RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545464.5

MACROD1-208, Transcript of MACRO domain containing 1, human

TSL 3

Gene MACROD1, Length 899 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MACROD1-208	ENST00000545464	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	33.86	■■■■□ 3.01
MACROD1-208	ENST00000545464	IFFO2	Q5TF58	517 aa		33.86	■■■■□ 3.01
MACROD1-208	ENST00000545464	HSPA6	P17066	643 aa		33.85	■■■■□ 3.01
MACROD1-208	ENST00000545464	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	33.85	■■■■□ 3.01
MACROD1-208	ENST00000545464	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		33.84	■■■■□ 3.01
MACROD1-208	ENST00000545464	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		33.83	■■■■□ 3.01
MACROD1-208	ENST00000545464	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	33.83	■■■■□ 3.01
MACROD1-208	ENST00000545464	BCS1L	Q9Y276	419 aa		33.79	■■■■□ 3
MACROD1-208	ENST00000545464		A0A0G2JLW4	131 aa		33.78	■■■■□ 3
MACROD1-208	ENST00000545464	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		33.78	■■■■□ 3
MACROD1-208	ENST00000545464	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	33.77	■■■■□ 3
MACROD1-208	ENST00000545464	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		33.77	■■■■□ 3
MACROD1-208	ENST00000545464	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	33.76	■■■□□ 2.99
MACROD1-208	ENST00000545464	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		33.75	■■■□□ 2.99
MACROD1-208	ENST00000545464	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		33.75	■■■□□ 2.99
MACROD1-208	ENST00000545464	KIF3C	O14782	793 aa		33.74	■■■□□ 2.99
MACROD1-208	ENST00000545464	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	33.74	■■■□□ 2.99
MACROD1-208	ENST00000545464	RFC4	P35249	363 aa		33.74	■■■□□ 2.99
MACROD1-208	ENST00000545464	TGFB2	P61812	414 aa		33.74	■■■□□ 2.99
MACROD1-208	ENST00000545464	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	33.74	■■■□□ 2.99
MACROD1-208	ENST00000545464	DCAF5	Q96JK2	942 aa		33.74	■■■□□ 2.99
MACROD1-208	ENST00000545464	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	33.74	■■■□□ 2.99
MACROD1-208	ENST00000545464	KDR	P35968	1356 aa		33.73	■■■□□ 2.99
MACROD1-208	ENST00000545464	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		33.73	■■■□□ 2.99
MACROD1-208	ENST00000545464	CABP4	P57796	275 aa		33.72	■■■□□ 2.99
MACROD1-208	ENST00000545464	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	33.72	■■■□□ 2.99
MACROD1-208	ENST00000545464	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		33.71	■■■□□ 2.99
MACROD1-208	ENST00000545464	ADRA2B	P18089	450 aa		33.7	■■■□□ 2.99
MACROD1-208	ENST00000545464	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	33.7	■■■□□ 2.99
MACROD1-208	ENST00000545464	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		33.7	■■■□□ 2.99
MACROD1-208	ENST00000545464	DPEP1	P16444	411 aa		33.69	■■■□□ 2.98
MACROD1-208	ENST00000545464	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	33.69	■■■□□ 2.98
MACROD1-208	ENST00000545464	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	33.68	■■■□□ 2.98
MACROD1-208	ENST00000545464	RPS6KA4	O75676	772 aa		33.68	■■■□□ 2.98
MACROD1-208	ENST00000545464	FCHSD2	O94868	740 aa		33.68	■■■□□ 2.98
MACROD1-208	ENST00000545464	GYS1	P13807	737 aa		33.68	■■■□□ 2.98
MACROD1-208	ENST00000545464	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		33.67	■■■□□ 2.98
MACROD1-208	ENST00000545464	MTHFS	P49914	203 aa		33.66	■■■□□ 2.98
MACROD1-208	ENST00000545464	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		33.66	■■■□□ 2.98
MACROD1-208	ENST00000545464	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		33.66	■■■□□ 2.98
MACROD1-208	ENST00000545464	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		33.65	■■■□□ 2.98
MACROD1-208	ENST00000545464	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		33.65	■■■□□ 2.98
MACROD1-208	ENST00000545464	PANK3	Q9H999	370 aa		33.65	■■■□□ 2.98
MACROD1-208	ENST00000545464	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		33.64	■■■□□ 2.98
MACROD1-208	ENST00000545464	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	33.63	■■■□□ 2.97
MACROD1-208	ENST00000545464	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		33.63	■■■□□ 2.97
MACROD1-208	ENST00000545464	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		33.62	■■■□□ 2.97
MACROD1-208	ENST00000545464	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		33.62	■■■□□ 2.97
MACROD1-208	ENST00000545464	C4A	P0C0L4	1744 aa		33.6	■■■□□ 2.97
