RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568043.5

INO80E-212, Transcript of INO80 complex subunit E, humanhuman

TSL 2

Gene INO80E, Length 482 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80E-212ENST00000568043 TMOD3Q9NYL9 352 aa25.38■■□□□ 1.65
INO80E-212ENST00000568043 PXDNLA1KZ92 1463 aa25.38■■□□□ 1.65
INO80E-212ENST00000568043 WASHC2AQ641Q2 1341 aa25.37■■□□□ 1.65
INO80E-212ENST00000568043 MMP10P09238 476 aa25.37■■□□□ 1.65
INO80E-212ENST00000568043 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP25.37■■□□□ 1.65
INO80E-212ENST00000568043 PHKG2P15735 406 aa25.36■■□□□ 1.65
INO80E-212ENST00000568043 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
INO80E-212ENST00000568043 SLC4A9Q96Q91 983 aa25.35■■□□□ 1.65
INO80E-212ENST00000568043 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
INO80E-212ENST00000568043 KDRP35968 1356 aa25.33■■□□□ 1.65
INO80E-212ENST00000568043 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
INO80E-212ENST00000568043 IFNL2Q8IZJ0 200 aa25.33■■□□□ 1.65
INO80E-212ENST00000568043 CDCA8Q53HL2 280 aa25.32■■□□□ 1.64
INO80E-212ENST00000568043 POLKQ9UBT6 870 aa25.32■■□□□ 1.64
INO80E-212ENST00000568043 A0A0G2JLW4 131 aa25.31■■□□□ 1.64
INO80E-212ENST00000568043 ZNF831Q5JPB2 1677 aa25.31■■□□□ 1.64
INO80E-212ENST00000568043 C10orf71Q711Q0 1435 aa25.3■■□□□ 1.64
INO80E-212ENST00000568043 TGFB2P61812 414 aa25.29■■□□□ 1.64
INO80E-212ENST00000568043 BCS1LQ9Y276 419 aa25.29■■□□□ 1.64
INO80E-212ENST00000568043 C4AP0C0L4 1744 aa25.29■■□□□ 1.64
INO80E-212ENST00000568043 TRAPPC3LQ5T215 181 aa25.28■■□□□ 1.64
INO80E-212ENST00000568043 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa25.28■■□□□ 1.64
INO80E-212ENST00000568043 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
INO80E-212ENST00000568043 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
INO80E-212ENST00000568043 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
INO80E-212ENST00000568043 DPEP1P16444 411 aa25.26■■□□□ 1.63
INO80E-212ENST00000568043 NLGN1Q8N2Q7 840 aa25.26■■□□□ 1.63
INO80E-212ENST00000568043 TOMM70O94826 608 aa25.25■■□□□ 1.63
INO80E-212ENST00000568043 GYS1P13807 737 aa25.25■■□□□ 1.63
INO80E-212ENST00000568043 NMRK2Q9NPI5 230 aa25.25■■□□□ 1.63
INO80E-212ENST00000568043 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa25.25■■□□□ 1.63
INO80E-212ENST00000568043 KCNA3P22001 575 aa25.24■■□□□ 1.63
INO80E-212ENST00000568043 APLP1P51693 650 aa25.24■■□□□ 1.63
INO80E-212ENST00000568043 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
INO80E-212ENST00000568043 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
INO80E-212ENST00000568043 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa25.23■■□□□ 1.63
INO80E-212ENST00000568043 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
INO80E-212ENST00000568043 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa25.21■■□□□ 1.63
INO80E-212ENST00000568043 ERVV-2B6SEH9 535 aa25.21■■□□□ 1.63
INO80E-212ENST00000568043 RPS6KA4O75676 772 aa25.21■■□□□ 1.63
INO80E-212ENST00000568043 FCHSD2O94868 740 aa25.2■■□□□ 1.62
INO80E-212ENST00000568043 ADRA2BP18089 450 aa25.2■■□□□ 1.62
INO80E-212ENST00000568043 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
INO80E-212ENST00000568043 CCDC87Q9NVE4 849 aa25.2■■□□□ 1.62
INO80E-212ENST00000568043 WDR90Q96KV7 1748 aa25.2■■□□□ 1.62
INO80E-212ENST00000568043 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa25.18■■□□□ 1.62
INO80E-212ENST00000568043 SBF1O95248 1867 aa25.18■■□□□ 1.62
INO80E-212ENST00000568043 RFC4P35249 363 aa25.18■■□□□ 1.62
INO80E-212ENST00000568043 DCAF5Q96JK2 942 aa25.18■■□□□ 1.62
INO80E-212ENST00000568043 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa25.18■■□□□ 1.62
INO80E-212ENST00000568043 PARP3Q9Y6F1 533 aa25.17■■□□□ 1.62
INO80E-212ENST00000568043 C9orf131Q5VYM1 1079 aa25.16■■□□□ 1.62
INO80E-212ENST00000568043 CLSPNQ9HAW4 1339 aa25.15■■□□□ 1.62
INO80E-212ENST00000568043 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
INO80E-212ENST00000568043 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa25.15■■□□□ 1.62
INO80E-212ENST00000568043 TJP1Q07157 1748 aa25.15■■□□□ 1.62
INO80E-212ENST00000568043 HTRA3P83110 453 aa25.14■■□□□ 1.62
INO80E-212ENST00000568043 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
INO80E-212ENST00000568043 CABP4P57796 275 aa25.13■■□□□ 1.61
INO80E-212ENST00000568043 DDR1Q08345 913 aa25.13■■□□□ 1.61
INO80E-212ENST00000568043 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
INO80E-212ENST00000568043 CRKLP46109 303 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
INO80E-212ENST00000568043 FKBP8Q14318 412 aa25.12■■□□□ 1.61
INO80E-212ENST00000568043 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
INO80E-212ENST00000568043 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
INO80E-212ENST00000568043 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
INO80E-212ENST00000568043 KCPQ6ZWJ8 1503 aa25.12■■□□□ 1.61
INO80E-212ENST00000568043 AEBP1Q8IUX7 1158 aa25.11■■□□□ 1.61
INO80E-212ENST00000568043 PIM2Q9P1W9 311 aa25.11■■□□□ 1.61
INO80E-212ENST00000568043 PCNTO95613 3336 aa25.1■■□□□ 1.61
INO80E-212ENST00000568043 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
INO80E-212ENST00000568043 SCN11AQ9UI33 1791 aa25.09■■□□□ 1.61
INO80E-212ENST00000568043 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa25.09■■□□□ 1.61
INO80E-212ENST00000568043 CHRNA5P30532 468 aa25.08■■□□□ 1.61
INO80E-212ENST00000568043 MTHFSP49914 203 aa25.08■■□□□ 1.61
INO80E-212ENST00000568043 POLR3GLQ9BT43 218 aa25.08■■□□□ 1.61
INO80E-212ENST00000568043 AMOTQ4VCS5 1084 aa25.07■■□□□ 1.6
INO80E-212ENST00000568043 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
INO80E-212ENST00000568043 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
INO80E-212ENST00000568043 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
INO80E-212ENST00000568043 TM4SF1P30408 202 aa25.05■■□□□ 1.6
INO80E-212ENST00000568043 KLRG1Q96E93 195 aa25.05■■□□□ 1.6
INO80E-212ENST00000568043 RRAGCQ9HB90 399 aa25.05■■□□□ 1.6
INO80E-212ENST00000568043 RNF181Q9P0P0 153 aa25.05■■□□□ 1.6
INO80E-212ENST00000568043 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
INO80E-212ENST00000568043 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
INO80E-212ENST00000568043 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
INO80E-212ENST00000568043 FSTL1Q12841 308 aa25.03■■□□□ 1.6
INO80E-212ENST00000568043 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
INO80E-212ENST00000568043 JMYQ8N9B5 988 aa25.03■■□□□ 1.6
INO80E-212ENST00000568043 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa25.02■■□□□ 1.6
INO80E-212ENST00000568043 C1orf141Q5JVX7 400 aa25.02■■□□□ 1.6
INO80E-212ENST00000568043 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
INO80E-212ENST00000568043 PANK3Q9H999 370 aa25.02■■□□□ 1.6
INO80E-212ENST00000568043 KDM2BQ8NHM5 1336 aa25.01■■□□□ 1.59
INO80E-212ENST00000568043 PRELPP51888 382 aa25■■□□□ 1.59
INO80E-212ENST00000568043 SULT6B1Q6IMI4 303 aa25■■□□□ 1.59
INO80E-212ENST00000568043 DNAJC10Q8IXB1 793 aa25■■□□□ 1.59
INO80E-212ENST00000568043 NRXN2Q9P2S2 1712 aa25■■□□□ 1.59
INO80E-212ENST00000568043 DLEC1Q9Y238 1755 aa24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.8 ms