RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568829.1

SPNS1-211, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 5

Gene SPNS1, Length 780 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-211ENST00000568829 CD2APQ9Y5K6 639 aa22.47■■□□□ 1.19
SPNS1-211ENST00000568829 COL24A1Q17RW2 1714 aa22.47■■□□□ 1.19
SPNS1-211ENST00000568829 KDRP35968 1356 aa22.47■■□□□ 1.19
SPNS1-211ENST00000568829 GNPATO15228 680 aa22.46■■□□□ 1.19
SPNS1-211ENST00000568829 GRIN3BO60391 1043 aa22.46■■□□□ 1.19
SPNS1-211ENST00000568829 LINC00116Q8NCU8 138 aa22.46■■□□□ 1.19
SPNS1-211ENST00000568829 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
SPNS1-211ENST00000568829 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
SPNS1-211ENST00000568829 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
SPNS1-211ENST00000568829 AEBP1Q8IUX7 1158 aa22.45■■□□□ 1.18
SPNS1-211ENST00000568829 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
SPNS1-211ENST00000568829 TAF1LQ8IZX4 1826 aa22.45■■□□□ 1.18
SPNS1-211ENST00000568829 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
SPNS1-211ENST00000568829 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa22.44■■□□□ 1.18
SPNS1-211ENST00000568829 ADRA2BP18089 450 aa22.43■■□□□ 1.18
SPNS1-211ENST00000568829 AKAP4Q5JQC9 854 aa22.43■■□□□ 1.18
SPNS1-211ENST00000568829 TRAPPC3LQ5T215 181 aa22.43■■□□□ 1.18
SPNS1-211ENST00000568829 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
SPNS1-211ENST00000568829 ITPK1Q13572 414 aa22.42■■□□□ 1.18
SPNS1-211ENST00000568829 UTRNP46939 3433 aa22.41■■□□□ 1.18
SPNS1-211ENST00000568829 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa22.4■■□□□ 1.18
SPNS1-211ENST00000568829 NLGN2Q8NFZ4 835 aa22.4■■□□□ 1.18
SPNS1-211ENST00000568829 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
SPNS1-211ENST00000568829 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa22.38■■□□□ 1.17
SPNS1-211ENST00000568829 NLGN1Q8N2Q7 840 aa22.38■■□□□ 1.17
SPNS1-211ENST00000568829 HMOX1P09601 288 aa22.37■■□□□ 1.17
SPNS1-211ENST00000568829 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
SPNS1-211ENST00000568829 CFAP53Q96M91 514 aa22.37■■□□□ 1.17
SPNS1-211ENST00000568829 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
SPNS1-211ENST00000568829 RFC4P35249 363 aa22.36■■□□□ 1.17
SPNS1-211ENST00000568829 UBR3Q6ZT12 1888 aa22.36■■□□□ 1.17
SPNS1-211ENST00000568829 ZNF831Q5JPB2 1677 aa22.36■■□□□ 1.17
SPNS1-211ENST00000568829 RPS6KA4O75676 772 aa22.35■■□□□ 1.17
SPNS1-211ENST00000568829 SLC52A2Q9HAB3 445 aa22.35■■□□□ 1.17
SPNS1-211ENST00000568829 CHD4Q14839 1912 aa22.35■■□□□ 1.17
SPNS1-211ENST00000568829 AMIGO3Q86WK7 504 aa22.34■■□□□ 1.17
SPNS1-211ENST00000568829 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
SPNS1-211ENST00000568829 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
SPNS1-211ENST00000568829 SLC4A9Q96Q91 983 aa22.32■■□□□ 1.16
SPNS1-211ENST00000568829 RNMTO43148 476 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
SPNS1-211ENST00000568829 MMP10P09238 476 aa22.31■■□□□ 1.16
SPNS1-211ENST00000568829 GAS2L2Q8NHY3 880 aa22.31■■□□□ 1.16
SPNS1-211ENST00000568829 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
SPNS1-211ENST00000568829 NUDCQ9Y266 331 aa22.31■■□□□ 1.16
SPNS1-211ENST00000568829 SMIM5Q71RC9 77 aa22.3■■□□□ 1.16
SPNS1-211ENST00000568829 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP22.29■■□□□ 1.163e-6■□□□□ 8.1
SPNS1-211ENST00000568829 CRKLP46109 303 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
SPNS1-211ENST00000568829 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
