP32.77■■■□□ 2.84
CAPNS1-204ENST00000587718 SYT17Q9BSW7 474 aa32.76■■■□□ 2.84
CAPNS1-204ENST00000587718 MYH16Q9H6N6 1097 aa32.75■■■□□ 2.83
CAPNS1-204ENST00000587718 PIGBQ92521 554 aa32.75■■■□□ 2.83
CAPNS1-204ENST00000587718 PALLDQ8WX93 1383 aa32.74■■■□□ 2.83
CAPNS1-204ENST00000587718 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa32.74■■■□□ 2.83
CAPNS1-204ENST00000587718 ARXQ96QS3 562 aa32.74■■■□□ 2.83
CAPNS1-204ENST00000587718 IL16Q14005 1332 aa32.73■■■□□ 2.83
CAPNS1-204ENST00000587718 PHKG2P15735 406 aa32.73■■■□□ 2.83
CAPNS1-204ENST00000587718 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP32.72■■■□□ 2.83
CAPNS1-204ENST00000587718 PLEKHF1Q96S99 279 aa32.72■■■□□ 2.83
CAPNS1-204ENST00000587718 IFNL2Q8IZJ0 200 aa32.71■■■□□ 2.83
CAPNS1-204ENST00000587718 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa32.71■■■□□ 2.83
CAPNS1-204ENST00000587718 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP32.7■■■□□ 2.83
CAPNS1-204ENST00000587718 KDM2BQ8NHM5 1336 aa32.7■■■□□ 2.83
CAPNS1-204ENST00000587718 ITGB4P16144 1822 aa32.7■■■□□ 2.83
CAPNS1-204ENST00000587718 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP32.7■■■□□ 2.82
CAPNS1-204ENST00000587718 C20orf194Q5TEA3 1177 aa32.69■■■□□ 2.82
CAPNS1-204ENST00000587718 COL24A1Q17RW2 1714 aa32.69■■■□□ 2.82
CAPNS1-204ENST00000587718 MAP3K5Q99683 1374 aa32.68■■■□□ 2.82
CAPNS1-204ENST00000587718 DCAF8L1A6NGE4 600 aa32.67■■■□□ 2.82
CAPNS1-204ENST00000587718 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP32.67■■■□□ 2.82
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CAPNS1-204ENST00000587718 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa32.65■■■□□ 2.82
CAPNS1-204ENST00000587718 C5P01031 1676 aa32.64■■■□□ 2.82
CAPNS1-204ENST00000587718 TMOD3Q9NYL9 352 aa32.63■■■□□ 2.81
CAPNS1-204ENST00000587718 ANP32EQ9BTT0 268 aa32.62■■■□□ 2.81
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CAPNS1-204ENST00000587718 IL13P35225 146 aa32.61■■■□□ 2.81
CAPNS1-204ENST00000587718 RARSP54136 660 aaKnown RBP32.61■■■□□ 2.81
CAPNS1-204ENST00000587718 ASAP1Q9ULH1 1129 aa32.61■■■□□ 2.81
CAPNS1-204ENST00000587718 TAF1LQ8IZX4 1826 aa32.6■■■□□ 2.81
CAPNS1-204ENST00000587718 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP32.6■■■□□ 2.81
CAPNS1-204ENST00000587718 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa32.59■■■□□ 2.81
CAPNS1-204ENST00000587718 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP32.59■■■□□ 2.81
CAPNS1-204ENST00000587718 BCAR3O75815 825 aa32.59■■■□□ 2.81
CAPNS1-204ENST00000587718 YY1P25490 414 aa32.59■■■□□ 2.81
CAPNS1-204ENST00000587718 SIK1P57059 783 aa32.59■■■□□ 2.81
CAPNS1-204ENST00000587718 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP32.59■■■□□ 2.81
CAPNS1-204ENST00000587718 NEUROD2Q15784 382 aa32.58■■■□□ 2.81
CAPNS1-204ENST00000587718 AMOTQ4VCS5 1084 aa32.58■■■□□ 2.81
CAPNS1-204ENST00000587718 KDRP35968 1356 aa32.57■■■□□ 2.8
CAPNS1-204ENST00000587718 AMIGO3Q86WK7 504 aa32.57■■■□□ 2.8
CAPNS1-204ENST00000587718 FLAD1Q8NFF5 587 aa32.57■■■□□ 2.8
CAPNS1-204ENST00000587718 ATG3Q9NT62 314 aa32.57■■■□□ 2.8
CAPNS1-204ENST00000587718 C4BP0C0L5 1744 aa32.56■■■□□ 2.8
CAPNS1-204ENST00000587718 ERVV-2B6SEH9 535 aa32.56■■■□□ 2.8
CAPNS1-204ENST00000587718 MSH5O43196 834 aa32.56■■■□□ 2.8
CAPNS1-204ENST00000587718 DCAF5Q96JK2 942 aa32.56■■■□□ 2.8
CAPNS1-204ENST00000587718 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP32.55■■■□□ 2.8
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CAPNS1-204ENST00000587718 LINC00116Q8NCU8 138 aa32.53■■■□□ 2.8
CAPNS1-204ENST00000587718 NEFMP07197 916 aa32.53■■■□□ 2.8
CAPNS1-204ENST00000587718 ITPK1Q13572 414 aa32.53■■■□□ 2.8
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP32.53■■■□□ 2.8
CAPNS1-204ENST00000587718 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP32.52■■■□□ 2.8
CAPNS1-204ENST00000587718 AK7Q96M32 723 aa32.52■■■□□ 2.8
CAPNS1-204ENST00000587718 TRIM35Q9UPQ4 493 aa32.52■■■□□ 2.8
CAPNS1-204ENST00000587718 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP32.49■■■□□ 2.79
CAPNS1-204ENST00000587718 MSL1Q68DK7 614 aa32.49■■■□□ 2.79
CAPNS1-204ENST00000587718 BACH2Q9BYV9 841 aa32.49■■■□□ 2.79
CAPNS1-204ENST00000587718 RSPH6AQ9H0K4 717 aa32.49■■■□□ 2.79
CAPNS1-204ENST00000587718 CANXP27824 592 aaKnown RBP32.49■■■□□ 2.79
CAPNS1-204ENST00000587718 ATP6V1AP38606 617 aa32.49■■■□□ 2.79
CAPNS1-204ENST00000587718 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP32.49■■■□□ 2.79
CAPNS1-204ENST00000587718 SMIM5Q71RC9 77 aa32.49■■■□□ 2.79
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC4A9Q96Q91 983 aa32.48■■■□□ 2.79
CAPNS1-204ENST00000587718 UTRNP46939 3433 aa32.47■■■□□ 2.79
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