MACROD1-208	ENST00000545464	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		33.6	■■■□□ 2.97
MACROD1-208	ENST00000545464	TOMM70	O94826	608 aa		33.59	■■■□□ 2.97
MACROD1-208	ENST00000545464	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	33.59	■■■□□ 2.97
MACROD1-208	ENST00000545464	MORC1	Q86VD1	984 aa		33.59	■■■□□ 2.97
MACROD1-208	ENST00000545464	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		33.59	■■■□□ 2.97
MACROD1-208	ENST00000545464	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	33.59	■■■□□ 2.97
MACROD1-208	ENST00000545464	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		33.58	■■■□□ 2.97
MACROD1-208	ENST00000545464	APLP1	P51693	650 aa		33.58	■■■□□ 2.97
MACROD1-208	ENST00000545464	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		33.58	■■■□□ 2.97
MACROD1-208	ENST00000545464	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	33.58	■■■□□ 2.97
MACROD1-208	ENST00000545464	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		33.56	■■■□□ 2.96
MACROD1-208	ENST00000545464	KCNA3	P22001	575 aa		33.55	■■■□□ 2.96
MACROD1-208	ENST00000545464	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	33.55	■■■□□ 2.96	9e-7	■■■■■ 36.1
MACROD1-208	ENST00000545464	FKBP8	Q14318	412 aa		33.55	■■■□□ 2.96
MACROD1-208	ENST00000545464	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		33.55	■■■□□ 2.96
MACROD1-208	ENST00000545464	PIM2	Q9P1W9	311 aa		33.55	■■■□□ 2.96
MACROD1-208	ENST00000545464	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	33.54	■■■□□ 2.96
MACROD1-208	ENST00000545464	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	33.52	■■■□□ 2.96
MACROD1-208	ENST00000545464	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	33.51	■■■□□ 2.95
MACROD1-208	ENST00000545464	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	33.51	■■■□□ 2.95
MACROD1-208	ENST00000545464	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	33.51	■■■□□ 2.95
MACROD1-208	ENST00000545464	DDR1	Q08345	913 aa		33.5	■■■□□ 2.95
MACROD1-208	ENST00000545464	CHRNA5	P30532	468 aa		33.48	■■■□□ 2.95
MACROD1-208	ENST00000545464	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	33.46	■■■□□ 2.95
MACROD1-208	ENST00000545464	RNF181	Q9P0P0	153 aa		33.46	■■■□□ 2.95
MACROD1-208	ENST00000545464	ZPR1	O75312	459 aa		33.45	■■■□□ 2.95
MACROD1-208	ENST00000545464	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	33.44	■■■□□ 2.94
MACROD1-208	ENST00000545464	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		33.44	■■■□□ 2.94
MACROD1-208	ENST00000545464	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		33.44	■■■□□ 2.94
MACROD1-208	ENST00000545464	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		33.44	■■■□□ 2.94
MACROD1-208	ENST00000545464	IL13	P35225	146 aa		33.43	■■■□□ 2.94
MACROD1-208	ENST00000545464	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		33.43	■■■□□ 2.94
MACROD1-208	ENST00000545464	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	33.42	■■■□□ 2.94
MACROD1-208	ENST00000545464	RBM46	Q8TBY0	533 aa	Known RBP	33.42	■■■□□ 2.94
MACROD1-208	ENST00000545464	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		33.42	■■■□□ 2.94
MACROD1-208	ENST00000545464	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		33.41	■■■□□ 2.94
MACROD1-208	ENST00000545464	LGR6	Q9HBX8	967 aa		33.41	■■■□□ 2.94
MACROD1-208	ENST00000545464	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		33.41	■■■□□ 2.94
MACROD1-208	ENST00000545464	TJP1	Q07157	1748 aa		33.41	■■■□□ 2.94
MACROD1-208	ENST00000545464	TM4SF1	P30408	202 aa		33.4	■■■□□ 2.94
MACROD1-208	ENST00000545464	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		33.4	■■■□□ 2.94
MACROD1-208	ENST00000545464	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		33.39	■■■□□ 2.94
MACROD1-208	ENST00000545464	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		33.39	■■■□□ 2.94
MACROD1-208	ENST00000545464	HTRA3	P83110	453 aa		33.38	■■■□□ 2.93
MACROD1-208	ENST00000545464	SLC39A6	Q13433	755 aa		33.38	■■■□□ 2.93
MACROD1-208	ENST00000545464	RRAGC	Q9HB90	399 aa		33.38	■■■□□ 2.93
MACROD1-208	ENST00000545464	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	33.35	■■■□□ 2.93
MACROD1-208	ENST00000545464	HMOX1	P09601	288 aa		33.35	■■■□□ 2.93
MACROD1-208	ENST00000545464	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		33.34	■■■□□ 2.93
MACROD1-208	ENST00000545464	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	33.34	■■■□□ 2.93
MACROD1-208	ENST00000545464	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	33.33	■■■□□ 2.93

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