RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533872.5

RPS2-215, Transcript of ribosomal protein S2, human

TSL 5

Gene RPS2, Length 1,114 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS2-215	ENST00000533872	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		32.4	■■■□□ 2.78
RPS2-215	ENST00000533872	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		32.4	■■■□□ 2.78
RPS2-215	ENST00000533872	MIER1	Q8N108	512 aa		32.39	■■■□□ 2.78
RPS2-215	ENST00000533872	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	32.39	■■■□□ 2.78
RPS2-215	ENST00000533872	PAPPA	Q13219	1627 aa		32.39	■■■□□ 2.78
RPS2-215	ENST00000533872	PALLD	Q8WX93	1383 aa		32.38	■■■□□ 2.77
RPS2-215	ENST00000533872	RIPK4	P57078	832 aa		32.37	■■■□□ 2.77
RPS2-215	ENST00000533872	TEF	Q10587	303 aa		32.36	■■■□□ 2.77
RPS2-215	ENST00000533872	TXNRD1	Q16881	649 aa		32.36	■■■□□ 2.77
RPS2-215	ENST00000533872	MCM10	Q7L590	875 aa		32.36	■■■□□ 2.77
RPS2-215	ENST00000533872	PROM2	Q8N271	834 aa		32.36	■■■□□ 2.77
RPS2-215	ENST00000533872	ATG3	Q9NT62	314 aa		32.35	■■■□□ 2.77
RPS2-215	ENST00000533872	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		32.35	■■■□□ 2.77
RPS2-215	ENST00000533872	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		32.34	■■■□□ 2.77
RPS2-215	ENST00000533872	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		32.34	■■■□□ 2.77
RPS2-215	ENST00000533872	APAF1	O14727	1248 aa		32.33	■■■□□ 2.77
RPS2-215	ENST00000533872	DCTN1	Q14203	1278 aa		32.33	■■■□□ 2.77
RPS2-215	ENST00000533872	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	32.33	■■■□□ 2.77
RPS2-215	ENST00000533872	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		32.32	■■■□□ 2.76
RPS2-215	ENST00000533872	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		32.31	■■■□□ 2.76
RPS2-215	ENST00000533872	NEUROD2	Q15784	382 aa		32.3	■■■□□ 2.76
RPS2-215	ENST00000533872	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		32.29	■■■□□ 2.76
RPS2-215	ENST00000533872	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	32.27	■■■□□ 2.76
RPS2-215	ENST00000533872	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		32.27	■■■□□ 2.76
RPS2-215	ENST00000533872	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		32.26	■■■□□ 2.75
RPS2-215	ENST00000533872	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		32.26	■■■□□ 2.75
RPS2-215	ENST00000533872	C5	P01031	1676 aa		32.25	■■■□□ 2.75
RPS2-215	ENST00000533872	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		32.25	■■■□□ 2.75
RPS2-215	ENST00000533872	SIK1	P57059	783 aa		32.25	■■■□□ 2.75
RPS2-215	ENST00000533872	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	32.25	■■■□□ 2.75
RPS2-215	ENST00000533872	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	32.25	■■■□□ 2.75
RPS2-215	ENST00000533872	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		32.25	■■■□□ 2.75
RPS2-215	ENST00000533872	SLC39A6	Q13433	755 aa		32.23	■■■□□ 2.75
RPS2-215	ENST00000533872	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	32.23	■■■□□ 2.75
RPS2-215	ENST00000533872	BTBD11	A6QL63	1104 aa		32.22	■■■□□ 2.75
RPS2-215	ENST00000533872	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	32.22	■■■□□ 2.75
RPS2-215	ENST00000533872	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		32.22	■■■□□ 2.75
RPS2-215	ENST00000533872	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	32.21	■■■□□ 2.75
RPS2-215	ENST00000533872	ZNF790	Q6PG37	636 aa		32.21	■■■□□ 2.75
RPS2-215	ENST00000533872	KCNQ4	P56696	695 aa		32.2	■■■□□ 2.75
RPS2-215	ENST00000533872	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		32.2	■■■□□ 2.75
RPS2-215	ENST00000533872	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	32.2	■■■□□ 2.75
RPS2-215	ENST00000533872	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	32.19	■■■□□ 2.74
RPS2-215	ENST00000533872	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	32.18	■■■□□ 2.74
RPS2-215	ENST00000533872	TJP1	Q07157	1748 aa		32.18	■■■□□ 2.74
RPS2-215	ENST00000533872	ATP6V1A	P38606	617 aa		32.18	■■■□□ 2.74
RPS2-215	ENST00000533872	CCDC27	Q2M243	656 aa		32.18	■■■□□ 2.74
RPS2-215	ENST00000533872	NBPF14	Q5TI25	921 aa		32.18	■■■□□ 2.74
RPS2-215	ENST00000533872	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		32.18	■■■□□ 2.74