SPNS1-211ENST00000568829 CCDC87Q9NVE4 849 aa22.29■■□□□ 1.16
SPNS1-211ENST00000568829 PARP3Q9Y6F1 533 aa22.29■■□□□ 1.16
SPNS1-211ENST00000568829 TGFB2P61812 414 aa22.27■■□□□ 1.16
SPNS1-211ENST00000568829 TTC5Q8N0Z6 440 aa22.27■■□□□ 1.16
SPNS1-211ENST00000568829 LGR6Q9HBX8 967 aa22.27■■□□□ 1.16
SPNS1-211ENST00000568829 TEFQ10587 303 aa22.26■■□□□ 1.15
SPNS1-211ENST00000568829 VSIG10Q8N0Z9 540 aa22.26■■□□□ 1.15
SPNS1-211ENST00000568829 SCN11AQ9UI33 1791 aa22.25■■□□□ 1.15
SPNS1-211ENST00000568829 GNAT3A8MTJ3 354 aa22.25■■□□□ 1.15
SPNS1-211ENST00000568829 GYS1P13807 737 aa22.25■■□□□ 1.15
SPNS1-211ENST00000568829 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
SPNS1-211ENST00000568829 ZPR1O75312 459 aa22.24■■□□□ 1.15
SPNS1-211ENST00000568829 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
SPNS1-211ENST00000568829 MRC1P22897 1456 aa22.23■■□□□ 1.15
SPNS1-211ENST00000568829 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
SPNS1-211ENST00000568829 STARD3NLO95772 234 aa22.21■■□□□ 1.15
SPNS1-211ENST00000568829 DNAJC10Q8IXB1 793 aa22.21■■□□□ 1.15
SPNS1-211ENST00000568829 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
SPNS1-211ENST00000568829 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
SPNS1-211ENST00000568829 SLC39A6Q13433 755 aa22.2■■□□□ 1.14
SPNS1-211ENST00000568829 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
SPNS1-211ENST00000568829 NEFMP07197 916 aa22.19■■□□□ 1.14
SPNS1-211ENST00000568829 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
SPNS1-211ENST00000568829 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
SPNS1-211ENST00000568829 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
SPNS1-211ENST00000568829 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
SPNS1-211ENST00000568829 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
SPNS1-211ENST00000568829 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SPNS1-211ENST00000568829 PPP2R1AP30153 589 aa22.17■■□□□ 1.14
SPNS1-211ENST00000568829 PRKAR2BP31323 418 aa22.17■■□□□ 1.14
SPNS1-211ENST00000568829 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP22.17■■□□□ 1.14
SPNS1-211ENST00000568829 C10orf71Q711Q0 1435 aa22.16■■□□□ 1.14
SPNS1-211ENST00000568829 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
SPNS1-211ENST00000568829 A0A087WZG4 1122 aa22.16■■□□□ 1.14
SPNS1-211ENST00000568829 FCHSD2O94868 740 aa22.16■■□□□ 1.14
SPNS1-211ENST00000568829 C1QTNF8P60827 252 aa22.16■■□□□ 1.14
SPNS1-211ENST00000568829 ZNF790Q6PG37 636 aa22.15■■□□□ 1.14
SPNS1-211ENST00000568829 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
SPNS1-211ENST00000568829 NARFQ9UHQ1 456 aa22.15■■□□□ 1.14
SPNS1-211ENST00000568829 BCS1LQ9Y276 419 aa22.15■■□□□ 1.14
SPNS1-211ENST00000568829 FKBP8Q14318 412 aa22.14■■□□□ 1.13
SPNS1-211ENST00000568829 IL17REQ8NFR9 667 aa22.14■■□□□ 1.13
SPNS1-211ENST00000568829 FMNL2Q96PY5 1086 aa22.14■■□□□ 1.13
SPNS1-211ENST00000568829 RSPH6AQ9H0K4 717 aa22.14■■□□□ 1.13
SPNS1-211ENST00000568829 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
SPNS1-211ENST00000568829 C4AP0C0L4 1744 aa22.14■■□□□ 1.13
SPNS1-211ENST00000568829 TJP1Q07157 1748 aa22.14■■□□□ 1.13
SPNS1-211ENST00000568829 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
SPNS1-211ENST00000568829 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa22.14■■□□□ 1.13
SPNS1-211ENST00000568829 COL15A1P39059 1388 aa22.13■■□□□ 1.13
SPNS1-211ENST00000568829 A0A0G2JLW4 131 aa22.13■■□□□ 1.13
SPNS1-211ENST00000568829 WWC3Q9ULE0 1092 aa22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.6 ms