RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557413.5

RPS6KL1-216, Transcript of ribosomal protein S6 kinase like 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene RPS6KL1, Length 2,425 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KL1-216ENST00000557413 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
RPS6KL1-216ENST00000557413 SALL3Q9BXA9 1300 aa25.18■■□□□ 1.62
RPS6KL1-216ENST00000557413 NUTM2FA1L443 756 aa25.17■■□□□ 1.62
RPS6KL1-216ENST00000557413 LRRCC1Q9C099 1032 aa25.17■■□□□ 1.62
RPS6KL1-216ENST00000557413 TSPOAP1O95153 1857 aa25.17■■□□□ 1.62
RPS6KL1-216ENST00000557413 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa25.17■■□□□ 1.62
RPS6KL1-216ENST00000557413 LRSAM1Q6UWE0 723 aa25.17■■□□□ 1.62
RPS6KL1-216ENST00000557413 ARHGEF10O15013 1369 aa25.17■■□□□ 1.62
RPS6KL1-216ENST00000557413 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
RPS6KL1-216ENST00000557413 USP6P35125 1406 aa25.16■■□□□ 1.62
RPS6KL1-216ENST00000557413 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
RPS6KL1-216ENST00000557413 SYCE3A1L190 88 aa25.16■■□□□ 1.62
RPS6KL1-216ENST00000557413 MX1P20591 662 aa25.16■■□□□ 1.62
RPS6KL1-216ENST00000557413 MCCP23508 829 aa25.16■■□□□ 1.62
RPS6KL1-216ENST00000557413 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa25.16■■□□□ 1.62
RPS6KL1-216ENST00000557413 STK31Q9BXU1 1019 aa25.15■■□□□ 1.62
RPS6KL1-216ENST00000557413 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
RPS6KL1-216ENST00000557413 USP31Q70CQ4 1352 aa25.15■■□□□ 1.62
RPS6KL1-216ENST00000557413 PLEKHG3A1L390 1219 aa25.15■■□□□ 1.62
RPS6KL1-216ENST00000557413 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
RPS6KL1-216ENST00000557413 BRD1O95696 1058 aa25.14■■□□□ 1.61
RPS6KL1-216ENST00000557413 MBD3O95983 291 aa25.14■■□□□ 1.61
RPS6KL1-216ENST00000557413 PALD1Q9ULE6 856 aa25.14■■□□□ 1.61
RPS6KL1-216ENST00000557413 CUL4AQ13619 759 aa25.13■■□□□ 1.61
RPS6KL1-216ENST00000557413 ANO2Q9NQ90 1003 aa25.13■■□□□ 1.61
RPS6KL1-216ENST00000557413 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
RPS6KL1-216ENST00000557413 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa25.13■■□□□ 1.61
RPS6KL1-216ENST00000557413 RILPL2Q969X0 211 aa25.13■■□□□ 1.61
RPS6KL1-216ENST00000557413 FMN2Q9NZ56 1722 aa25.12■■□□□ 1.61
RPS6KL1-216ENST00000557413 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa25.12■■□□□ 1.61
RPS6KL1-216ENST00000557413 GNAI3P08754 354 aa25.12■■□□□ 1.61
RPS6KL1-216ENST00000557413 CHMLP26374 656 aa25.12■■□□□ 1.61
RPS6KL1-216ENST00000557413 ANAPC15P60006 121 aa25.12■■□□□ 1.61
RPS6KL1-216ENST00000557413 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
RPS6KL1-216ENST00000557413 FLIIQ13045 1269 aa25.11■■□□□ 1.61
RPS6KL1-216ENST00000557413 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
RPS6KL1-216ENST00000557413 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
RPS6KL1-216ENST00000557413 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
RPS6KL1-216ENST00000557413 ATP8B2P98198 1209 aa25.1■■□□□ 1.61
RPS6KL1-216ENST00000557413 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
RPS6KL1-216ENST00000557413 DIP2BQ9P265 1576 aa25.09■■□□□ 1.61
RPS6KL1-216ENST00000557413 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
RPS6KL1-216ENST00000557413 KDRP35968 1356 aa25.09■■□□□ 1.61
RPS6KL1-216ENST00000557413 SSH2Q76I76 1423 aa25.08■■□□□ 1.61
RPS6KL1-216ENST00000557413 FLT4P35916 1363 aa25.08■■□□□ 1.61
RPS6KL1-216ENST00000557413 CCDC30Q5VVM6 783 aa25.07■■□□□ 1.6
RPS6KL1-216ENST00000557413 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa25.07■■□□□ 1.6
RPS6KL1-216ENST00000557413 STAP2Q9UGK3 403 aa25.07■■□□□ 1.6
