RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	23.28	■■□□□ 1.32
HDAC10-216	ENST00000489424	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	23.27	■■□□□ 1.32
HDAC10-216	ENST00000489424	ATP6V1A	P38606	617 aa		23.27	■■□□□ 1.32
HDAC10-216	ENST00000489424	YY1	P25490	414 aa		23.26	■■□□□ 1.31
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		23.25	■■□□□ 1.31
HDAC10-216	ENST00000489424	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		23.24	■■□□□ 1.31
HDAC10-216	ENST00000489424	CFAP53	Q96M91	514 aa		23.24	■■□□□ 1.31
HDAC10-216	ENST00000489424	C4B	P0C0L5	1744 aa		23.24	■■□□□ 1.31
HDAC10-216	ENST00000489424	MSH5	O43196	834 aa		23.23	■■□□□ 1.31
HDAC10-216	ENST00000489424	ADRA2B	P18089	450 aa		23.23	■■□□□ 1.31
HDAC10-216	ENST00000489424	ITPK1	Q13572	414 aa		23.23	■■□□□ 1.31
HDAC10-216	ENST00000489424	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		23.23	■■□□□ 1.31
HDAC10-216	ENST00000489424	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	23.22	■■□□□ 1.31
HDAC10-216	ENST00000489424	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	23.22	■■□□□ 1.31
HDAC10-216	ENST00000489424	CHD4	Q14839	1912 aa		23.21	■■□□□ 1.31
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		23.21	■■□□□ 1.31
HDAC10-216	ENST00000489424	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		23.21	■■□□□ 1.31
HDAC10-216	ENST00000489424	HMOX1	P09601	288 aa		23.2	■■□□□ 1.3
HDAC10-216	ENST00000489424	KLHL34	Q8N239	644 aa		23.2	■■□□□ 1.3
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		23.2	■■□□□ 1.3
HDAC10-216	ENST00000489424	NUDC	Q9Y266	331 aa		23.2	■■□□□ 1.3
HDAC10-216	ENST00000489424	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		23.2	■■□□□ 1.3
HDAC10-216	ENST00000489424	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	23.19	■■□□□ 1.3
HDAC10-216	ENST00000489424	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	23.19	■■□□□ 1.3
HDAC10-216	ENST00000489424	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	23.19	■■□□□ 1.3
HDAC10-216	ENST00000489424	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		23.18	■■□□□ 1.3
HDAC10-216	ENST00000489424	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	23.18	■■□□□ 1.3
HDAC10-216	ENST00000489424	GNPAT	O15228	680 aa		23.17	■■□□□ 1.3
HDAC10-216	ENST00000489424	RPS6KA4	O75676	772 aa		23.17	■■□□□ 1.3
HDAC10-216	ENST00000489424	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		23.16	■■□□□ 1.3
HDAC10-216	ENST00000489424	PPP2R1A	P30153	589 aa		23.16	■■□□□ 1.3
HDAC10-216	ENST00000489424	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		23.16	■■□□□ 1.3
HDAC10-216	ENST00000489424	MRC1	P22897	1456 aa		23.16	■■□□□ 1.3
HDAC10-216	ENST00000489424	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	23.15	■■□□□ 1.3
HDAC10-216	ENST00000489424	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		23.15	■■□□□ 1.3
HDAC10-216	ENST00000489424	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		23.15	■■□□□ 1.3
HDAC10-216	ENST00000489424	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		23.15	■■□□□ 1.3
HDAC10-216	ENST00000489424	LGR6	Q9HBX8	967 aa		23.15	■■□□□ 1.3
HDAC10-216	ENST00000489424	FCHSD2	O94868	740 aa		23.14	■■□□□ 1.29
HDAC10-216	ENST00000489424	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		23.13	■■□□□ 1.29
HDAC10-216	ENST00000489424	MSL1	Q68DK7	614 aa		23.13	■■□□□ 1.29
HDAC10-216	ENST00000489424	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	23.12	■■□□□ 1.29
HDAC10-216	ENST00000489424	PHF14	O94880	888 aa		23.12	■■□□□ 1.29
HDAC10-216	ENST00000489424	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		23.12	■■□□□ 1.29
HDAC10-216	ENST00000489424	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	23.11	■■□□□ 1.29
HDAC10-216	ENST00000489424	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		23.11	■■□□□ 1.29
HDAC10-216	ENST00000489424	GRIN3B	O60391	1043 aa		23.1	■■□□□ 1.29
HDAC10-216	ENST00000489424	SMIM5	Q71RC9	77 aa		23.1	■■□□□ 1.29
HDAC10-216	ENST00000489424	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	23.1	■■□□□ 1.29
HDAC10-216	ENST00000489424	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		23.1	■■□□□ 1.29
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	23.09	■■□□□ 1.29
HDAC10-216	ENST00000489424	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	23.09	■■□□□ 1.29
