RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488380.5

NISCH-212, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 3,168 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-212ENST00000488380 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa16.46■□□□□ 0.23
NISCH-212ENST00000488380 MCM5P33992 734 aa16.45■□□□□ 0.22
NISCH-212ENST00000488380 TPRNQ4KMQ1 711 aa16.45■□□□□ 0.22
NISCH-212ENST00000488380 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
NISCH-212ENST00000488380 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
NISCH-212ENST00000488380 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa16.45■□□□□ 0.22
NISCH-212ENST00000488380 MAP3K19Q56UN5 1328 aa16.45■□□□□ 0.22
NISCH-212ENST00000488380 CDC45O75419 566 aa16.45■□□□□ 0.22
NISCH-212ENST00000488380 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
NISCH-212ENST00000488380 RGS12O14924 1447 aa16.45■□□□□ 0.22
NISCH-212ENST00000488380 CHL1O00533 1208 aa16.44■□□□□ 0.22
NISCH-212ENST00000488380 KIAA2012Q0VF49 1180 aa16.44■□□□□ 0.22
NISCH-212ENST00000488380 RABEP1Q15276 862 aa16.44■□□□□ 0.22
NISCH-212ENST00000488380 TMEM63CQ9P1W3 806 aa16.44■□□□□ 0.22
NISCH-212ENST00000488380 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
NISCH-212ENST00000488380 FAM177BA6PVY3 158 aa16.44■□□□□ 0.22
NISCH-212ENST00000488380 NUTM2GQ5VZR2 741 aa16.44■□□□□ 0.22
NISCH-212ENST00000488380 APBB1O00213 710 aa16.44■□□□□ 0.22
NISCH-212ENST00000488380 LRSAM1Q6UWE0 723 aa16.44■□□□□ 0.22
NISCH-212ENST00000488380 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
NISCH-212ENST00000488380 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
NISCH-212ENST00000488380 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
NISCH-212ENST00000488380 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
NISCH-212ENST00000488380 AK9Q5TCS8 1911 aa16.43■□□□□ 0.22
NISCH-212ENST00000488380 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
NISCH-212ENST00000488380 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
NISCH-212ENST00000488380 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
NISCH-212ENST00000488380 MSH6P52701 1360 aa16.42■□□□□ 0.22
NISCH-212ENST00000488380 NALCNQ8IZF0 1738 aa16.42■□□□□ 0.22
NISCH-212ENST00000488380 RGPD1P0DJD0 1748 aa16.41■□□□□ 0.22
NISCH-212ENST00000488380 SSH2Q76I76 1423 aa16.41■□□□□ 0.22
NISCH-212ENST00000488380 DMTNQ08495 405 aa16.41■□□□□ 0.22
NISCH-212ENST00000488380 MEIS3Q99687 375 aa16.41■□□□□ 0.22
NISCH-212ENST00000488380 USP31Q70CQ4 1352 aa16.41■□□□□ 0.22
NISCH-212ENST00000488380 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
NISCH-212ENST00000488380 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
NISCH-212ENST00000488380 G2E3Q7L622 706 aa16.4■□□□□ 0.22
NISCH-212ENST00000488380 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
NISCH-212ENST00000488380 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP16.4■□□□□ 0.22
NISCH-212ENST00000488380 CRB1P82279 1406 aa16.4■□□□□ 0.22
NISCH-212ENST00000488380 ST18O60284 1047 aa16.4■□□□□ 0.22
NISCH-212ENST00000488380 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa16.4■□□□□ 0.22
NISCH-212ENST00000488380 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
NISCH-212ENST00000488380 ATP10DQ9P241 1426 aa16.4■□□□□ 0.22
NISCH-212ENST00000488380 F6X3S4 739 aa16.4■□□□□ 0.22
NISCH-212ENST00000488380 SLC4A2P04920 1241 aa16.4■□□□□ 0.22
NISCH-212ENST00000488380 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
NISCH-212ENST00000488380 EID1Q9Y6B2 187 aa16.39■□□□□ 0.21
NISCH-212ENST00000488380 EYA1Q99502 592 aa16.39■□□□□ 0.21
NISCH-212ENST00000488380 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
NISCH-212ENST00000488380 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
NISCH-212ENST00000488380 PLCB2Q00722 1185 aa16.38■□□□□ 0.21
NISCH-212ENST00000488380 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa16.38■□□□□ 0.21
NISCH-212ENST00000488380 MYRIPQ8NFW9 859 aa16.38■□□□□ 0.21
NISCH-212ENST00000488380 DCTPP1Q9H773 170 aa16.38■□□□□ 0.21
NISCH-212ENST00000488380 CEP85Q6P2H3 762 aa16.38■□□□□ 0.21
NISCH-212ENST00000488380 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
NISCH-212ENST00000488380 SPDYE4A6NLX3 237 aa16.37■□□□□ 0.21
NISCH-212ENST00000488380 AMPHP49418 695 aa16.37■□□□□ 0.21
NISCH-212ENST00000488380 SLC4A10Q6U841 1118 aa16.37■□□□□ 0.21
NISCH-212ENST00000488380 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
NISCH-212ENST00000488380 NECTIN2Q92692 538 aa16.37■□□□□ 0.21
NISCH-212ENST00000488380 TSPY26PQ9H489 355 aa16.37■□□□□ 0.21
NISCH-212ENST00000488380 TSPYL4Q9UJ04 414 aa16.37■□□□□ 0.21
NISCH-212ENST00000488380 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
NISCH-212ENST00000488380 ANKRD44Q8N8A2 993 aa16.36■□□□□ 0.21
NISCH-212ENST00000488380 FMN2Q9NZ56 1722 aa16.36■□□□□ 0.21
NISCH-212ENST00000488380 RTL1A6NKG5 1358 aa16.36■□□□□ 0.21
NISCH-212ENST00000488380 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
NISCH-212ENST00000488380 IGSF3O75054 1194 aa16.36■□□□□ 0.21
NISCH-212ENST00000488380 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
NISCH-212ENST00000488380 DIP2AQ14689 1571 aa16.36■□□□□ 0.21
NISCH-212ENST00000488380 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
NISCH-212ENST00000488380 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
NISCH-212ENST00000488380 ZDHHC9Q9Y397 364 aa16.35■□□□□ 0.21
NISCH-212ENST00000488380 KIAA0232Q92628 1395 aa16.35■□□□□ 0.21
NISCH-212ENST00000488380 NLRP6P59044 892 aa16.35■□□□□ 0.21
NISCH-212ENST00000488380 USP26Q9BXU7 913 aa16.35■□□□□ 0.21
NISCH-212ENST00000488380 PIK3C2AO00443 1686 aa16.35■□□□□ 0.21
NISCH-212ENST00000488380 FLT4P35916 1363 aa16.35■□□□□ 0.21
NISCH-212ENST00000488380 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
NISCH-212ENST00000488380 FGD1P98174 961 aa16.34■□□□□ 0.21
NISCH-212ENST00000488380 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
NISCH-212ENST00000488380 ARHGEF10O15013 1369 aa16.34■□□□□ 0.21
NISCH-212ENST00000488380 MBD3O95983 291 aa16.34■□□□□ 0.21
NISCH-212ENST00000488380 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP16.34■□□□□ 0.21
NISCH-212ENST00000488380 KIF3AQ9Y496 699 aa16.34■□□□□ 0.21
NISCH-212ENST00000488380 SBNO1A3KN83 1393 aa16.34■□□□□ 0.21
NISCH-212ENST00000488380 KCNA6P17658 529 aa16.34■□□□□ 0.21
NISCH-212ENST00000488380 CASC1Q6TDU7 716 aa16.34■□□□□ 0.21
NISCH-212ENST00000488380 KIF24Q5T7B8 1368 aa16.33■□□□□ 0.21
NISCH-212ENST00000488380 TTC22Q5TAA0 569 aa16.33■□□□□ 0.21
NISCH-212ENST00000488380 TTC21AQ8NDW8 1320 aa16.33■□□□□ 0.2
NISCH-212ENST00000488380 ZNF710Q8N1W2 664 aa16.33■□□□□ 0.2
NISCH-212ENST00000488380 GDPD2Q9HCC8 539 aa16.33■□□□□ 0.2
NISCH-212ENST00000488380 TBX22Q9Y458 520 aa16.33■□□□□ 0.2
NISCH-212ENST00000488380 USHBP1Q8N6Y0 703 aa16.32■□□□□ 0.2
NISCH-212ENST00000488380 USP25Q9UHP3 1055 aa16.32■□□□□ 0.2
NISCH-212ENST00000488380 ATP2B3Q16720 1220 aa16.32■□□□□ 0.2
NISCH-212ENST00000488380 PRIMPOLQ96LW4 560 aa16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.6 ms