RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570016.5

CDIPT-210, Transcript of CDP-diacylglycerol--inositol 3-phosphatidyltransferase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CDIPT, Length 1,346 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDIPT-210ENST00000570016 FLAD1Q8NFF5 587 aa29.2■■■□□ 2.26
CDIPT-210ENST00000570016 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
CDIPT-210ENST00000570016 MRC1P22897 1456 aa29.18■■■□□ 2.26
CDIPT-210ENST00000570016 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP29.18■■■□□ 2.26
CDIPT-210ENST00000570016 ITPK1Q13572 414 aa29.18■■■□□ 2.26
CDIPT-210ENST00000570016 LINC00116Q8NCU8 138 aa29.17■■■□□ 2.26
CDIPT-210ENST00000570016 UBR3Q6ZT12 1888 aa29.16■■■□□ 2.26
CDIPT-210ENST00000570016 ATP6V1AP38606 617 aa29.16■■■□□ 2.26
CDIPT-210ENST00000570016 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa29.16■■■□□ 2.26
CDIPT-210ENST00000570016 SLC4A9Q96Q91 983 aa29.16■■■□□ 2.26
CDIPT-210ENST00000570016 MAP3K5Q99683 1374 aa29.15■■■□□ 2.26
CDIPT-210ENST00000570016 AK7Q96M32 723 aa29.15■■■□□ 2.26
CDIPT-210ENST00000570016 ARXQ96QS3 562 aa29.15■■■□□ 2.26
CDIPT-210ENST00000570016 RNMTO43148 476 aaKnown RBP29.14■■■□□ 2.25
CDIPT-210ENST00000570016 SLC52A2Q9HAB3 445 aa29.14■■■□□ 2.25
CDIPT-210ENST00000570016 AMIGO3Q86WK7 504 aa29.13■■■□□ 2.25
CDIPT-210ENST00000570016 LGR6Q9HBX8 967 aa29.13■■■□□ 2.25
CDIPT-210ENST00000570016 NUDCQ9Y266 331 aa29.13■■■□□ 2.25
CDIPT-210ENST00000570016 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP29.12■■■□□ 2.25
CDIPT-210ENST00000570016 SSFA2P28290 1259 aa29.12■■■□□ 2.25
CDIPT-210ENST00000570016 RSPH6AQ9H0K4 717 aa29.12■■■□□ 2.25
CDIPT-210ENST00000570016 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
CDIPT-210ENST00000570016 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP29.11■■■□□ 2.25
CDIPT-210ENST00000570016 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP29.1■■■□□ 2.25
CDIPT-210ENST00000570016 POLD1P28340 1107 aa29.1■■■□□ 2.25
CDIPT-210ENST00000570016 GAS2L2Q8NHY3 880 aa29.1■■■□□ 2.25
CDIPT-210ENST00000570016 SYT17Q9BSW7 474 aa29.1■■■□□ 2.25
CDIPT-210ENST00000570016 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
CDIPT-210ENST00000570016 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
CDIPT-210ENST00000570016 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
CDIPT-210ENST00000570016 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa29.07■■■□□ 2.24
CDIPT-210ENST00000570016 MSH5O43196 834 aa29.06■■■□□ 2.24
CDIPT-210ENST00000570016 FCHSD2O94868 740 aa29.06■■■□□ 2.24
CDIPT-210ENST00000570016 PRKAR2BP31323 418 aa29.05■■■□□ 2.24
CDIPT-210ENST00000570016 GNPATO15228 680 aa29.04■■■□□ 2.24
CDIPT-210ENST00000570016 PHACTR3Q96KR7 559 aa29.04■■■□□ 2.24
CDIPT-210ENST00000570016 GNAT3A8MTJ3 354 aa29.03■■■□□ 2.24
CDIPT-210ENST00000570016 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
CDIPT-210ENST00000570016 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
CDIPT-210ENST00000570016 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP29.03■■■□□ 2.24
CDIPT-210ENST00000570016 IL17REQ8NFR9 667 aa29.02■■■□□ 2.24
CDIPT-210ENST00000570016 TJP1Q07157 1748 aa29.02■■■□□ 2.24
CDIPT-210ENST00000570016 PHF14O94880 888 aa29.01■■■□□ 2.23
CDIPT-210ENST00000570016 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
CDIPT-210ENST00000570016 RALBP1Q15311 655 aa29.01■■■□□ 2.23
CDIPT-210ENST00000570016 SMIM5Q71RC9 77 aa29.01■■■□□ 2.23
CDIPT-210ENST00000570016 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa29.01■■■□□ 2.23
CDIPT-210ENST00000570016 KCPQ6ZWJ8 1503 aa29■■■□□ 2.23
