RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496246.5

TTLL3-231, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, humanhuman

TSL 4

Gene TTLL3, Length 507 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL3-231ENST00000496246 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa15.09■□□□□ 0.01
TTLL3-231ENST00000496246 PAPPAQ13219 1627 aa15.08■□□□□ 0
TTLL3-231ENST00000496246 GNAT3A8MTJ3 354 aa15.08■□□□□ 0
TTLL3-231ENST00000496246 FCHSD2O94868 740 aa15.08■□□□□ 0
TTLL3-231ENST00000496246 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
TTLL3-231ENST00000496246 TTC5Q8N0Z6 440 aa15.08■□□□□ 0
TTLL3-231ENST00000496246 C5P01031 1676 aa15.07■□□□□ 0
TTLL3-231ENST00000496246 CASZ1Q86V15 1759 aa15.07■□□□□ 0
TTLL3-231ENST00000496246 PRKAR2BP31323 418 aa15.07■□□□□ 0
TTLL3-231ENST00000496246 ARXQ96QS3 562 aa15.07■□□□□ 0
TTLL3-231ENST00000496246 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa15.07■□□□□ 0
TTLL3-231ENST00000496246 QSER1Q2KHR3 1735 aa15.06■□□□□ 0
TTLL3-231ENST00000496246 RNMTO43148 476 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
TTLL3-231ENST00000496246 KLHL34Q8N239 644 aa15.06■□□□□ 0
TTLL3-231ENST00000496246 SLC52A2Q9HAB3 445 aa15.06■□□□□ 0
TTLL3-231ENST00000496246 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
TTLL3-231ENST00000496246 GNPATO15228 680 aa15.05■□□□□ -0
TTLL3-231ENST00000496246 PHF14O94880 888 aa15.05■□□□□ -0
TTLL3-231ENST00000496246 SSFA2P28290 1259 aa15.05■□□□□ -0
TTLL3-231ENST00000496246 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP15.05■□□□□ -0
TTLL3-231ENST00000496246 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa15.05■□□□□ -0
TTLL3-231ENST00000496246 MAP3K5Q99683 1374 aa15.05■□□□□ -0
TTLL3-231ENST00000496246 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP15.05■□□□□ -0
TTLL3-231ENST00000496246 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP15.05■□□□□ -0
TTLL3-231ENST00000496246 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
TTLL3-231ENST00000496246 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
TTLL3-231ENST00000496246 C4BP0C0L5 1744 aa15.03■□□□□ -0
TTLL3-231ENST00000496246 TRAPPC3LQ5T215 181 aa15.03■□□□□ -0
TTLL3-231ENST00000496246 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
TTLL3-231ENST00000496246 SCN11AQ9UI33 1791 aa15.03■□□□□ -0
TTLL3-231ENST00000496246 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa15.02■□□□□ -0
TTLL3-231ENST00000496246 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
TTLL3-231ENST00000496246 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
TTLL3-231ENST00000496246 ADRA2BP18089 450 aa15.02■□□□□ -0
TTLL3-231ENST00000496246 PTGER2P43116 358 aa15.02■□□□□ -0
TTLL3-231ENST00000496246 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
TTLL3-231ENST00000496246 LINC00116Q8NCU8 138 aa15.02■□□□□ -0
TTLL3-231ENST00000496246 RSPH6AQ9H0K4 717 aa15.02■□□□□ -0
TTLL3-231ENST00000496246 TAF1LQ8IZX4 1826 aa15.01□□□□□ -0.01
TTLL3-231ENST00000496246 RFC4P35249 363 aa15.01□□□□□ -0.01
TTLL3-231ENST00000496246 LGR6Q9HBX8 967 aa15.01□□□□□ -0.01
TTLL3-231ENST00000496246 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa15□□□□□ -0.01
TTLL3-231ENST00000496246 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
TTLL3-231ENST00000496246 ITPK1Q13572 414 aa15□□□□□ -0.01
TTLL3-231ENST00000496246 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP15□□□□□ -0.01
TTLL3-231ENST00000496246 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
TTLL3-231ENST00000496246 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
TTLL3-231ENST00000496246 STARD3NLO95772 234 aa14.99□□□□□ -0.01
