RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498594.5

CRAMP1-208, Transcript of cramped chromatin regulator homolog 1, human

TSL 4

Gene CRAMP1, Length 559 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CRAMP1-208	ENST00000498594	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CRAMP1-208	ENST00000498594	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CRAMP1-208	ENST00000498594	DDB1	Q16531	1140 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CRAMP1-208	ENST00000498594	SECISBP2L	Q93073	1101 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CRAMP1-208	ENST00000498594	RNF25	Q96BH1	459 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CRAMP1-208	ENST00000498594	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CRAMP1-208	ENST00000498594	SYT17	Q9BSW7	474 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CRAMP1-208	ENST00000498594	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CRAMP1-208	ENST00000498594	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CRAMP1-208	ENST00000498594	SLIT3	O75094	1523 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CRAMP1-208	ENST00000498594	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CRAMP1-208	ENST00000498594	PHF14	O94880	888 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CRAMP1-208	ENST00000498594	NLRP6	P59044	892 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CRAMP1-208	ENST00000498594	TXNRD1	Q16881	649 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CRAMP1-208	ENST00000498594	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CRAMP1-208	ENST00000498594	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CRAMP1-208	ENST00000498594	NLRP13	Q86W25	1043 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CRAMP1-208	ENST00000498594	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CRAMP1-208	ENST00000498594	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CRAMP1-208	ENST00000498594	CABP2	Q9NPB3	220 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CRAMP1-208	ENST00000498594	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CRAMP1-208	ENST00000498594	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CRAMP1-208	ENST00000498594	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CRAMP1-208	ENST00000498594	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CRAMP1-208	ENST00000498594	SLC15A2	Q16348	729 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CRAMP1-208	ENST00000498594	CEP120	Q8N960	986 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CRAMP1-208	ENST00000498594	RGS22	Q8NE09	1264 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CRAMP1-208	ENST00000498594	GTPBP4	Q9BZE4	634 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CRAMP1-208	ENST00000498594	STK32B	Q9NY57	414 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CRAMP1-208	ENST00000498594	CABP1	Q9NZU7	370 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CRAMP1-208	ENST00000498594	GTF3C5	Q9Y5Q8	519 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CRAMP1-208	ENST00000498594	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CRAMP1-208	ENST00000498594	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CRAMP1-208	ENST00000498594	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CRAMP1-208	ENST00000498594	C5	P01031	1676 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CRAMP1-208	ENST00000498594	STK25	O00506	426 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CRAMP1-208	ENST00000498594	RGS3	P49796	1198 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CRAMP1-208	ENST00000498594	KCNQ4	P56696	695 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CRAMP1-208	ENST00000498594	IRX3	P78415	501 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CRAMP1-208	ENST00000498594	GPR162	Q16538	588 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CRAMP1-208	ENST00000498594	ZNF827	Q17R98	1081 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CRAMP1-208	ENST00000498594	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CRAMP1-208	ENST00000498594	MTFR1L	Q9H019	292 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CRAMP1-208	ENST00000498594	YY1AP1	Q9H869	796 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CRAMP1-208	ENST00000498594	TMEM51	Q9NW97	253 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CRAMP1-208	ENST00000498594	USP6	P35125	1406 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CRAMP1-208	ENST00000498594	NFAT5	O94916	1531 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CRAMP1-208	ENST00000498594	USP54	Q70EL1	1684 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CRAMP1-208	ENST00000498594	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CRAMP1-208	ENST00000498594	EXOC5	O00471	708 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CRAMP1-208	ENST00000498594	LETM1	O95202	739 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CRAMP1-208	ENST00000498594	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CRAMP1-208	ENST00000498594	DMTN	Q08495	405 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CRAMP1-208	ENST00000498594	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CRAMP1-208	ENST00000498594	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CRAMP1-208	ENST00000498594	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CRAMP1-208	ENST00000498594	SBF1	O95248	1867 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CRAMP1-208	ENST00000498594	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CRAMP1-208	ENST00000498594	ABCB7	O75027	752 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CRAMP1-208	ENST00000498594	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CRAMP1-208	ENST00000498594	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CRAMP1-208	ENST00000498594	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CRAMP1-208	ENST00000498594	FAM212A	Q96EL1	285 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CRAMP1-208	ENST00000498594	PLCD4	Q9BRC7	762 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CRAMP1-208	ENST00000498594	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CRAMP1-208	ENST00000498594	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CRAMP1-208	ENST00000498594	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CRAMP1-208	ENST00000498594	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CRAMP1-208	ENST00000498594	ABCC6	O95255	1503 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CRAMP1-208	ENST00000498594	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CRAMP1-208	ENST00000498594	BCL9	O00512	1426 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CRAMP1-208	ENST00000498594	TNS2	Q63HR2	1409 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CRAMP1-208	ENST00000498594	MS4A1	P11836	297 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CRAMP1-208	ENST00000498594	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	4.74	□□□□□ -1.65
CRAMP1-208	ENST00000498594	DHX30	Q7L2E3	1194 aa	Known RBP eCLIP	4.74	□□□□□ -1.65
CRAMP1-208	ENST00000498594	WDR70	Q9NW82	654 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CRAMP1-208	ENST00000498594	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CRAMP1-208	ENST00000498594	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CRAMP1-208	ENST00000498594	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CRAMP1-208	ENST00000498594	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CRAMP1-208	ENST00000498594	NUBP1	P53384	320 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CRAMP1-208	ENST00000498594	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CRAMP1-208	ENST00000498594	FAM193A	P78312	1265 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CRAMP1-208	ENST00000498594	PPP4R3B	Q5MIZ7	849 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CRAMP1-208	ENST00000498594	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	4.73	□□□□□ -1.65
CRAMP1-208	ENST00000498594	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CRAMP1-208	ENST00000498594	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CRAMP1-208	ENST00000498594	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CRAMP1-208	ENST00000498594	AKT1S1	Q96B36	256 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CRAMP1-208	ENST00000498594	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CRAMP1-208	ENST00000498594	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CRAMP1-208	ENST00000498594	TSPYL1	Q9H0U9	437 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CRAMP1-208	ENST00000498594	RRAGD	Q9NQL2	400 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CRAMP1-208	ENST00000498594	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CRAMP1-208	ENST00000498594	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CRAMP1-208	ENST00000498594	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CRAMP1-208	ENST00000498594	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CRAMP1-208	ENST00000498594	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CRAMP1-208	ENST00000498594	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CRAMP1-208	ENST00000498594	DSG3	P32926	999 aa		4.72	□□□□□ -1.65

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