CDIPT-210ENST00000570016 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
CDIPT-210ENST00000570016 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
CDIPT-210ENST00000570016 RPS6KA4O75676 772 aa28.99■■■□□ 2.23
CDIPT-210ENST00000570016 ADRA2BP18089 450 aa28.99■■■□□ 2.23
CDIPT-210ENST00000570016 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
CDIPT-210ENST00000570016 MSL1Q68DK7 614 aa28.98■■■□□ 2.23
CDIPT-210ENST00000570016 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
CDIPT-210ENST00000570016 UBR2Q8IWV8 1755 aa28.98■■■□□ 2.23
CDIPT-210ENST00000570016 SLC39A6Q13433 755 aa28.96■■■□□ 2.23
CDIPT-210ENST00000570016 DCAF8L1A6NGE4 600 aa28.95■■■□□ 2.23
CDIPT-210ENST00000570016 TRAPPC3LQ5T215 181 aa28.95■■■□□ 2.23
CDIPT-210ENST00000570016 VSIG10Q8N0Z9 540 aa28.95■■■□□ 2.23
CDIPT-210ENST00000570016 CRKLP46109 303 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
CDIPT-210ENST00000570016 TEFQ10587 303 aa28.94■■■□□ 2.22
CDIPT-210ENST00000570016 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
CDIPT-210ENST00000570016 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
CDIPT-210ENST00000570016 DNAJC10Q8IXB1 793 aa28.92■■■□□ 2.22
CDIPT-210ENST00000570016 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
CDIPT-210ENST00000570016 PLEKHF1Q96S99 279 aa28.91■■■□□ 2.22
CDIPT-210ENST00000570016 C4AP0C0L4 1744 aa28.9■■■□□ 2.22
CDIPT-210ENST00000570016 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
CDIPT-210ENST00000570016 ZNF790Q6PG37 636 aa28.9■■■□□ 2.22
CDIPT-210ENST00000570016 CD2APQ9Y5K6 639 aa28.9■■■□□ 2.22
CDIPT-210ENST00000570016 UTRNP46939 3433 aa28.89■■■□□ 2.22
CDIPT-210ENST00000570016 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
CDIPT-210ENST00000570016 TTC5Q8N0Z6 440 aa28.87■■■□□ 2.21
CDIPT-210ENST00000570016 NLGN1Q8N2Q7 840 aa28.87■■■□□ 2.21
CDIPT-210ENST00000570016 NLGN2Q8NFZ4 835 aa28.87■■■□□ 2.21
CDIPT-210ENST00000570016 CCDC87Q9NVE4 849 aa28.87■■■□□ 2.21
CDIPT-210ENST00000570016 GYS1P13807 737 aa28.86■■■□□ 2.21
CDIPT-210ENST00000570016 RFC4P35249 363 aa28.86■■■□□ 2.21
CDIPT-210ENST00000570016 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
CDIPT-210ENST00000570016 KLHL34Q8N239 644 aa28.85■■■□□ 2.21
CDIPT-210ENST00000570016 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP28.85■■■□□ 2.21
CDIPT-210ENST00000570016 HEG1Q9ULI3 1381 aa28.85■■■□□ 2.21
CDIPT-210ENST00000570016 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
CDIPT-210ENST00000570016 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP28.83■■■□□ 2.21
CDIPT-210ENST00000570016 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP28.82■■■□□ 2.2
CDIPT-210ENST00000570016 NEFMP07197 916 aa28.82■■■□□ 2.2
CDIPT-210ENST00000570016 MCM10Q7L590 875 aa28.82■■■□□ 2.2
CDIPT-210ENST00000570016 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP28.81■■■□□ 2.2
CDIPT-210ENST00000570016 BTBD11A6QL63 1104 aa28.81■■■□□ 2.2
CDIPT-210ENST00000570016 MMP10P09238 476 aa28.81■■■□□ 2.2
CDIPT-210ENST00000570016 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP28.81■■■□□ 2.2
CDIPT-210ENST00000570016 FMNL2Q96PY5 1086 aa28.8■■■□□ 2.2
CDIPT-210ENST00000570016 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa28.8■■■□□ 2.2
CDIPT-210ENST00000570016 STARD3NLO95772 234 aa28.79■■■□□ 2.2
CDIPT-210ENST00000570016 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP28.79■■■□□ 2.2
CDIPT-210ENST00000570016 DLG5Q8TDM6 1919 aa28.79■■■□□ 2.2
CDIPT-210ENST00000570016 DCTN1Q14203 1278 aa28.78■■■□□ 2.2
CDIPT-210ENST00000570016 NFE2L2Q16236 605 aa28.78■■■□□ 2.2
CDIPT-210ENST00000570016 KIF13BQ9NQT8 1826 aa28.77■■■□□ 2.2
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