RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482482.1

TBRG4-211, Transcript of transforming growth factor beta regulator 4, humanhuman

TSL 5

Gene TBRG4, Length 486 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4-211ENST00000482482 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
TBRG4-211ENST00000482482 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP22.26■■□□□ 1.15
TBRG4-211ENST00000482482 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
TBRG4-211ENST00000482482 FLAD1Q8NFF5 587 aa22.26■■□□□ 1.15
TBRG4-211ENST00000482482 LGR6Q9HBX8 967 aa22.26■■□□□ 1.15
TBRG4-211ENST00000482482 GAS2L2Q8NHY3 880 aa22.25■■□□□ 1.15
TBRG4-211ENST00000482482 SGIP1Q9BQI5 828 aa22.25■■□□□ 1.15
TBRG4-211ENST00000482482 ITPK1Q13572 414 aa22.24■■□□□ 1.15
TBRG4-211ENST00000482482 LINC00116Q8NCU8 138 aa22.24■■□□□ 1.15
TBRG4-211ENST00000482482 SLC52A2Q9HAB3 445 aa22.24■■□□□ 1.15
TBRG4-211ENST00000482482 PRKAR2BP31323 418 aa22.23■■□□□ 1.15
TBRG4-211ENST00000482482 RSPH6AQ9H0K4 717 aa22.23■■□□□ 1.15
TBRG4-211ENST00000482482 FCHSD2O94868 740 aa22.22■■□□□ 1.15
TBRG4-211ENST00000482482 POLD1P28340 1107 aa22.22■■□□□ 1.15
TBRG4-211ENST00000482482 RALBP1Q15311 655 aa22.22■■□□□ 1.15
TBRG4-211ENST00000482482 ARXQ96QS3 562 aa22.22■■□□□ 1.15
TBRG4-211ENST00000482482 C5P01031 1676 aa22.22■■□□□ 1.15
TBRG4-211ENST00000482482 SLC4A9Q96Q91 983 aa22.21■■□□□ 1.15
TBRG4-211ENST00000482482 QSER1Q2KHR3 1735 aa22.2■■□□□ 1.14
TBRG4-211ENST00000482482 GNAT3A8MTJ3 354 aa22.2■■□□□ 1.14
TBRG4-211ENST00000482482 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
TBRG4-211ENST00000482482 PHACTR3Q96KR7 559 aa22.2■■□□□ 1.14
TBRG4-211ENST00000482482 PHF14O94880 888 aa22.19■■□□□ 1.14
TBRG4-211ENST00000482482 SSFA2P28290 1259 aa22.19■■□□□ 1.14
TBRG4-211ENST00000482482 C4BP0C0L5 1744 aa22.19■■□□□ 1.14
TBRG4-211ENST00000482482 MAP3K5Q99683 1374 aa22.18■■□□□ 1.14
TBRG4-211ENST00000482482 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
TBRG4-211ENST00000482482 GNPATO15228 680 aa22.18■■□□□ 1.14
TBRG4-211ENST00000482482 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
TBRG4-211ENST00000482482 TAF1LQ8IZX4 1826 aa22.16■■□□□ 1.14
TBRG4-211ENST00000482482 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
TBRG4-211ENST00000482482 SMIM5Q71RC9 77 aa22.16■■□□□ 1.14
TBRG4-211ENST00000482482 AMIGO3Q86WK7 504 aa22.16■■□□□ 1.14
TBRG4-211ENST00000482482 IL17REQ8NFR9 667 aa22.16■■□□□ 1.14
TBRG4-211ENST00000482482 SYT17Q9BSW7 474 aa22.16■■□□□ 1.14
TBRG4-211ENST00000482482 DCAF8L1A6NGE4 600 aa22.15■■□□□ 1.14
TBRG4-211ENST00000482482 TEFQ10587 303 aa22.15■■□□□ 1.14
TBRG4-211ENST00000482482 SLC39A6Q13433 755 aa22.15■■□□□ 1.14
TBRG4-211ENST00000482482 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
TBRG4-211ENST00000482482 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa22.15■■□□□ 1.14
TBRG4-211ENST00000482482 SCN11AQ9UI33 1791 aa22.15■■□□□ 1.14
TBRG4-211ENST00000482482 NEFMP07197 916 aa22.14■■□□□ 1.13
TBRG4-211ENST00000482482 MSL1Q68DK7 614 aa22.14■■□□□ 1.13
TBRG4-211ENST00000482482 MRC1P22897 1456 aa22.14■■□□□ 1.13
TBRG4-211ENST00000482482 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa22.13■■□□□ 1.13
TBRG4-211ENST00000482482 TRAPPC3LQ5T215 181 aa22.13■■□□□ 1.13
TBRG4-211ENST00000482482 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
TBRG4-211ENST00000482482 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
TBRG4-211ENST00000482482 RPS6KA4O75676 772 aa22.11■■□□□ 1.13
TBRG4-211ENST00000482482 TTC5Q8N0Z6 440 aa22.11■■□□□ 1.13
TBRG4-211ENST00000482482 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