RPS6KL1-216ENST00000557413 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
RPS6KL1-216ENST00000557413 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
RPS6KL1-216ENST00000557413 SBNO1A3KN83 1393 aa25.06■■□□□ 1.6
RPS6KL1-216ENST00000557413 TMEM2Q9UHN6 1383 aa25.06■■□□□ 1.6
RPS6KL1-216ENST00000557413 TERF1P54274 439 aa25.06■■□□□ 1.6
RPS6KL1-216ENST00000557413 NECTIN2Q92692 538 aa25.06■■□□□ 1.6
RPS6KL1-216ENST00000557413 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa25.06■■□□□ 1.6
RPS6KL1-216ENST00000557413 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa25.06■■□□□ 1.6
RPS6KL1-216ENST00000557413 EYA1Q99502 592 aa25.05■■□□□ 1.6
RPS6KL1-216ENST00000557413 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
RPS6KL1-216ENST00000557413 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
RPS6KL1-216ENST00000557413 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
RPS6KL1-216ENST00000557413 UNC5CLQ8IV45 518 aa25.05■■□□□ 1.6
RPS6KL1-216ENST00000557413 RNF214Q8ND24 703 aa25.04■■□□□ 1.6
RPS6KL1-216ENST00000557413 IGSF1Q8N6C5 1336 aa25.04■■□□□ 1.6
RPS6KL1-216ENST00000557413 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
RPS6KL1-216ENST00000557413 IL17RAQ96F46 866 aa25.04■■□□□ 1.6
RPS6KL1-216ENST00000557413 AMPHP49418 695 aa25.03■■□□□ 1.6
RPS6KL1-216ENST00000557413 CACNA1FO60840 1977 aa25.03■■□□□ 1.6
RPS6KL1-216ENST00000557413 TTC21AQ8NDW8 1320 aa25.03■■□□□ 1.6
RPS6KL1-216ENST00000557413 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
RPS6KL1-216ENST00000557413 CCDC39Q9UFE4 941 aa25.03■■□□□ 1.6
RPS6KL1-216ENST00000557413 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
RPS6KL1-216ENST00000557413 TNRQ92752 1358 aa25.03■■□□□ 1.6
RPS6KL1-216ENST00000557413 MCM5P33992 734 aa25.02■■□□□ 1.6
RPS6KL1-216ENST00000557413 UBR1Q8IWV7 1749 aa25.02■■□□□ 1.6
RPS6KL1-216ENST00000557413 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
RPS6KL1-216ENST00000557413 LRRC37A3O60309 1634 aa25.01■■□□□ 1.59
RPS6KL1-216ENST00000557413 TSPY26PQ9H489 355 aa25.01■■□□□ 1.59
RPS6KL1-216ENST00000557413 AOX1Q06278 1338 aa25.01■■□□□ 1.59
RPS6KL1-216ENST00000557413 PDCL3Q9H2J4 239 aa25.01■■□□□ 1.59
RPS6KL1-216ENST00000557413 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
RPS6KL1-216ENST00000557413 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
RPS6KL1-216ENST00000557413 GNAT3A8MTJ3 354 aa25■■□□□ 1.59
RPS6KL1-216ENST00000557413 USP44Q9H0E7 712 aa25■■□□□ 1.59
RPS6KL1-216ENST00000557413 IL25Q9H293 177 aa25■■□□□ 1.59
RPS6KL1-216ENST00000557413 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa25■■□□□ 1.59
RPS6KL1-216ENST00000557413 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
RPS6KL1-216ENST00000557413 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
RPS6KL1-216ENST00000557413 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
RPS6KL1-216ENST00000557413 VSIG10Q8N0Z9 540 aa24.98■■□□□ 1.59
RPS6KL1-216ENST00000557413 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
RPS6KL1-216ENST00000557413 HSPA4P34932 840 aa24.98■■□□□ 1.59
RPS6KL1-216ENST00000557413 GDPD2Q9HCC8 539 aa24.98■■□□□ 1.59
RPS6KL1-216ENST00000557413 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
RPS6KL1-216ENST00000557413 PXDNLA1KZ92 1463 aa24.97■■□□□ 1.59
RPS6KL1-216ENST00000557413 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa24.97■■□□□ 1.59
RPS6KL1-216ENST00000557413 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
RPS6KL1-216ENST00000557413 PHF14O94880 888 aa24.96■■□□□ 1.59
RPS6KL1-216ENST00000557413 NUTM1Q86Y26 1132 aa24.96■■□□□ 1.59
RPS6KL1-216ENST00000557413 TCHHQ07283 1943 aa24.96■■□□□ 1.59
RPS6KL1-216ENST00000557413 USP48Q86UV5 1035 aa24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms