RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574322.5

CTDNEP1-210, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-210ENST00000574322 UNC5CLQ8IV45 518 aa36.17■■■■□ 3.38
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CTDNEP1-210ENST00000574322 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa36.16■■■■□ 3.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 NWD2Q9ULI1 1742 aa36.16■■■■□ 3.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP36.15■■■■□ 3.38
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CTDNEP1-210ENST00000574322 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa36.14■■■■□ 3.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 NLRP2Q9NX02 1062 aa36.14■■■■□ 3.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 C1orf141Q5JVX7 400 aa36.14■■■■□ 3.38
CTDNEP1-210ENST00000574322 KDM3BQ7LBC6 1761 aa36.13■■■■□ 3.37
CTDNEP1-210ENST00000574322 LGR6Q9HBX8 967 aa36.13■■■■□ 3.37
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CTDNEP1-210ENST00000574322 WDR17Q8IZU2 1322 aa36.11■■■■□ 3.37
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CTDNEP1-210ENST00000574322 VPS72Q15906 364 aa36.05■■■■□ 3.36
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CTDNEP1-210ENST00000574322 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP36.05■■■■□ 3.36
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CTDNEP1-210ENST00000574322 CYP27B1O15528 508 aa35.87■■■■□ 3.33
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CTDNEP1-210ENST00000574322 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP35.77■■■■□ 3.32
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CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF790Q6PG37 636 aa35.76■■■■□ 3.31
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CTDNEP1-210ENST00000574322 F6X3S4 739 aa35.75■■■■□ 3.31
CTDNEP1-210ENST00000574322 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP35.75■■■■□ 3.31
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