TBRG4-211ENST00000482482 ZNF831Q5JPB2 1677 aa22.11■■□□□ 1.13
TBRG4-211ENST00000482482 KLHL34Q8N239 644 aa22.1■■□□□ 1.13
TBRG4-211ENST00000482482 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa22.1■■□□□ 1.13
TBRG4-211ENST00000482482 ADRA2BP18089 450 aa22.09■■□□□ 1.13
TBRG4-211ENST00000482482 CRKLP46109 303 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
TBRG4-211ENST00000482482 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
TBRG4-211ENST00000482482 DNAJC10Q8IXB1 793 aa22.08■■□□□ 1.13
TBRG4-211ENST00000482482 VSIG10Q8N0Z9 540 aa22.08■■□□□ 1.13
TBRG4-211ENST00000482482 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
TBRG4-211ENST00000482482 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa22.08■■□□□ 1.12
TBRG4-211ENST00000482482 ZNF790Q6PG37 636 aa22.07■■□□□ 1.12
TBRG4-211ENST00000482482 PLEKHF1Q96S99 279 aa22.07■■□□□ 1.12
TBRG4-211ENST00000482482 UBR3Q6ZT12 1888 aa22.07■■□□□ 1.12
TBRG4-211ENST00000482482 RFC4P35249 363 aa22.06■■□□□ 1.12
TBRG4-211ENST00000482482 MCM10Q7L590 875 aa22.06■■□□□ 1.12
TBRG4-211ENST00000482482 COL24A1Q17RW2 1714 aa22.06■■□□□ 1.12
TBRG4-211ENST00000482482 BTBD11A6QL63 1104 aa22.05■■□□□ 1.12
TBRG4-211ENST00000482482 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
TBRG4-211ENST00000482482 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
TBRG4-211ENST00000482482 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
TBRG4-211ENST00000482482 CCDC87Q9NVE4 849 aa22.04■■□□□ 1.12
TBRG4-211ENST00000482482 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa22.04■■□□□ 1.12
TBRG4-211ENST00000482482 KCPQ6ZWJ8 1503 aa22.03■■□□□ 1.12
TBRG4-211ENST00000482482 DCTN1Q14203 1278 aa22.03■■□□□ 1.12
TBRG4-211ENST00000482482 NLGN1Q8N2Q7 840 aa22.03■■□□□ 1.12
TBRG4-211ENST00000482482 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
TBRG4-211ENST00000482482 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
TBRG4-211ENST00000482482 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
TBRG4-211ENST00000482482 STARD3NLO95772 234 aa22.01■■□□□ 1.11
TBRG4-211ENST00000482482 NFE2L2Q16236 605 aa22.01■■□□□ 1.11
TBRG4-211ENST00000482482 FMNL2Q96PY5 1086 aa22.01■■□□□ 1.11
TBRG4-211ENST00000482482 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
TBRG4-211ENST00000482482 CD2APQ9Y5K6 639 aa22■■□□□ 1.11
TBRG4-211ENST00000482482 TJP1Q07157 1748 aa22■■□□□ 1.11
TBRG4-211ENST00000482482 HEG1Q9ULI3 1381 aa21.99■■□□□ 1.11
TBRG4-211ENST00000482482 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
TBRG4-211ENST00000482482 GYS1P13807 737 aa21.99■■□□□ 1.11
TBRG4-211ENST00000482482 NLGN2Q8NFZ4 835 aa21.99■■□□□ 1.11
TBRG4-211ENST00000482482 KCNQ3O43525 872 aa21.98■■□□□ 1.11
TBRG4-211ENST00000482482 MMP10P09238 476 aa21.98■■□□□ 1.11
TBRG4-211ENST00000482482 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
TBRG4-211ENST00000482482 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa21.98■■□□□ 1.11
TBRG4-211ENST00000482482 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
TBRG4-211ENST00000482482 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP21.97■■□□□ 1.11
TBRG4-211ENST00000482482 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
TBRG4-211ENST00000482482 ZPR1O75312 459 aa21.96■■□□□ 1.11
TBRG4-211ENST00000482482 CANXP27824 592 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
TBRG4-211ENST00000482482 GPR162Q16538 588 aa21.96■■□□□ 1.11
TBRG4-211ENST00000482482 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
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