RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000571473.2

TVP23CP2-201, Transcript of TVP23C pseudogene 2, humanhuman

BASIC

Gene TVP23CP2, Length 623 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23CP2-201ENST00000571473 CTC1Q2NKJ3 1217 aa7.28□□□□□ -1.24
TVP23CP2-201ENST00000571473 MSS51Q4VC12 460 aa7.28□□□□□ -1.24
TVP23CP2-201ENST00000571473 TREML4Q6UXN2 200 aa7.28□□□□□ -1.24
TVP23CP2-201ENST00000571473 SPON1Q9HCB6 807 aa7.28□□□□□ -1.24
TVP23CP2-201ENST00000571473 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa7.27□□□□□ -1.24
TVP23CP2-201ENST00000571473 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
TVP23CP2-201ENST00000571473 LMTK2Q8IWU2 1503 aa7.27□□□□□ -1.25
TVP23CP2-201ENST00000571473 AXIN1O15169 862 aa7.27□□□□□ -1.25
TVP23CP2-201ENST00000571473 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
TVP23CP2-201ENST00000571473 MPHOSPH9Q99550 1183 aa7.27□□□□□ -1.25
TVP23CP2-201ENST00000571473 PRDM9Q9NQV7 894 aa7.27□□□□□ -1.25
TVP23CP2-201ENST00000571473 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
TVP23CP2-201ENST00000571473 CLSPNQ9HAW4 1339 aa7.27□□□□□ -1.25
TVP23CP2-201ENST00000571473 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
TVP23CP2-201ENST00000571473 PLCB2Q00722 1185 aa7.26□□□□□ -1.25
TVP23CP2-201ENST00000571473 Q3C1V9 767 aa7.26□□□□□ -1.25
TVP23CP2-201ENST00000571473 GPIHBP1Q8IV16 184 aa7.26□□□□□ -1.25
TVP23CP2-201ENST00000571473 SLC52A1Q9NWF4 448 aa7.26□□□□□ -1.25
TVP23CP2-201ENST00000571473 DACH1Q9UI36 760 aa7.26□□□□□ -1.25
TVP23CP2-201ENST00000571473 UNC13BO14795 1591 aa7.25□□□□□ -1.25
TVP23CP2-201ENST00000571473 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
TVP23CP2-201ENST00000571473 FAM83GA6ND36 823 aa7.25□□□□□ -1.25
TVP23CP2-201ENST00000571473 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa7.25□□□□□ -1.25
TVP23CP2-201ENST00000571473 UBR1Q8IWV7 1749 aa7.24□□□□□ -1.25
TVP23CP2-201ENST00000571473 ABCC3O15438 1527 aa7.24□□□□□ -1.25
TVP23CP2-201ENST00000571473 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
TVP23CP2-201ENST00000571473 WNT7AO00755 349 aa7.24□□□□□ -1.25
TVP23CP2-201ENST00000571473 KCNQ2O43526 872 aa7.24□□□□□ -1.25
TVP23CP2-201ENST00000571473 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
TVP23CP2-201ENST00000571473 MMP16P51512 607 aa7.23□□□□□ -1.25
TVP23CP2-201ENST00000571473 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
TVP23CP2-201ENST00000571473 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
TVP23CP2-201ENST00000571473 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
TVP23CP2-201ENST00000571473 ATRNO75882 1429 aa7.23□□□□□ -1.25
TVP23CP2-201ENST00000571473 UTRNP46939 3433 aa7.23□□□□□ -1.25
TVP23CP2-201ENST00000571473 IQGAP3Q86VI3 1631 aa7.23□□□□□ -1.25
TVP23CP2-201ENST00000571473 KCNA6P17658 529 aa7.22□□□□□ -1.25
TVP23CP2-201ENST00000571473 TRIM32Q13049 653 aa7.22□□□□□ -1.25
TVP23CP2-201ENST00000571473 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa7.22□□□□□ -1.25
TVP23CP2-201ENST00000571473 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
TVP23CP2-201ENST00000571473 EFCAB6Q5THR3 1501 aa7.22□□□□□ -1.25
TVP23CP2-201ENST00000571473 MROH1Q8NDA8 1641 aa7.21□□□□□ -1.26
TVP23CP2-201ENST00000571473 KDM4AO75164 1064 aa7.21□□□□□ -1.26
TVP23CP2-201ENST00000571473 CD46P15529 392 aa7.21□□□□□ -1.26
TVP23CP2-201ENST00000571473 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
TVP23CP2-201ENST00000571473 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
TVP23CP2-201ENST00000571473 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
TVP23CP2-201ENST00000571473 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa7.21□□□□□ -1.26
