RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513165.1

HOXC-AS3-202, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 533 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C4BP0C0L5 1744 aa22.71■■□□□ 1.23
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HMOX1P09601 288 aa22.7■■□□□ 1.22
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ITPK1Q13572 414 aa22.7■■□□□ 1.22
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LINC00116Q8NCU8 138 aa22.7■■□□□ 1.22
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SSFA2P28290 1259 aa22.69■■□□□ 1.22
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa22.69■■□□□ 1.22
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SLC4A9Q96Q91 983 aa22.66■■□□□ 1.22
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
HOXC-AS3-202ENST00000513165 AMIGO3Q86WK7 504 aa22.65■■□□□ 1.22
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CFAP53Q96M91 514 aa22.65■■□□□ 1.22
HOXC-AS3-202ENST00000513165 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF831Q5JPB2 1677 aa22.65■■□□□ 1.22
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
HOXC-AS3-202ENST00000513165 UBR3Q6ZT12 1888 aa22.63■■□□□ 1.21
HOXC-AS3-202ENST00000513165 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GNPATO15228 680 aa22.63■■□□□ 1.21
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PHF14O94880 888 aa22.63■■□□□ 1.21
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SLC52A2Q9HAB3 445 aa22.63■■□□□ 1.21
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LGR6Q9HBX8 967 aa22.63■■□□□ 1.21
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RNMTO43148 476 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MSL1Q68DK7 614 aa22.62■■□□□ 1.21
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SCN11AQ9UI33 1791 aa22.61■■□□□ 1.21
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PPP2R1AP30153 589 aa22.61■■□□□ 1.21
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa22.6■■□□□ 1.21
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
HOXC-AS3-202ENST00000513165 YY1P25490 414 aa22.6■■□□□ 1.21
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TRAPPC3LQ5T215 181 aa22.6■■□□□ 1.21
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SMIM5Q71RC9 77 aa22.6■■□□□ 1.21
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KLHL34Q8N239 644 aa22.6■■□□□ 1.21
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NUDCQ9Y266 331 aa22.6■■□□□ 1.21
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RPS6KA4O75676 772 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ADRA2BP18089 450 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GAS2L2Q8NHY3 880 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CD2APQ9Y5K6 639 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MRC1P22897 1456 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GNAT3A8MTJ3 354 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GPR162Q16538 588 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NLGN2Q8NFZ4 835 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NLGN1Q8N2Q7 840 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa22.54■■□□□ 1.2
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RSPH6AQ9H0K4 717 aa22.53■■□□□ 1.2
HOXC-AS3-202ENST00000513165 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FCHSD2O94868 740 aa22.52■■□□□ 1.2
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PRKAR2BP31323 418 aa22.52■■□□□ 1.2
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RFC4P35249 363 aa22.52■■□□□ 1.2
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CRKLP46109 303 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
HOXC-AS3-202ENST00000513165 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
HOXC-AS3-202ENST00000513165 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP22.51■■□□□ 1.19
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SLC39A6Q13433 755 aa22.51■■□□□ 1.19
HOXC-AS3-202ENST00000513165 VSIG10Q8N0Z9 540 aa22.51■■□□□ 1.19
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IL17REQ8NFR9 667 aa22.51■■□□□ 1.19
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PHACTR3Q96KR7 559 aa22.51■■□□□ 1.19
HOXC-AS3-202ENST00000513165 UTRNP46939 3433 aa22.5■■□□□ 1.19
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TEFQ10587 303 aa22.49■■□□□ 1.19
HOXC-AS3-202ENST00000513165 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DNAJC10Q8IXB1 793 aa22.49■■□□□ 1.19
HOXC-AS3-202ENST00000513165 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GYS1P13807 737 aa22.48■■□□□ 1.19
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GRIN3BO60391 1043 aa22.47■■□□□ 1.19
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MMP10P09238 476 aa22.47■■□□□ 1.19
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TTC5Q8N0Z6 440 aa22.46■■□□□ 1.19
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CCDC87Q9NVE4 849 aa22.46■■□□□ 1.19
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa22.46■■□□□ 1.19
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TJP1Q07157 1748 aa22.45■■□□□ 1.19
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KCPQ6ZWJ8 1503 aa22.45■■□□□ 1.18
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CHD4Q14839 1912 aa22.44■■□□□ 1.18
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF790Q6PG37 636 aa22.44■■□□□ 1.18
HOXC-AS3-202ENST00000513165 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP22.43■■□□□ 1.18
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
HOXC-AS3-202ENST00000513165 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RALBP1Q15311 655 aa22.42■■□□□ 1.18
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
HOXC-AS3-202ENST00000513165 STARD3NLO95772 234 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PARP3Q9Y6F1 533 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TGFB2P61812 414 aa22.4■■□□□ 1.18
HOXC-AS3-202ENST00000513165 BTBD11A6QL63 1104 aa22.39■■□□□ 1.17
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZPR1O75312 459 aa22.39■■□□□ 1.17
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NEFMP07197 916 aa22.39■■□□□ 1.17
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FMNL2Q96PY5 1086 aa22.39■■□□□ 1.17
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
HOXC-AS3-202ENST00000513165 UBR2Q8IWV8 1755 aa22.39■■□□□ 1.17
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HEG1Q9ULI3 1381 aa22.38■■□□□ 1.17
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa22.38■■□□□ 1.17
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C4AP0C0L4 1744 aa22.37■■□□□ 1.17
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