TTLL3-231ENST00000496246 VSIG10Q8N0Z9 540 aa14.99□□□□□ -0.01
TTLL3-231ENST00000496246 ZNF831Q5JPB2 1677 aa14.98□□□□□ -0.01
TTLL3-231ENST00000496246 BTBD11A6QL63 1104 aa14.98□□□□□ -0.01
TTLL3-231ENST00000496246 RPS6KA4O75676 772 aa14.98□□□□□ -0.01
TTLL3-231ENST00000496246 MSL1Q68DK7 614 aa14.98□□□□□ -0.01
TTLL3-231ENST00000496246 SYT17Q9BSW7 474 aa14.98□□□□□ -0.01
TTLL3-231ENST00000496246 NLGN1Q8N2Q7 840 aa14.97□□□□□ -0.01
TTLL3-231ENST00000496246 PHACTR3Q96KR7 559 aa14.97□□□□□ -0.01
TTLL3-231ENST00000496246 FMNL2Q96PY5 1086 aa14.97□□□□□ -0.01
TTLL3-231ENST00000496246 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa14.96□□□□□ -0.01
TTLL3-231ENST00000496246 ZPR1O75312 459 aa14.96□□□□□ -0.01
TTLL3-231ENST00000496246 CRKLP46109 303 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
TTLL3-231ENST00000496246 LMOD3Q0VAK6 560 aa14.96□□□□□ -0.01
TTLL3-231ENST00000496246 SLC39A6Q13433 755 aa14.96□□□□□ -0.01
TTLL3-231ENST00000496246 SGIP1Q9BQI5 828 aa14.96□□□□□ -0.01
TTLL3-231ENST00000496246 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
TTLL3-231ENST00000496246 MRC1P22897 1456 aa14.95□□□□□ -0.02
TTLL3-231ENST00000496246 GPR162Q16538 588 aa14.95□□□□□ -0.02
TTLL3-231ENST00000496246 ZNF790Q6PG37 636 aa14.95□□□□□ -0.02
TTLL3-231ENST00000496246 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
TTLL3-231ENST00000496246 CCDC87Q9NVE4 849 aa14.95□□□□□ -0.02
TTLL3-231ENST00000496246 A0A087WZG4 1122 aa14.94□□□□□ -0.02
TTLL3-231ENST00000496246 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
TTLL3-231ENST00000496246 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
TTLL3-231ENST00000496246 IL17REQ8NFR9 667 aa14.94□□□□□ -0.02
TTLL3-231ENST00000496246 UBR3Q6ZT12 1888 aa14.94□□□□□ -0.02
TTLL3-231ENST00000496246 NFE2L2Q16236 605 aa14.93□□□□□ -0.02
TTLL3-231ENST00000496246 DNAJC10Q8IXB1 793 aa14.93□□□□□ -0.02
TTLL3-231ENST00000496246 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
TTLL3-231ENST00000496246 SLC4A9Q96Q91 983 aa14.93□□□□□ -0.02
TTLL3-231ENST00000496246 CD2APQ9Y5K6 639 aa14.93□□□□□ -0.02
TTLL3-231ENST00000496246 PARP3Q9Y6F1 533 aa14.93□□□□□ -0.02
TTLL3-231ENST00000496246 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
TTLL3-231ENST00000496246 MCM10Q7L590 875 aa14.92□□□□□ -0.02
TTLL3-231ENST00000496246 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
TTLL3-231ENST00000496246 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa14.91□□□□□ -0.02
TTLL3-231ENST00000496246 HEG1Q9ULI3 1381 aa14.91□□□□□ -0.02
TTLL3-231ENST00000496246 ANP32CO43423 234 aa14.91□□□□□ -0.02
TTLL3-231ENST00000496246 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa14.9□□□□□ -0.02
TTLL3-231ENST00000496246 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
TTLL3-231ENST00000496246 GRIN3BO60391 1043 aa14.89□□□□□ -0.03
TTLL3-231ENST00000496246 MMP10P09238 476 aa14.89□□□□□ -0.03
TTLL3-231ENST00000496246 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
TTLL3-231ENST00000496246 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
TTLL3-231ENST00000496246 CANXP27824 592 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
TTLL3-231ENST00000496246 RIPK4P57078 832 aa14.89□□□□□ -0.03
TTLL3-231ENST00000496246 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
TTLL3-231ENST00000496246 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
TTLL3-231ENST00000496246 COL24A1Q17RW2 1714 aa14.88□□□□□ -0.03
TTLL3-231ENST00000496246 YY1P25490 414 aa14.87□□□□□ -0.03
TTLL3-231ENST00000496246 DCTN1Q14203 1278 aa14.87□□□□□ -0.03
TTLL3-231ENST00000496246 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.3 ms