RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493436.5

SH3BP4-211, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 481 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-211ENST00000493436 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
SH3BP4-211ENST00000493436 ATP6V1AP38606 617 aa22.54■■□□□ 1.2
SH3BP4-211ENST00000493436 AKAP4Q5JQC9 854 aa22.54■■□□□ 1.2
SH3BP4-211ENST00000493436 LINC00116Q8NCU8 138 aa22.53■■□□□ 1.2
SH3BP4-211ENST00000493436 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
SH3BP4-211ENST00000493436 POLD1P28340 1107 aa22.52■■□□□ 1.2
SH3BP4-211ENST00000493436 ITPK1Q13572 414 aa22.52■■□□□ 1.2
SH3BP4-211ENST00000493436 FLAD1Q8NFF5 587 aa22.52■■□□□ 1.2
SH3BP4-211ENST00000493436 CFAP53Q96M91 514 aa22.52■■□□□ 1.2
SH3BP4-211ENST00000493436 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
SH3BP4-211ENST00000493436 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa22.51■■□□□ 1.19
SH3BP4-211ENST00000493436 SYT17Q9BSW7 474 aa22.51■■□□□ 1.19
SH3BP4-211ENST00000493436 DCAF8L1A6NGE4 600 aa22.5■■□□□ 1.19
SH3BP4-211ENST00000493436 PPP2R1AP30153 589 aa22.5■■□□□ 1.19
SH3BP4-211ENST00000493436 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
SH3BP4-211ENST00000493436 ZNF831Q5JPB2 1677 aa22.49■■□□□ 1.19
SH3BP4-211ENST00000493436 PHF14O94880 888 aa22.48■■□□□ 1.19
SH3BP4-211ENST00000493436 AMIGO3Q86WK7 504 aa22.48■■□□□ 1.19
SH3BP4-211ENST00000493436 LGR6Q9HBX8 967 aa22.48■■□□□ 1.19
SH3BP4-211ENST00000493436 RNMTO43148 476 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
SH3BP4-211ENST00000493436 MSL1Q68DK7 614 aa22.47■■□□□ 1.19
SH3BP4-211ENST00000493436 SMIM5Q71RC9 77 aa22.47■■□□□ 1.19
SH3BP4-211ENST00000493436 SLC4A9Q96Q91 983 aa22.47■■□□□ 1.19
SH3BP4-211ENST00000493436 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
SH3BP4-211ENST00000493436 GNPATO15228 680 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP4-211ENST00000493436 SSFA2P28290 1259 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP4-211ENST00000493436 SLC52A2Q9HAB3 445 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP4-211ENST00000493436 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.19
SH3BP4-211ENST00000493436 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
SH3BP4-211ENST00000493436 KLHL34Q8N239 644 aa22.45■■□□□ 1.18
SH3BP4-211ENST00000493436 NUDCQ9Y266 331 aa22.45■■□□□ 1.18
SH3BP4-211ENST00000493436 MAP3K5Q99683 1374 aa22.45■■□□□ 1.18
SH3BP4-211ENST00000493436 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa22.43■■□□□ 1.18
SH3BP4-211ENST00000493436 MRC1P22897 1456 aa22.43■■□□□ 1.18
SH3BP4-211ENST00000493436 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
SH3BP4-211ENST00000493436 GAS2L2Q8NHY3 880 aa22.42■■□□□ 1.18
SH3BP4-211ENST00000493436 PRKAR2BP31323 418 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP4-211ENST00000493436 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
SH3BP4-211ENST00000493436 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP22.4■■□□□ 1.18
SH3BP4-211ENST00000493436 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
SH3BP4-211ENST00000493436 RSPH6AQ9H0K4 717 aa22.4■■□□□ 1.18
SH3BP4-211ENST00000493436 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
SH3BP4-211ENST00000493436 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa22.39■■□□□ 1.18
SH3BP4-211ENST00000493436 GNAT3A8MTJ3 354 aa22.39■■□□□ 1.17
SH3BP4-211ENST00000493436 TJP1Q07157 1748 aa22.39■■□□□ 1.17
SH3BP4-211ENST00000493436 SLC39A6Q13433 755 aa22.38■■□□□ 1.17
SH3BP4-211ENST00000493436 PHACTR3Q96KR7 559 aa22.38■■□□□ 1.17
SH3BP4-211ENST00000493436 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
SH3BP4-211ENST00000493436 TRAPPC3LQ5T215 181 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BP4-211ENST00000493436 RPS6KA4O75676 772 aa22.36■■□□□ 1.17
SH3BP4-211ENST00000493436 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
SH3BP4-211ENST00000493436 FCHSD2O94868 740 aa22.35■■□□□ 1.17
SH3BP4-211ENST00000493436 ADRA2BP18089 450 aa22.35■■□□□ 1.17
SH3BP4-211ENST00000493436 CRKLP46109 303 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
SH3BP4-211ENST00000493436 IL17REQ8NFR9 667 aa22.35■■□□□ 1.17
SH3BP4-211ENST00000493436 NLGN2Q8NFZ4 835 aa22.35■■□□□ 1.17
SH3BP4-211ENST00000493436 TEFQ10587 303 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP4-211ENST00000493436 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
SH3BP4-211ENST00000493436 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
SH3BP4-211ENST00000493436 KCPQ6ZWJ8 1503 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BP4-211ENST00000493436 YY1P25490 414 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BP4-211ENST00000493436 DNAJC10Q8IXB1 793 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BP4-211ENST00000493436 UBR2Q8IWV8 1755 aa22.33■■□□□ 1.16
SH3BP4-211ENST00000493436 C4AP0C0L4 1744 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP4-211ENST00000493436 RFC4P35249 363 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP4-211ENST00000493436 GPR162Q16538 588 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP4-211ENST00000493436 CHD4Q14839 1912 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BP4-211ENST00000493436 TTC5Q8N0Z6 440 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BP4-211ENST00000493436 RALBP1Q15311 655 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP4-211ENST00000493436 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
SH3BP4-211ENST00000493436 CD2APQ9Y5K6 639 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP4-211ENST00000493436 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP4-211ENST00000493436 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
SH3BP4-211ENST00000493436 VSIG10Q8N0Z9 540 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP4-211ENST00000493436 CCDC87Q9NVE4 849 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP4-211ENST00000493436 MMP10P09238 476 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP4-211ENST00000493436 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
SH3BP4-211ENST00000493436 NLGN1Q8N2Q7 840 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP4-211ENST00000493436 GYS1P13807 737 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP4-211ENST00000493436 ZNF790Q6PG37 636 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP4-211ENST00000493436 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
SH3BP4-211ENST00000493436 NEFMP07197 916 aa22.26■■□□□ 1.15
SH3BP4-211ENST00000493436 DLG5Q8TDM6 1919 aa22.25■■□□□ 1.15
SH3BP4-211ENST00000493436 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
SH3BP4-211ENST00000493436 BTBD11A6QL63 1104 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP4-211ENST00000493436 MCM10Q7L590 875 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP4-211ENST00000493436 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
SH3BP4-211ENST00000493436 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
SH3BP4-211ENST00000493436 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP4-211ENST00000493436 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
SH3BP4-211ENST00000493436 UTRNP46939 3433 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP4-211ENST00000493436 HEG1Q9ULI3 1381 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP4-211ENST00000493436 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
SH3BP4-211ENST00000493436 DCTN1Q14203 1278 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP4-211ENST00000493436 STARD3NLO95772 234 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP4-211ENST00000493436 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP22.21■■□□□ 1.15
SH3BP4-211ENST00000493436 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
SH3BP4-211ENST00000493436 FMNL2Q96PY5 1086 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP4-211ENST00000493436 PLEKHF1Q96S99 279 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP4-211ENST00000493436 KIF13BQ9NQT8 1826 aa22.21■■□□□ 1.15
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