TVP23CP2-201ENST00000571473 TET3O43151 1660 aa7.21□□□□□ -1.26
TVP23CP2-201ENST00000571473 CEP152O94986 1710 aa7.21□□□□□ -1.26
TVP23CP2-201ENST00000571473 DIP2AQ14689 1571 aa7.2□□□□□ -1.26
TVP23CP2-201ENST00000571473 CCDC144AA2RUR9 1427 aa7.2□□□□□ -1.26
TVP23CP2-201ENST00000571473 NOS1P29475 1434 aa7.2□□□□□ -1.26
TVP23CP2-201ENST00000571473 ERVK-7P63135 1459 aa7.2□□□□□ -1.26
TVP23CP2-201ENST00000571473 RALGAPBQ86X10 1494 aa7.2□□□□□ -1.26
TVP23CP2-201ENST00000571473 WFS1O76024 890 aa7.2□□□□□ -1.26
TVP23CP2-201ENST00000571473 MAP2K5Q13163 448 aa7.2□□□□□ -1.26
TVP23CP2-201ENST00000571473 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
TVP23CP2-201ENST00000571473 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
TVP23CP2-201ENST00000571473 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
TVP23CP2-201ENST00000571473 TNS2Q63HR2 1409 aa7.19□□□□□ -1.26
TVP23CP2-201ENST00000571473 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
TVP23CP2-201ENST00000571473 DXOO77932 396 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
TVP23CP2-201ENST00000571473 SMPD1P17405 629 aa7.19□□□□□ -1.26
TVP23CP2-201ENST00000571473 USP46P62068 366 aa7.19□□□□□ -1.26
TVP23CP2-201ENST00000571473 TXNDC2Q86VQ3 553 aa7.19□□□□□ -1.26
TVP23CP2-201ENST00000571473 MRGPRX2Q96LB1 330 aa7.19□□□□□ -1.26
TVP23CP2-201ENST00000571473 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
TVP23CP2-201ENST00000571473 AATKQ6ZMQ8 1374 aa7.19□□□□□ -1.26
TVP23CP2-201ENST00000571473 SLIT1O75093 1534 aa7.18□□□□□ -1.26
TVP23CP2-201ENST00000571473 IRF6O14896 467 aa7.18□□□□□ -1.26
TVP23CP2-201ENST00000571473 C14orf37Q86TY3 774 aa7.18□□□□□ -1.26
TVP23CP2-201ENST00000571473 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP7.18□□□□□ -1.26
TVP23CP2-201ENST00000571473 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa7.18□□□□□ -1.26
TVP23CP2-201ENST00000571473 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa7.18□□□□□ -1.26
TVP23CP2-201ENST00000571473 BRWD3Q6RI45 1802 aa7.17□□□□□ -1.26
TVP23CP2-201ENST00000571473 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
TVP23CP2-201ENST00000571473 ARHGAP23Q9P227 1491 aa7.17□□□□□ -1.26
TVP23CP2-201ENST00000571473 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
TVP23CP2-201ENST00000571473 LTKP29376 864 aa7.17□□□□□ -1.26
TVP23CP2-201ENST00000571473 SEPT12Q8IYM1 358 aa7.17□□□□□ -1.26
TVP23CP2-201ENST00000571473 TRPM2O94759 1503 aa7.17□□□□□ -1.26
TVP23CP2-201ENST00000571473 PIK3C2BO00750 1634 aa7.16□□□□□ -1.26
TVP23CP2-201ENST00000571473 J3QL48 77 aa7.16□□□□□ -1.26
TVP23CP2-201ENST00000571473 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
TVP23CP2-201ENST00000571473 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
TVP23CP2-201ENST00000571473 IDI1Q13907 227 aa7.16□□□□□ -1.26
TVP23CP2-201ENST00000571473 NBPF8Q3BBV2 869 aa7.16□□□□□ -1.26
TVP23CP2-201ENST00000571473 NBPF14Q5TI25 921 aa7.16□□□□□ -1.26
TVP23CP2-201ENST00000571473 BRINP3Q76B58 766 aa7.16□□□□□ -1.26
TVP23CP2-201ENST00000571473 KRT27Q7Z3Y8 459 aa7.16□□□□□ -1.26
TVP23CP2-201ENST00000571473 CCDC24Q8N4L8 307 aa7.16□□□□□ -1.26
TVP23CP2-201ENST00000571473 SYT17Q9BSW7 474 aa7.16□□□□□ -1.26
TVP23CP2-201ENST00000571473 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
TVP23CP2-201ENST00000571473 SENP2Q9HC62 589 aa7.16□□□□□ -1.26
TVP23CP2-201ENST00000571473 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa7.16□□□□□ -1.26
TVP23CP2-201ENST00000571473 EID1Q9Y6B2 187 aa7.16□□□□□ -1.26
TVP23CP2-201ENST00000571473 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
TVP23CP2-201ENST00000571473 ATF3P18847 181 aa7.15□□□□□ -1.26
TVP23CP2-201ENST00000571473 WNT7BP56706 349 aa7.15□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms