RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567828.1

PPP4C-212, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 3

Gene PPP4C, Length 742 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-212ENST00000567828 ATG3Q9NT62 314 aa30.87■■■□□ 2.53
PPP4C-212ENST00000567828 ZNF831Q5JPB2 1677 aa30.87■■■□□ 2.53
PPP4C-212ENST00000567828 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP30.86■■■□□ 2.53
PPP4C-212ENST00000567828 AMIGO3Q86WK7 504 aa30.86■■■□□ 2.53
PPP4C-212ENST00000567828 LINC00116Q8NCU8 138 aa30.86■■■□□ 2.53
PPP4C-212ENST00000567828 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP30.86■■■□□ 2.53
PPP4C-212ENST00000567828 ERVV-2B6SEH9 535 aa30.85■■■□□ 2.53
PPP4C-212ENST00000567828 ITPK1Q13572 414 aa30.84■■■□□ 2.53
PPP4C-212ENST00000567828 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP30.84■■■□□ 2.53
PPP4C-212ENST00000567828 SMIM5Q71RC9 77 aa30.84■■■□□ 2.53
PPP4C-212ENST00000567828 FLAD1Q8NFF5 587 aa30.84■■■□□ 2.53
PPP4C-212ENST00000567828 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP30.84■■■□□ 2.53
PPP4C-212ENST00000567828 PHF14O94880 888 aa30.82■■■□□ 2.52
PPP4C-212ENST00000567828 ATP6V1AP38606 617 aa30.82■■■□□ 2.52
PPP4C-212ENST00000567828 C1orf141Q5JVX7 400 aa30.82■■■□□ 2.52
PPP4C-212ENST00000567828 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa30.8■■■□□ 2.52
PPP4C-212ENST00000567828 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP30.78■■■□□ 2.52
PPP4C-212ENST00000567828 HMOX1P09601 288 aa30.78■■■□□ 2.52
PPP4C-212ENST00000567828 CABP4P57796 275 aa30.78■■■□□ 2.52
PPP4C-212ENST00000567828 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP30.77■■■□□ 2.52
PPP4C-212ENST00000567828 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP30.77■■■□□ 2.52
PPP4C-212ENST00000567828 NLGN2Q8NFZ4 835 aa30.77■■■□□ 2.52
PPP4C-212ENST00000567828 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP30.77■■■□□ 2.52
PPP4C-212ENST00000567828 SSFA2P28290 1259 aa30.76■■■□□ 2.51
PPP4C-212ENST00000567828 SLC4A9Q96Q91 983 aa30.76■■■□□ 2.51
PPP4C-212ENST00000567828 GNPATO15228 680 aa30.75■■■□□ 2.51
PPP4C-212ENST00000567828 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP30.75■■■□□ 2.51
PPP4C-212ENST00000567828 TJP1Q07157 1748 aa30.73■■■□□ 2.51
PPP4C-212ENST00000567828 C4AP0C0L4 1744 aa30.72■■■□□ 2.51
PPP4C-212ENST00000567828 GPR162Q16538 588 aa30.71■■■□□ 2.51
PPP4C-212ENST00000567828 AKAP4Q5JQC9 854 aa30.71■■■□□ 2.51
PPP4C-212ENST00000567828 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa30.71■■■□□ 2.51
PPP4C-212ENST00000567828 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa30.71■■■□□ 2.51
PPP4C-212ENST00000567828 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP30.7■■■□□ 2.51
PPP4C-212ENST00000567828 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP30.7■■■□□ 2.51
PPP4C-212ENST00000567828 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP30.68■■■□□ 2.5
PPP4C-212ENST00000567828 MRC1P22897 1456 aa30.68■■■□□ 2.5
PPP4C-212ENST00000567828 LGR6Q9HBX8 967 aa30.66■■■□□ 2.5
PPP4C-212ENST00000567828 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP30.65■■■□□ 2.5
PPP4C-212ENST00000567828 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP30.64■■■□□ 2.5
PPP4C-212ENST00000567828 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP30.64■■■□□ 2.5
PPP4C-212ENST00000567828 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa30.64■■■□□ 2.5
PPP4C-212ENST00000567828 SLC52A2Q9HAB3 445 aa30.63■■■□□ 2.49
PPP4C-212ENST00000567828 RNMTO43148 476 aaKnown RBP30.62■■■□□ 2.49
PPP4C-212ENST00000567828 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP30.62■■■□□ 2.49
PPP4C-212ENST00000567828 CD2APQ9Y5K6 639 aa30.62■■■□□ 2.49
PPP4C-212ENST00000567828 TRAPPC3LQ5T215 181 aa30.6■■■□□ 2.49
PPP4C-212ENST00000567828 UBR2Q8IWV8 1755 aa30.6■■■□□ 2.49
PPP4C-212ENST00000567828 KIF13BQ9NQT8 1826 aa30.59■■■□□ 2.49
PPP4C-212ENST00000567828 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP30.59■■■□□ 2.49
PPP4C-212ENST00000567828 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP30.59■■■□□ 2.494e-9■□□□□ 8.2
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PPP4C-212ENST00000567828 CRKLP46109 303 aaKnown RBP30.57■■■□□ 2.48
PPP4C-212ENST00000567828 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP30.57■■■□□ 2.48
PPP4C-212ENST00000567828 KCPQ6ZWJ8 1503 aa30.57■■■□□ 2.48
PPP4C-212ENST00000567828 ADRA2BP18089 450 aa30.56■■■□□ 2.48
PPP4C-212ENST00000567828 SLC39A6Q13433 755 aa30.55■■■□□ 2.48
PPP4C-212ENST00000567828 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP30.55■■■□□ 2.48
PPP4C-212ENST00000567828 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP30.55■■■□□ 2.48
PPP4C-212ENST00000567828 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa30.55■■■□□ 2.48
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PPP4C-212ENST00000567828 CFAP53Q96M91 514 aa30.54■■■□□ 2.48
PPP4C-212ENST00000567828 RFC4P35249 363 aa30.53■■■□□ 2.48
PPP4C-212ENST00000567828 PPP2R1AP30153 589 aa30.52■■■□□ 2.48
PPP4C-212ENST00000567828 DNAJC10Q8IXB1 793 aa30.51■■■□□ 2.47
PPP4C-212ENST00000567828 GYS1P13807 737 aa30.5■■■□□ 2.47
PPP4C-212ENST00000567828 NLGN1Q8N2Q7 840 aa30.5■■■□□ 2.47
PPP4C-212ENST00000567828 GRIN3BO60391 1043 aa30.49■■■□□ 2.47
PPP4C-212ENST00000567828 GAS2L2Q8NHY3 880 aa30.49■■■□□ 2.47
PPP4C-212ENST00000567828 WWC3Q9ULE0 1092 aa30.48■■■□□ 2.47
PPP4C-212ENST00000567828 PRKAR2BP31323 418 aa30.47■■■□□ 2.47
PPP4C-212ENST00000567828 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP30.47■■■□□ 2.47
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PPP4C-212ENST00000567828 GNAT3A8MTJ3 354 aa30.46■■■□□ 2.47
PPP4C-212ENST00000567828 CCDC87Q9NVE4 849 aa30.46■■■□□ 2.47
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PPP4C-212ENST00000567828 IL17REQ8NFR9 667 aa30.44■■■□□ 2.46
PPP4C-212ENST00000567828 NUDCQ9Y266 331 aa30.44■■■□□ 2.46
PPP4C-212ENST00000567828 C10orf71Q711Q0 1435 aa30.44■■■□□ 2.46
PPP4C-212ENST00000567828 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP30.44■■■□□ 2.46
PPP4C-212ENST00000567828 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP30.43■■■□□ 2.46
PPP4C-212ENST00000567828 PXDNLA1KZ92 1463 aa30.43■■■□□ 2.46
PPP4C-212ENST00000567828 TEFQ10587 303 aa30.42■■■□□ 2.46
PPP4C-212ENST00000567828 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP30.41■■■□□ 2.46
PPP4C-212ENST00000567828 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP30.41■■■□□ 2.46
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PPP4C-212ENST00000567828 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP30.41■■■□□ 2.46
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PPP4C-212ENST00000567828 TTC5Q8N0Z6 440 aa30.4■■■□□ 2.46
PPP4C-212ENST00000567828 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP30.4■■■□□ 2.46
PPP4C-212ENST00000567828 FKBP8Q14318 412 aa30.39■■■□□ 2.46
PPP4C-212ENST00000567828 VSIG10Q8N0Z9 540 aa30.39■■■□□ 2.46
PPP4C-212ENST00000567828 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa30.39■■■□□ 2.46
PPP4C-212ENST00000567828 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa30.38■■■□□ 2.45
PPP4C-212ENST00000567828 COL15A1P39059 1388 aa30.37■■■□□ 2.45
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PPP4C-212ENST00000567828 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP30.35■■■□□ 2.45
PPP4C-212ENST00000567828 ZPR1O75312 459 aa30.34■■■□□ 2.45
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