RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531092.5

GMDS-AS1-208, humanhuman

TSL 3

Gene GMDS-AS1, Length 744 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-208ENST00000531092 PKD1L3Q7Z443 1732 aa18.66■□□□□ 0.58
GMDS-AS1-208ENST00000531092 KCNA3P22001 575 aa18.65■□□□□ 0.58
GMDS-AS1-208ENST00000531092 COG3Q96JB2 828 aa18.65■□□□□ 0.58
GMDS-AS1-208ENST00000531092 SMC1BQ8NDV3 1235 aa18.64■□□□□ 0.57
GMDS-AS1-208ENST00000531092 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa18.64■□□□□ 0.57
GMDS-AS1-208ENST00000531092 RTL1A6NKG5 1358 aa18.64■□□□□ 0.57
GMDS-AS1-208ENST00000531092 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP18.62■□□□□ 0.57
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GMDS-AS1-208ENST00000531092 RNF181Q9P0P0 153 aa18.61■□□□□ 0.57
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GMDS-AS1-208ENST00000531092 DCAF5Q96JK2 942 aa18.6■□□□□ 0.57
GMDS-AS1-208ENST00000531092 CCDC87Q9NVE4 849 aa18.6■□□□□ 0.57
GMDS-AS1-208ENST00000531092 C4AP0C0L4 1744 aa18.6■□□□□ 0.57
GMDS-AS1-208ENST00000531092 ATP6V1AP38606 617 aa18.59■□□□□ 0.57
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GMDS-AS1-208ENST00000531092 PIM2Q9P1W9 311 aa18.58■□□□□ 0.56
GMDS-AS1-208ENST00000531092 INSRP06213 1382 aa18.56■□□□□ 0.56
GMDS-AS1-208ENST00000531092 GYS1P13807 737 aa18.56■□□□□ 0.56
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GMDS-AS1-208ENST00000531092 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
GMDS-AS1-208ENST00000531092 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
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GMDS-AS1-208ENST00000531092 ATG3Q9NT62 314 aa18.54■□□□□ 0.56
GMDS-AS1-208ENST00000531092 TMOD3Q9NYL9 352 aa18.54■□□□□ 0.56
GMDS-AS1-208ENST00000531092 SLC4A9Q96Q91 983 aa18.53■□□□□ 0.56
GMDS-AS1-208ENST00000531092 FYB1O15117 783 aa18.52■□□□□ 0.56
GMDS-AS1-208ENST00000531092 ADRA2BP18089 450 aa18.52■□□□□ 0.56
GMDS-AS1-208ENST00000531092 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
GMDS-AS1-208ENST00000531092 KDRP35968 1356 aa18.52■□□□□ 0.55
GMDS-AS1-208ENST00000531092 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
GMDS-AS1-208ENST00000531092 CARD11Q9BXL7 1154 aa18.51■□□□□ 0.55
GMDS-AS1-208ENST00000531092 GGNBP2Q9H3C7 697 aa18.51■□□□□ 0.55
GMDS-AS1-208ENST00000531092 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
GMDS-AS1-208ENST00000531092 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
GMDS-AS1-208ENST00000531092 NCAPD2Q15021 1401 aa18.5■□□□□ 0.55
GMDS-AS1-208ENST00000531092 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
GMDS-AS1-208ENST00000531092 FLT4P35916 1363 aa18.5■□□□□ 0.55
GMDS-AS1-208ENST00000531092 GLTPD2A6NH11 291 aa18.49■□□□□ 0.55
GMDS-AS1-208ENST00000531092 CHRNA5P30532 468 aa18.49■□□□□ 0.55
GMDS-AS1-208ENST00000531092 RFC4P35249 363 aa18.49■□□□□ 0.55
GMDS-AS1-208ENST00000531092 SPG7Q9UQ90 795 aa18.49■□□□□ 0.55
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GMDS-AS1-208ENST00000531092 RASSF7Q02833 373 aa18.48■□□□□ 0.55
GMDS-AS1-208ENST00000531092 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa18.48■□□□□ 0.55
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GMDS-AS1-208ENST00000531092 KIF24Q5T7B8 1368 aa18.47■□□□□ 0.55
GMDS-AS1-208ENST00000531092 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
GMDS-AS1-208ENST00000531092 FOXN1O15353 648 aa18.47■□□□□ 0.55
GMDS-AS1-208ENST00000531092 DDR1Q08345 913 aa18.47■□□□□ 0.55
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GMDS-AS1-208ENST00000531092 PHKG2P15735 406 aa18.46■□□□□ 0.55
GMDS-AS1-208ENST00000531092 PRDM10Q9NQV6 1147 aa18.46■□□□□ 0.55
GMDS-AS1-208ENST00000531092 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP18.46■□□□□ 0.551e-9■■□□□ 12.8
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GMDS-AS1-208ENST00000531092 TESK2Q96S53 571 aa18.45■□□□□ 0.54
GMDS-AS1-208ENST00000531092 LMNB1P20700 586 aa18.44■□□□□ 0.54
GMDS-AS1-208ENST00000531092 FKBP8Q14318 412 aa18.44■□□□□ 0.54
GMDS-AS1-208ENST00000531092 IFNL2Q8IZJ0 200 aa18.44■□□□□ 0.54
GMDS-AS1-208ENST00000531092 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
GMDS-AS1-208ENST00000531092 PCDH10Q9P2E7 1040 aa18.44■□□□□ 0.54
GMDS-AS1-208ENST00000531092 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
GMDS-AS1-208ENST00000531092 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
GMDS-AS1-208ENST00000531092 TONSLQ96HA7 1378 aa18.43■□□□□ 0.54
GMDS-AS1-208ENST00000531092 CREBZFQ9NS37 354 aa18.43■□□□□ 0.54
GMDS-AS1-208ENST00000531092 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa18.42■□□□□ 0.54
GMDS-AS1-208ENST00000531092 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
GMDS-AS1-208ENST00000531092 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
GMDS-AS1-208ENST00000531092 FAM161AQ3B820 660 aa18.4■□□□□ 0.54
GMDS-AS1-208ENST00000531092 EYA1Q99502 592 aa18.4■□□□□ 0.54
GMDS-AS1-208ENST00000531092 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa18.39■□□□□ 0.54
GMDS-AS1-208ENST00000531092 TM4SF1P30408 202 aa18.39■□□□□ 0.53
GMDS-AS1-208ENST00000531092 TIAM2Q8IVF5 1701 aa18.39■□□□□ 0.53
GMDS-AS1-208ENST00000531092 CNTNAP1P78357 1384 aa18.38■□□□□ 0.53
GMDS-AS1-208ENST00000531092 ERVV-2B6SEH9 535 aa18.37■□□□□ 0.53
GMDS-AS1-208ENST00000531092 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
GMDS-AS1-208ENST00000531092 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa18.36■□□□□ 0.53
GMDS-AS1-208ENST00000531092 NFKBIEO00221 500 aa18.36■□□□□ 0.53
GMDS-AS1-208ENST00000531092 CRKLP46109 303 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
GMDS-AS1-208ENST00000531092 CHADLQ6NUI6 762 aa18.36■□□□□ 0.53
GMDS-AS1-208ENST00000531092 KIF20BQ96Q89 1820 aa18.36■□□□□ 0.53
GMDS-AS1-208ENST00000531092 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa18.35■□□□□ 0.53
GMDS-AS1-208ENST00000531092 POTEIP0CG38 1075 aa18.35■□□□□ 0.53
GMDS-AS1-208ENST00000531092 POTEJP0CG39 1038 aa18.35■□□□□ 0.53
GMDS-AS1-208ENST00000531092 ABHD8Q96I13 439 aa18.35■□□□□ 0.53
GMDS-AS1-208ENST00000531092 WASHC2AQ641Q2 1341 aa18.34■□□□□ 0.53
GMDS-AS1-208ENST00000531092 DLEC1Q9Y238 1755 aa18.33■□□□□ 0.53
GMDS-AS1-208ENST00000531092 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa18.33■□□□□ 0.52
GMDS-AS1-208ENST00000531092 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.52
GMDS-AS1-208ENST00000531092 LBX1P52954 281 aa18.33■□□□□ 0.52
GMDS-AS1-208ENST00000531092 DPY19L2Q6NUT2 758 aa18.33■□□□□ 0.52
GMDS-AS1-208ENST00000531092 TTLL6Q8N841 843 aa18.33■□□□□ 0.52
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