RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496298.5

USP40-217, Transcript of ubiquitin specific peptidase 40, humanhuman

TSL 2

Gene USP40, Length 665 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP40-217ENST00000496298 ITPK1Q13572 414 aa26.21■■□□□ 1.79
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USP40-217ENST00000496298 LINC00116Q8NCU8 138 aa26.2■■□□□ 1.78
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USP40-217ENST00000496298 DCAF8L1A6NGE4 600 aa26.18■■□□□ 1.78
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USP40-217ENST00000496298 SLC4A9Q96Q91 983 aa26.18■■□□□ 1.78
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USP40-217ENST00000496298 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
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USP40-217ENST00000496298 CHD4Q14839 1912 aa26.02■■□□□ 1.76
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USP40-217ENST00000496298 C10orf71Q711Q0 1435 aa25.82■■□□□ 1.72
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USP40-217ENST00000496298 STARD3NLO95772 234 aa25.81■■□□□ 1.72
USP40-217ENST00000496298 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
USP40-217ENST00000496298 PLEKHF1Q96S99 279 aa25.81■■□□□ 1.72
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