RPS2-215	ENST00000533872	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	32.16	■■■□□ 2.74
RPS2-215	ENST00000533872	C4B	P0C0L5	1744 aa		32.16	■■■□□ 2.74
RPS2-215	ENST00000533872	ITPK1	Q13572	414 aa		32.14	■■■□□ 2.74
RPS2-215	ENST00000533872	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		32.14	■■■□□ 2.74
RPS2-215	ENST00000533872	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		32.13	■■■□□ 2.73
RPS2-215	ENST00000533872	NGEF	Q8N5V2	710 aa		32.13	■■■□□ 2.73
RPS2-215	ENST00000533872	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	32.13	■■■□□ 2.73
RPS2-215	ENST00000533872	KCNQ3	O43525	872 aa		32.12	■■■□□ 2.73
RPS2-215	ENST00000533872	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	32.12	■■■□□ 2.73
RPS2-215	ENST00000533872	STK32B	Q9NY57	414 aa		32.12	■■■□□ 2.73
RPS2-215	ENST00000533872	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		32.11	■■■□□ 2.73
RPS2-215	ENST00000533872	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		32.11	■■■□□ 2.73
RPS2-215	ENST00000533872	AKT1S1	Q96B36	256 aa		32.11	■■■□□ 2.73
RPS2-215	ENST00000533872	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		32.11	■■■□□ 2.73
RPS2-215	ENST00000533872	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		32.11	■■■□□ 2.73
RPS2-215	ENST00000533872	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		32.11	■■■□□ 2.73
RPS2-215	ENST00000533872	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		32.1	■■■□□ 2.73
RPS2-215	ENST00000533872	SLC15A2	Q16348	729 aa		32.1	■■■□□ 2.73
RPS2-215	ENST00000533872	ZNF827	Q17R98	1081 aa		32.1	■■■□□ 2.73
RPS2-215	ENST00000533872	WWC1	Q8IX03	1113 aa		32.09	■■■□□ 2.73
RPS2-215	ENST00000533872	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		32.09	■■■□□ 2.73
RPS2-215	ENST00000533872	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		32.09	■■■□□ 2.73
RPS2-215	ENST00000533872	CHL1	O00533	1208 aa		32.06	■■■□□ 2.72
RPS2-215	ENST00000533872	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	32.06	■■■□□ 2.72
RPS2-215	ENST00000533872	CFAP44	Q96MT7	982 aa		32.06	■■■□□ 2.72
RPS2-215	ENST00000533872	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		32.05	■■■□□ 2.72
RPS2-215	ENST00000533872	IFT57	Q9NWB7	429 aa		32.05	■■■□□ 2.72
RPS2-215	ENST00000533872	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		32.05	■■■□□ 2.72
RPS2-215	ENST00000533872	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		32.04	■■■□□ 2.72
RPS2-215	ENST00000533872	ZNF853	P0CG23	659 aa		32.03	■■■□□ 2.72
RPS2-215	ENST00000533872	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	32.03	■■■□□ 2.72
RPS2-215	ENST00000533872	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	32.03	■■■□□ 2.72
RPS2-215	ENST00000533872	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	32.03	■■■□□ 2.72
RPS2-215	ENST00000533872	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	32.03	■■■□□ 2.72
RPS2-215	ENST00000533872	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	32.03	■■■□□ 2.72
RPS2-215	ENST00000533872	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		32.02	■■■□□ 2.72
RPS2-215	ENST00000533872	GNAI1	P63096	354 aa		32.02	■■■□□ 2.72
RPS2-215	ENST00000533872	AK7	Q96M32	723 aa		32.02	■■■□□ 2.72
RPS2-215	ENST00000533872	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	32.02	■■■□□ 2.72
RPS2-215	ENST00000533872	IL16	Q14005	1332 aa		32.01	■■■□□ 2.72
RPS2-215	ENST00000533872	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	32.01	■■■□□ 2.71
RPS2-215	ENST00000533872	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	32.01	■■■□□ 2.71
RPS2-215	ENST00000533872	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		32.01	■■■□□ 2.71
RPS2-215	ENST00000533872	CASZ1	Q86V15	1759 aa		32.01	■■■□□ 2.71
RPS2-215	ENST00000533872	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	32	■■■□□ 2.71
RPS2-215	ENST00000533872	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	31.99	■■■□□ 2.71
RPS2-215	ENST00000533872	WDR63	Q8IWG1	891 aa		31.99	■■■□□ 2.71
RPS2-215	ENST00000533872	STARD3NL	O95772	234 aa		31.98	■■■□□ 2.71
RPS2-215	ENST00000533872	MBIP	Q9NS73	344 aa		31.98	■■■□□ 2.71
RPS2-215	ENST00000533872	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		31.97	■■■□□ 2.71
RPS2-215	ENST00000533872	ZNF521	Q96K83	1311 aa		31.97	■■■□□ 2.71

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