HDAC10-216	ENST00000489424	GPR162	Q16538	588 aa		23.09	■■□□□ 1.29
HDAC10-216	ENST00000489424	RFC4	P35249	363 aa		23.08	■■□□□ 1.29
HDAC10-216	ENST00000489424	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	23.08	■■□□□ 1.29
HDAC10-216	ENST00000489424	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		23.08	■■□□□ 1.29
HDAC10-216	ENST00000489424	UTRN	P46939	3433 aa		23.07	■■□□□ 1.28
HDAC10-216	ENST00000489424	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		23.07	■■□□□ 1.28
HDAC10-216	ENST00000489424	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	23.07	■■□□□ 1.28
HDAC10-216	ENST00000489424	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	23.07	■■□□□ 1.28
HDAC10-216	ENST00000489424	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	23.07	■■□□□ 1.28
HDAC10-216	ENST00000489424	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	23.07	■■□□□ 1.28
HDAC10-216	ENST00000489424	TEF	Q10587	303 aa		23.06	■■□□□ 1.28
HDAC10-216	ENST00000489424	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		23.06	■■□□□ 1.28
HDAC10-216	ENST00000489424	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	23.06	■■□□□ 1.28
HDAC10-216	ENST00000489424	PRKAR2B	P31323	418 aa		23.05	■■□□□ 1.28
HDAC10-216	ENST00000489424	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	23.05	■■□□□ 1.28
HDAC10-216	ENST00000489424	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	23.04	■■□□□ 1.28
HDAC10-216	ENST00000489424	GYS1	P13807	737 aa		23.04	■■□□□ 1.28
HDAC10-216	ENST00000489424	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	23.04	■■□□□ 1.28
HDAC10-216	ENST00000489424	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	23.04	■■□□□ 1.28
HDAC10-216	ENST00000489424	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		23.04	■■□□□ 1.28
HDAC10-216	ENST00000489424	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	23.03	■■□□□ 1.28
HDAC10-216	ENST00000489424	RALBP1	Q15311	655 aa		23.03	■■□□□ 1.28
HDAC10-216	ENST00000489424	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		23.03	■■□□□ 1.28
HDAC10-216	ENST00000489424	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		23.03	■■□□□ 1.28
HDAC10-216	ENST00000489424	MMP10	P09238	476 aa		23.02	■■□□□ 1.28
HDAC10-216	ENST00000489424	TGFB2	P61812	414 aa		23.02	■■□□□ 1.28
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF790	Q6PG37	636 aa		23.02	■■□□□ 1.28
HDAC10-216	ENST00000489424	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	23.02	■■□□□ 1.28
HDAC10-216	ENST00000489424	STARD3NL	O95772	234 aa		23.01	■■□□□ 1.27
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC39A6	Q13433	755 aa		23.01	■■□□□ 1.27
HDAC10-216	ENST00000489424	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		23.01	■■□□□ 1.27
HDAC10-216	ENST00000489424	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	23	■■□□□ 1.27
HDAC10-216	ENST00000489424	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		22.99	■■□□□ 1.27
HDAC10-216	ENST00000489424	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	22.99	■■□□□ 1.27
HDAC10-216	ENST00000489424	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	22.99	■■□□□ 1.27
HDAC10-216	ENST00000489424	NEFM	P07197	916 aa		22.98	■■□□□ 1.27
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	22.98	■■□□□ 1.27
HDAC10-216	ENST00000489424	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	22.98	■■□□□ 1.27
HDAC10-216	ENST00000489424	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		22.98	■■□□□ 1.27
HDAC10-216	ENST00000489424	ZPR1	O75312	459 aa		22.96	■■□□□ 1.27
HDAC10-216	ENST00000489424	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		22.96	■■□□□ 1.27
HDAC10-216	ENST00000489424	NARF	Q9UHQ1	456 aa		22.96	■■□□□ 1.27
HDAC10-216	ENST00000489424	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		22.96	■■□□□ 1.27
HDAC10-216	ENST00000489424	TJP1	Q07157	1748 aa		22.96	■■□□□ 1.27
HDAC10-216	ENST00000489424	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	22.95	■■□□□ 1.26
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	22.95	■■□□□ 1.26
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A087WZG4	1122 aa		22.94	■■□□□ 1.26
HDAC10-216	ENST00000489424	TM4SF1	P30408	202 aa		22.94	■■□□□ 1.26

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.6 ms